Genetic diversity in table grapes based on RAPD and microsatellite markers

Abstract

The objective of this work was to analyze the genetic diversity of 47 table grape accessions, from the grapevine germplasm bank of Embrapa Semiárido, using 20 RAPD and seven microsatellite markers. Genetic distances between pairs of accessions were obtained based on Jaccard's similarity index for RAPD data and on the arithmetic complement of the weighted index for microsatellite data. The groups were formed according to the Tocher's cluster analysis and to the unweighted pair‑group method with arithmetic mean (UPGMA). The microsatellite markers were more efficient than the RAPD ones in the identification of genetic relationships. Information on the genetic distance, based on molecular characteristics and coupled with the cultivar agronomic performance, allowed for the recommendation of parents for crossings, in order to obtain superior hybrids in segregating populations for the table grape breeding program of Embrapa Semiárido.

O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética de 47 acessos de uvas de mesa, procedentes do Banco de Germoplasma de Videira da Embrapa Semiárido, por meio de 20 marcadores moleculares RAPD e sete marcadores microsatélites. Distâncias genéticas entre pares de acessos foram obtidas com base no índice de similaridade de Jaccard para marcadores RAPD e no complemento aritmético do índice ponderado para dados de microsatélites. Os grupos foram formados de acordo com a análise de agrupamento de Tocher e com o método de agrupamento não ponderado (UPGMA). Os marcadores microsatélites foram mais eficientes do que os RAPD na identificação das relações de parentesco. As informações de distância genética, baseadas em características moleculares e aliadas ao desempenho agronômico das cultivares, permitiram a recomendação de parentais para cruzamentos, para a obtenção de híbridos superiores nas populações segregantes do programa de melhoramento de videira da Embrapa Semiárido.