Genética e Melhoramento
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Item Alternativas para avaliação genética na raça gir leiteiro(Universidade Federal de Viçosa, 2009-11-20) Reis Filho, João Cruz; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Verneque, Rui da Silva; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4789462T1; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4706265D6; Toral, Fábio Luiz Buranelo; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4764395T3; Vercesi Filho, Aníbal Eugênio; http://lattes.cnpq.br/1900845053070031Os arquivos de pedigree e de produção de leite da raça Gir provenientes do Programa Nacional de Melhoramento do Gir Leiteiro (PNMGL), conduzido pela Embrapa Gado de Leite em parceria com a Associação Brasileira dos Criadores de Gir Leiteiro (ABCGIL), foram utilizados na pesquisa de alternativas para avaliação genética da produção de leite na raça e fornecimento de subsídios para o desenvolvimento do PNMGL. Foram realizados estudos comparativos das avaliações genéticas para a produção de leite acumulada em 305 dias de lactação (PL305), por meio de modelos de regressão aleatória e de repetibilidade - este último considerado o método tradicional - e estudos com a produção de leite no dia do controle (PLDC), por meio de modelos autorregressivo e de repetibilidade, que também foram comparados com o método tradicional. Também, estudaram-se a possibilidade de incorporação de lactações com causas de secagem não convencionais (morte ou separação do bezerro, doença, morte ou venda da vaca e retirada da vaca do controle leiteiro) e o relacionamento genético dos touros provados com a população, visando fornecer subsídios para a escolha de touros jovens para o teste de progênie. Na edição do arquivo de dados, somente as trêsprimeiras lactações foram mantidas, eliminando-se também lactações cuja idade da vaca ao parto estivesse fora do intervalo de 24 e 66, 36 e 84, 48 e 102 meses para primeira, segunda e terceira ordens de parto, respectivamente. Os controles cujas produções estiveram abaixo ou acima de 3,5 desvios-padrão da média no dia do controle foram eliminados. Lactações com três ou menos controles também foram excluídas. Da mesma forma, observou-se o número mínimo de três lactações para cada classe de efeito fixo. Os efeitos fixos incluídos nos modelos variaram conforme as análises, podendo conter rebanho-ano do parto, mês do parto ou mês e ano do controle, ordem de parto ou classe de dia do controle aninhado em ordem de parto, número de ordenhas diárias e condições de manejo. No caso das análises com PLDC, os controles foram agrupados em 31 classes de dias em lactação (por ordem de parto), com a primeira classe compreendendo as produções aferidas entre o 6º e o 10º dia, a segunda do 11º ao 20º dia e, assim, sucessivamente com intervalos de 10 dias, em que a última classe continha somente as produções aferidas entre o 301º e o 305º dia de lactação. Em média, cada vaca apresentou oito controles por lactação, independentemente da ordem de parto. À exceção do arquivo com as causas de secagem não convencionais, que utilizou 140.369 controles de 17.733 lactações de 10.900 vacas, os demais arquivos de análises utilizaram a PL305 de 15.065 lactações ou respectivos 125.191 controles, provenientes de 9.242 vacas. Os partos de vacas da raça Gir submetidas a duas ou três ordenhas diárias ocorreram entre 1983 e 2009, em três diferentes níveis de manejo: o extensivo (produção a pasto), o semiextensivo (produção a pasto com suplementação concentrada) e o intensivo (animais confinados e, ou, com uso de substâncias galactogênicas). Um algoritmo recursivo foi utilizado para reduzir o arquivo de pedigree de 50.371 para 17.483 animais considerados informativos, partindo-se do arquivo de produção de 10.900 vacas e buscando todos os seus ascendentes que estivessem ligados a pelo menos dois animais na base de dados. As avaliações genéticas foram feitas usando-se os programas dos sistemas MTDFREML (modelos de repetibilidade), REMLF90 (modelo de regressão aleatória) e rotinas do MATLAB (modelo autorregressivo). Utilizando as PL305 das três primeiras lactações, o modelo de regressão aleatória pode ser utilizado como alternativa para incrementar a precisão das avaliações genéticas, proporcionando maiores estimativas de herdabilidade (de 0,26 a 0,28), méritos genéticos preditos semelhantes (correlações acima de 0,97) e alta coincidência entre os animais selecionados (acima de 92%), em comparação com o modelo tradicional de repetibilidade. Utilizando a produção de leite no dia docontrole das três primeiras lactações, o modelo autorregressivo proporcionou menores variâncias residuais, maior variância genética aditiva e maiores estimativas de herdabilidades (de 0,26 a 0,32), além de méritos genéticos preditos com maior acurácia, sendo alternativa recomendada para a avaliação genética do Gir Leiteiro, em comparação com os modelos de repetibilidade, que utilizaram tanto a PLDC quanto a PL305, cujas estimativas de herdabilidade foram 0,18 e 0,24, respectivamente. Nesse sentido, o emprego do modelo autorregressivo, por analisar os registros de produção de leite no dia do controle, permite melhor aproveitamento dos dados e a inclusão de lactações tradicionalmente não utilizadas nas avaliações genéticas, o que pode incrementar a acurácia dos méritos genéticos preditos (em geral, média de 5%) sem, contudo, gerar grandes alterações na classificação dos animais avaliados (no arquivo completo, correlações amostrais e de ordem acima de 95%). Por fim, a estimativa do coeficiente de endogamia médio para a população ativa do Gir Leiteiro foi de 1,04%, indicando a tendência de os animais mais endogâmicos não permanecerem nos rebanhos. A utilização do coeficiente de relação médio dos touros com a população pode prevenir o incremento da endogamia na raça Gir, por auxiliar na escolha de reprodutores candidatos ao teste de progênie, oriundos de linhagens menos representadas no PNMGL.Item Association of candidate gene expression with intramuscular fat content in the porcine Longissimus dorsi muscle(Universidade Federal de Viçosa, 2009-07-09) Serão, Nicola Vergara Lopes; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Braccini Neto, José; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4721855E6; Guimarães, Simone Eliza Facioni; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2; http://lattes.cnpq.br/5594073727486210; Peixoto, Jane de Oliveira; http://lattes.cnpq.br/2693613497106612; Paulino, Pedro Veiga Rodrigues; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760235Y6Este trabalho foi realizado com o objetivo de promover informação sobre o padrão de expressão de genes candidatos, por meio da reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR), e correlacioná-los com o conteúdo de gordura intramuscular (GIM) em suínos de ambos os sexos e dos grupos genéticos Piau, Comercial e Cruzado, abatidos aos 30, 60, 90 e 120 kg. Amostras do músculo longissimus dorsi foram retiradas para medição dos níveis de GIM e extração de RNA. Os genes estudados foram ATN1, EEF1A2, FABP3, LDLR, MGP, OBSCN, PDHB, RYR1 e TRDN. Níveis superiores de GIM (P<0.05) foram observados para suínos da raça Piau e Cruzados aos 120 kg de peso ao abate, indicando que alelos provenientes de animais Piau têm papel importante na deposição de gordura. Independentemente do grupo genético, expressões dos genes ATN1, FABP3 e PDHB foram influenciadas (P<0.05) pelo peso ao abate. PDHB sofreu efeito do grupo genético (P<0.05), onde animais Piau e Cruzados mostraram maiores valores que Comerciais (P<0.05). No gene EEF1A2, o grupo genético foi significativo (P<0.05) e sua expressão foi maior em suínos Cruzados (P<0.05). Os Níveis de expressão dos genes LDLR, MGP, OBSCN, RYR1 e TRDN foram afetados pela interação de grupo genético e peso ao abate (P<0.05). Entre grupos genéticos, foi possível determinar equações de predição (P<0.05) dos níveis de expressão dos genes LDLR, OBSCN, RYR1 e TRDN para animais da raça Piau. Além disso, Piau foi o único grupo genético que mostrou um padrão de expressão para o gene LDLR. O Peso ao abate afetou a expressão do gene MGP (P<0.05) em suínos Comerciais e Cruzados. Também foi possível estabelecer um padrão de expressão para os genes OBSCN, RYR1 e TRDN em animais Cruzados. Além disso, esses três genes foram influenciados pelo grupo genético dentro de peso ao abate (P<0.05). Animais Comerciais apresentaram maiores valores de expressão de OBSCN (P<0.05) aos 30 e 90 kg de peso ao abate, mas os níveis de expressão em suínos Piau não foram diferente (P>0.05) daqueles aos 90 kg. Para o gene RYR1, foi observado maiores níveis de expressão (P<0.05) em suínos aos 30, 90 e 120 kg, mas não houve significância (P>0.05) entre as médias de expressão entre suínos Piau e Comercial aos 30 kg. Animais Piau apresentarem maiores níveis de expressão de TRDN que suínos Comerciais (P<0.05) aos 60 kg de peso ao abate. Usando valores preditos, os níveis de expressão de todos os genes foram correlacionados com GIM, a partir de dados de todos os animais e apenas de suínos Piau. Usando todos os dados, os níveis de expressão dos genes FABP3, LDLR, TRDN, OBSCN, RYR1 e PDHB foram positivamente correlacionados (P<0.05) com GIM, enquanto que o gene EEF1A2 teve correlação negativa (P<0.05). Com os dados dos animais Piau, o gene MGP teve correlação negativa (P<0.05) com GIM e os genes LDLR, FABP3, TRDN, RYR1 e OBSCN positiva (P<0.05). Uma equação de predição de conteúdo de GIM, para todos os grupos genéticos, sexos e pesos ao abate, foi modelada usando valores ajustados de todos os genes. O coeficiente de determinação (R2) associado à equação foi de 90,29%, onde os genes ATN1, EEF1A2, MGP e PDHB atuaram diminuindo os níveis de GIM e os genes LDLR, OBSCN e TRDN aumentando a deposição de gordura no músculo longissimus dorsi. O maior potencial para deposição de GIM observado em suínos Piau indica que esta raça deve carregar genes valiosos que determinam a deposição de lipídeos no músculo. Embora alguns genes foram correlacionados com GIM e incluídos na equação de predição, o gene LDLR mostrou ter um papel importante na determinação dos níveis de GIM, devido aos seus alto valores de correlação e coeficiente de regressão, e função biológica na captação de lipídeos para dentro da célula. Além disso, mais estudos são necessários para se atribuir a este gene como gene candidato para deposição de GIM no músculo longissimus dorsi em suínos.Item Avaliação da produção de leite em cabras da raça Saanen utilizando modelos de regressão aleatória(Universidade Federal de Viçosa, 2008-02-15) Menezes, Gilberto Romeiro de Oliveira; Rodrigues, Marcelo Teixeira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788161Y5; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/9971427968154736; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Sarmento, José Lindenberg Rocha; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761815E8; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8Utilizaram-se 10.238 registros semanais de produção de leite provenientes de 388 primeiras lactações de cabras da raça Saanen na avaliação da persistência da lactação sob modelo de regressão aleatória. Primeiramente, foram comparados cinco modelos (W035, W05, W0565, W068 e W10) gerados a partir de modificações da função de Wilmink, assumindo-se homogeneidade de variância residual ao longo da lactação. No modelo W05, o valor -0,05 foi mantido, enquanto nos modelos W035, W0565, W068 e W10 foram usados os valores -0,035, -0,0565, -0,068 e -0,10, respectivamente, em substituição ao valor -0,05. Escolhido o modelo, foram avaliadas seis estruturas para a variância residual: homogeneidade, duas classes, três classes, quatro classes, cinco classes e seis classes ao longo da lactação. Posteriormente, foram avaliadas seis diferentes medidas da persistência da lactação, que são adaptações de medidas utilizadas em bovinos de leite, obtidas por substituir, nas fórmulas, os valores de referência de bovinos pelos de caprinos. Os critérios AIC, BIC, ln L e teste de razão de verossimilhança (modelos aninhados) foram usados na avaliação dos modelos. O modelo W035 apresentou o melhor ajuste dentre os avaliados. Com relação à variância residual, a estrutura com seis classes ao longo da lactação foi a mais indicada pelos critérios utilizados. Por apresentar menor correlação genética com produção de leite até 268 dias (0,14), a medida de persistência (PS4) obtida pelo somatório dos valores genéticos, no período do 41o ao 240o dia de lactação, como desvios da produção aos 40 dias de lactação deve ser indicada para avaliações genéticas. Em razão da baixa herdabilidade desta medida (0,03), pequenas respostas à seleção são esperadas neste rebanho.Item Avaliação de biotecnologias reprodutivas em programas de melhoramento utilizando simulação de dados(Universidade Federal de Viçosa, 2008-02-27) Souza, Gustavo Henrique de; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P6; Freitas, Marcelo Silva de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4705090H9; Bueno, Rachel Santos; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4769835U5; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8O objetivo nesse estudo foi testar a superioridade da aplicação da biotecnologia de múltipla ovulação e transferência de embrião (MOET) no melhoramento genético de bovinos, em um intervalo de tempo definido, bem como testar a vantagem de aumentar o número de descendentes por acasalamento com conseqüente aumento na intensidade de seleção de reprodutores. Para isto, utilizou-se o programa de simulação GENESYS. Para a comparação da eficiência da utilização de transferência de embrião, foram consideradas duas situações. A situação clássica ou tradicional (N0) em que uma vaca é acasalada com um touro gerando um descendente por ano, sendo necessário um intervalo de 7 anos para o nascimento de cinco filhos (primeiro parto aos 3 anos e intervalo de partos de 12 meses). Uma outra situação seria a utilização das técnicas de múltipla ovulação e transferência de embrião (MOET) em que o intervalo para uma vaca deixar no mínimo 5 descendentes seria de apenas 3 anos. Assim, ao final de 42 anos, o número de gerações de acasalamento e de seleção seria 6 e 14 considerando a situação clássica e MOET, respectivamente. Também foi avaliada a possibilidade de aumentar o número de descendentes por acasalamento de reprodutores utilizando MOET (N1, N2, N3, N4 para 5, 10, 15 e 25 descendentes, respectivamente) com conseqüente redução no número de vacas selecionadas. Comparando a eficiência da aplicação da biotecnologia da reprodução com a utilização da múltipla ovulação e transferência de embrião (MOET) em relação ao método tradicional considerando o mesmo número de descendentes, observa-se ao final de 42 anos que a aplicação da biotecnologia da reprodução resultou em um valor fenotípico médio 27,05% superior ao método tradicional (305,47±5,84 versus 240,43±4,67) com um ganho genético anual com taxa 90,63% maior (3,26±0,14 versus 1,71±0,11) em relação ao método tradicional. Os valores fenotípicos médios foram de 305,47±5,84 para N1; de 313,22±4,62 para N2; de 316,14±4,03 para N3; e de 313,44±2,80 para N4. Observa-se que com aumento do número de descendentes por casal de reprodutores (N1 a N4) houve um aumento do valor fenotípico médio aos 42 anos de seleção até as populações N3. A endogamia média considerando o método tradicional foi de 0,06±0,03, e com a aplicação da técnica de múltipla ovulação e transferência de embrião o valor da endogamia média foi de 0,18±0,08. Assim, a aplicação da transferência de embrião foi responsável por um aumento de 200,79% na endogamia ao longo de 42 anos. A aplicação da transferência de embrião resultou em um valor da variância genética aditiva média 59,63% inferior ao método tradicional (51,23±12,39 versus 126,91±12,60), com uma redução no valor da variância genética aditiva anual média com taxa 108,21% maior (3,47±0,36 versus 1,66±0,30) em relação ao método tradicional. O uso da múltipla ovulação e transferência de embrião aumentou o valor fenotípico e a endogamia com redução na variância genética aditiva. Dependendo do tamanho da população, poderia ser utilizado o MOET com 5 a 10 descendentes por casal de reprodutores.Item Avaliação de diferentes níveis de significância na identificação e caracterização de marcadores moleculares no melhoramento genômico(Universidade Federal de Viçosa, 2007-03-06) Jangarelli, Marcelo; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; http://lattes.cnpq.br/3839549418171209; Salaro, Ana Lúcia; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767878T2; Cecon, Paulo Roberto; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788114T5; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8A era genômica veio para transformar a ciência como um todo. Objetivou-se com esse trabalho avaliar diferentes níveis de significância na identificação de marcadores moleculares relacionados com características quantitativas de baixa, média e alta herdabilidade (h2) de interesse no melhoramento genético. Uma comparação entre os níveis de significância de 1%, 5%, 10% e 20% foi realizada por meio de um sistema computacional de simulação genética (Genesys), utilizado para a simulação de três genomas, onde cada qual era constituído de uma única característica de baixa, média ou alta h2, respectivamente. A partir de cada um dos genomas, simulou-se uma população base de 1000 animais (500 machos e 500 fêmeas). Em seguida, foi obtida uma população inicial para cada uma das populações base, totalizando três populações iniciais com 1000 animais cada (10 machos, 10 fêmeas/macho e 10 filhos/fêmea/macho). Após a obtenção desta população, iniciou-se o processo de avaliação dos quatro níveis de significância considerados, utilizando a seleção assistida por marcadores (MAS), onde os marcadores eram identificados por uma análise de regressão linear admitindo-se um nível mínimo de significância para a análise. Um total de quatro processos de seleção a partir da população inicial, de acordo com a significância adotada, foi conduzido por 20 gerações consecutivas, repetindo-se cada qual por 10 vezes para minimizar os efeitos da oscilação genética. A análise da diferença dos quatro níveis de significância foi realizada individualmente para cada um dos três caracteres através do ganho fenotípico médio, buscando, além de verificar a existência de distinção nos ganhos, se esta diferença também se apresenta simultaneamente nas características de baixa, média e alta herdabilidade. Para complementar e melhor esclarecer os resultados fenotípicos obtidos, outros parâmetros genéticos foram considerados, tais como o coeficiente de endogamia, o número de marcadores usados na seleção, o número de marcadores fixados, a fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e o limite da seleção. Os resultados observados indicaram superioridade dos níveis de significância de maior magnitude (10% e 20%) em relação aos de menores valores (1% e 5%), quanto aos ganhos fenotípicos obtidos após a seleção assistida por marcadores moleculares além de benefícios nos parâmetros genéticos (menor coeficiente endogâmico; maior número de marcadores utilizados; menor fixação de marcadores; menor porcentagem de alelos desfavoráveis fixados; e menores limites de seleção) para todas as três características, embora de forma mais expressiva para o caráter de baixa herdabilidade e menos para o de alta h2. Assim, mesmo que os níveis menores (1% e 5%) apresentem uma maior precisão na detecção de marcadores - QTLs (quantitative trait loci), eles deixam a desejar no que diz respeito às melhorias genéticas, resultando em ganhos fenotípicos e genéticos inferiores, fazendo com que a escolha de uma determinada significância estatística seja aceitável de acordo com o objetivo e a interdisciplinaridade da pesquisa em questão. É notório a relevância de associações estatísticas na identificação de marcadores ligados a QTLs e, consequentemente, na otimização de programas de melhoramento genômico.Item Avaliação do crescimento de codornas de corte utilizando modelos de regressão aleatória(Universidade Federal de Viçosa, 2008-02-21) Bonafé, Cristina Moreira; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/2678310373676450; Silva, Martinho de Almeida e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783587T3; Sarmento, José Lindenberg Rocha; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761815E8Os dados utilizados neste estudo são provenientes de 26835 e 27447 observações, de 3909 e 4040 codornas de corte das linhagens UFV-1 e UFV-2, respectivamente, pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético de Aves da Universidade Federal de Viçosa. A característica peso corporal foi avaliada nas duas linhagens, aos 1, 7, 14, 21, 28, 35 e 42 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória. A modelagem da variância residual foi avaliada primeiramente por meio de classes de idades, agrupadas como se seguem: CL1: homogênea; CL2: 1 e 7-42 dias; CL3: 1, 7 e 14-42 dias; CL4: 1, 7, 14 e 21-42 dias; CL5: 1, 7, 14, 21 e 28-42 dias; CL6: 1, 7, 14, 21, 28 e 35-42 dias; CL7: 1, 7, 14, 21, 28, 35 e 42 dias de idade e, posteriormente, as ordens de ajuste das funções polinomiais de Legendre, aplicadas aos modelos de regressão aleatória, foram gradualmente aumentadas (ordens variando de 3 a 6), visando determinar a ordem mínima de cada efeito aleatório, necessária para descrever as estruturas de (co)variâncias em função do tempo. Comparando as modelagens do resíduo por meio de classes, observaram-se aumentos no Loge L, significativos (P<0,01) pelo teste da razão de verossimilhança (LRT), com o aumento do número de classes heterogêneas (CL7). De acordo com todos os critérios utilizados para avaliar a qualidade de ajuste, o modelo considerando homogeneidade (CL1) de variâncias residuais mostrou-se inadequado, assim como o modelo de análise unicaracterística (UNI). As estimavas de variâncias, herdabilidades e correlações foram influenciadas pela modelagem da variância residual e pelo ajuste da função polinomial. A utilização de uma função polinomial de Legendre com as ordens 6 para efeito genético aditivo direto e 5 para efeito permanente de animal, para a linhagem UFV-1 e 6 para ambos efeitos aleatórios para a linhagem UFV-2, devem ser utilizados na avaliação genética da curva de crescimento dessas codornas. Portanto, a utilização de heterogeneidade de variância residual e a ordem de ajuste adequada a cada efeito aleatório para modelar as variâncias associadas à curva de crescimento de codornas de corte se fazem necessárias.Item Avaliação genética da produção de leite e de características reprodutivas de bovinos da raça Girolando(Universidade Federal de Viçosa, 2013-05-14) Cayo, Ali William Canaza; Silva, Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da; http://lattes.cnpq.br/6353954532527478; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8; Cobuci, Jaime Araujo; http://lattes.cnpq.br/2682793411821068Os objetivos do presente trabalho foram: i) avaliar a estrutura genética da população e a diversidade genética, ii) avaliar o efeito da inclusão ou não de lactações curtas e o efeito do grupo genéticos da vaca (GGV) e/ou da mãe (GGM) em modelos para avaliação genética da produção de leite (PL305) e características reprodutivas, iii) estimar herdabilidades e associações genéticas, fenotípicas e de ambiente entre PL305 e as características reprodutivas, iv) estimar as tendências genéticas para PL305 e características reprodutivas, e v) estimar componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para produção de leite no dia do controle (PLDC) via modelo de regressão aleatória (MRA) e avaliar diferentes medidas de persistência da lactação em bovinos Girolando. As características reprodutivas estudadas foram: a idade ao primeiro parto (IPP), o primeiro intervalo de partos (PIDP) e a duração do período seco (DPS). Os coeficientes da estrutura da população e diversidade genética foram obtidos por meio do programa Endog, enquanto as estimativas dos componentes de (co)variância e parâmetros genéticos para todas as avaliações genéticas foram obtidas por meio do programa Wombat. O coeficiente de endogamia médio e o coeficiente de relação médio da população Girolando foram 0,11 e 0,13%, respectivamente. O tamanho efetivo da população considerando a geração completa traçada foi 188, estando acima do nível crítico. As estimativas de herdabilidade para PL305, IPP e PIDP oscilaram de 0,23 a 0,29, de 0,40 a 0,44 e de 0,13 a 0,14, respectivamente, sem inclusão de lactações curtas; e de 0,23 a 0,28, de 0,39 a 0,43 e de 0,13 a 0,14, respectivamente, com inclusão. Os modelos que incluíram os efeitos fixos GGV ou GGM tiveram maiores estimativas de herdabilidade para todas as características estudadas, do que os modelos que consideraram esses dois efeitos simultaneamente (GGV e GGM). As estimativas de herdabilidade foram semelhantes entre análises uni e bi-características, e oscilaram de 0,20 a 0,28, 0,00 a 0,08 e 0,07 a 0,14, para PL305, PIDP e DPS, respectivamente, enquanto que da IPP foi 0,20. As correlações genéticas entre PL305 com IPP (-0,49) ou DPS (-0,40 a -0,79) mostraram associação favorável. No entanto, verificou-se associação genética antagônica entre PL305 e PIDP (0,59) na primeira parição, embora com baixa acurácia. As correlações fenotípicas e de ambiente entre PL305 com IPP ou DPS mostraram associação favorável (-0,25 a -0,42 e -0,14 a -0,44, respectivamente). A mudança genética anual para PL305 e IPP ao se combinar as quatro trajetórias de seleção foram de 7,40 kg leite/ano e -0,13 dias/ano, durante o período de 1979 a 2007. Os critérios de qualidade de ajuste utilizados indicaram o MRA empregando polinômios de Legendre das ordens 3 e 5 para os ajustes dos efeitos genético aditivo e de ambiente permanente, respectivamente, como o melhor modelo que descreveu a variação dos efeitos aleatórios. As estimativas de herdabilidade e de correlações genéticas para PLDC ao longo da lactação, obtidas com o modelo selecionado, variaram de 0,18 a 0,23 e -0,03 a 1,00, respectivamente. Entre nove medidas de persistência de lactação a medida PS7 apresentou maior estimativa de herdabilidade e menor correlação genética com a PL305. Conclui-se que a endogamia, nos rebanhos da raça Girolando, foi de pequena magnitude, indicando que as práticas de acasalamento foram adequadas durante o período avaliado; a inclusão dos registros de lactações curtas causa pouca variação nos componentes de variância e nas herdabilidades das características estudadas, e recomenda-se a utilização do modelo com efeito fixo de GGV e inclusão de registros provenientes de lactações curtas na avaliação genética para PL305, IPP e PIDP de bovinos da raça Girolando; observouse associação genética antagônica entre PL305 e a PIDP, indicando que a ênfase da seleção para produção de leite, teria como resposta correlacionada, aumento do intervalo de partos, as amplas variações genéticas para produção de leite e características reprodutivas podem permitir ganhos genéticos moderados, contribuindo, ao longo prazo para melhoria da eficiência produtiva e reprodutiva dos rebanhos Girolando; os resultados de tendências genéticas mostraram que o programa de melhoramento genético da raça promoveu melhoria na produção de leite e redução na idade da vaca no primeiro parto, não tendo impacto sobre o primeiro intervalo de partos das vacas Girolando; o uso da medida de persistência (PS7) proposta por Kistemaker (2003), de sob MRA empregando funções polinomiais de ordens 3 e 5 para os efeitos genético aditivo e de ambiente permanente, respectivamente seria a opção mais adequada para a avaliação da persistência de lactação de animais da raça Girolando.Item Avaliação genética da produção de leite no dia do controle de caprinos de aptidão leiteira utilizando modelos de regressão aleatória multicaracterísticos(Universidade Federal de Viçosa, 2014-09-12) Silva, Felipe Gomes da; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/9483417302010859; Ventura, Henrique Torres; http://lattes.cnpq.br/2208756336864833; Nascimento, Moysés; http://lattes.cnpq.br/6544887498494945; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8O presente trabalho teve como objetivo principal realizar a avaliação genética da produção de leite no dia do controle utilizando modelos de regressão aleatória multicaracterísticos (MRAM). Os objetivos específicos foram: Estudar as divergências genéticas entre as quatro primeiras lactações de caprinos da raça Alpina, utilizando modelos de regressão aleatória unicaracterísticos (MRAU) para cada lactação; demonstrar a aplicação do software de recodificação de pedigrees alfanuméricos RENPED; verificar diferentes alternativas nas estruturas de ponto de truncamento, efeitos fixos e unidades de medidas da variável resposta produção de leite no dia do controle sobre a classificação dos animais avaliados geneticamente; verificar o melhor modelo de regressão aleatória para avaliar a produção de leite no dia do controle de caprinos da raça Saanen. Para tal, foram utilizados dados do rebanho de caprinos de aptidão leiteira da Universidade Federal de Viçosa. O software WOMBAT foi utilizado em todas as avaliações genéticas, o software CALC da LibreOffice foi utilizado em edições dos bancos de dados e o software RENPED foi utilizado nas recodificações de pedigrees e bancos de dados e algumas análises descritivas. Diferenças entre a estrutura genética de cada uma das lactações devem ser estudadas para delinear adequadamente estratégias de seleção em rebanhos de aptidão leiteira. Futuras análises testando diferentes modelos para a segunda, terceira e quarta lactação devem ser testados. Análises utilizando os MRAM foram viáveis, mas apresentam maior dificuldade de convergirem do que análises separadas de MRAU para cada lactação. MRAM e MRAU apresentam estimativas semelhantes para os componentes de variância ao longo da curva de lactação. MRAM podem trazer grandes vantagens em relação a MRAU por aproveitarem melhor os dados de ao menos duas lactações simultaneamente. O RENPED é uma alternativa para corrigir erros e recodificar dados alfa numéricos, assim como para viabilizar os arquivos de pedigree e dados para análises em diversos programas. Existe grande diferença na classificação dos animais quando o ponto de truncamento é muito baixo em relação a pontos de truncamento médios a altos para a lactação. Melhores resultados são obtidos em modelos que utilizem o efeito fixo classificatório ano-estação do controle leiteiro ao invés de ano-estação do parto. Melhores resultados também são obtidos através da construção destes efeitos fixos agrupando estações que comecem em um ano e terminem em outro ao invés de apenas mesclar as variáveis ano e estação. A utilização da produção de leite no dia do controle em litros como tradicionalmente utilizado não atrapalha as avaliações genéticas através de problemas de erros numéricos, mas unidades de medidas muito grandes ou muito pequenas podem ocasionar este tipo de problema. O modelo mais parcimonioso para avaliação da PLDC para os caprinos da raça Saanen foi o que considerava regressão fixa de ordem 3, genética aditiva de ordem 2 e permanente individual de ordem 8, além de 5 classes de variância residual. Também conclúi-se que combinações de mesma ordem para as curvas genética aditivas e permanente individuais podem não encontrar o melhor modelo de acordo com os critérios de comparação tradicionais.Item Avaliação genética de bovinos de corte compostos(Universidade Federal de Viçosa, 2007-08-13) Bueno, Rachel Santos; Ferraz, José Bento Sterman; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787231D8; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4769835U5; Silva, Martinho de Almeida e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783587T3; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6Grupos genéticos foram utilizados para estimar a heterose, e seu comportamento ao longo das gerações na população de bovinos compostos Montana Tropical. Os grupos genéticos avaliados foram: animais puros, F1, outros cruzados e compostos Montana Tropical. Arquivo de pedigree foi utilizado no cálculo da geração de cada animal. Os dados foram ajustados para os efeitos de heterozigoses e heterose materna total. A estimativa de heterose, para cada indivíduo, foi obtida por diferença dos dados sem ajuste, e ajustados para os efeitos não aditivos. A heterose média para cada geração foi calculada, sendo a significância estatística dos contrastes de médias verificada por meio de teste de hipótese. As estimativas de heterose média a cada geração foram positivas. Para P205 e PE390, retenção de heterose na população foi evidenciada com níveis de heterose maiores e/ou iguais a geração F1. Para P390 é constatada queda acentuada da heterose da geração F1, para as subseqüentes, que pode ser evidência das perdas por recombinação gênica. Na população os animais são agrupados em tipos biológicos pela composição racial em: grupo N, raças zebuínas; grupo A, raças adaptadas; grupo B, raças britânicas; e grupo C, raças continentais. A fim de identificar os melhores touros, em relação à composição racial, a serem utilizados em fêmeas ½ NxA, ½ NxB e ½ NxC, valor agregado da progênie foi calculado a partir dos efeitos genéticos aditivos e não- aditivos dos tipos biológicos estimados para população, para um índice e para cada característica que o compõe. Para fêmeas F1, a utilização de touros com média a alta fração de B, e média fração de A se beneficiam. O procedimento adotado foi eficaz e 65% dos touros classificados como superiores seriam selecionados, em quaisquer sistemas de produção de fêmeas F1, indicando alta capacidade de combinação. Dados dos bovinos compostos foram analisados com o objetivo de avaliar o efeito da inclusão de epistasia nos modelos de avaliação genética. As características analisadas foram os pesos aos 205 (P205) e 390 dias (P390), e perímetro escrotal aos 390 dias (CE390). As análises foram realizadas pela metodologia de máxima verossimilhança considerando-se dois modelos: o modelo 1 que incluiu como covariáveis os efeitos aditivos diretos e maternos, e os nãoaditivos das heterozigoses para os efeitos diretos e para o materno total, e o modelo 2, que considerou também o efeito de epistasia direto. Para comparação dos modelos foram utilizados o Critério de Informação de Akaike (AIC), o critério de informação Bayesiano de Schwartz (BIC), e o teste de razão de verossimilhança. Os dados foram ainda ajustados para os efeitos não-aditivos estimados, e submetidos à análise para obtenção de componentes de (co)variância e parâmetros genéticos. A inclusão dos efeitos de epistasia no modelo de avaliação genética pouco alterou as estimativas de componentes de (co)variâncias e as herdabilidades. No entanto, foi significativamente superior pelo teste de verossimilhança. Pelo AIC, o modelo 2 também proporcionou melhor aderência aos dados. No entanto, pelo BIC, o modelo 2 foi o mais adequado, somente para P205. A contribuição dos efeitos genéticos nãoaditivos, quando estimados utilizando o PROC GLM do SAS e pelo MTDFREML, foi também investigada e se os dados devem ser pré-ajustados para os efeitos não- aditivos ou, estes efeitos podem ser inclusos no modelo de avaliação genética como covariáveis, o modelo que considera a epistasia foi utilizado, sendo os dados ajustados para as soluções de efeitos não-aditivos obtidas. Valores genéticos dos tourinhos safra 2004 e dos touros classificados em TA, com 300 ou mais filhos mensurados; TM, com menos de 300 e mais de 39 filhos; e TB com menos de 40 filhos, para P205, foram organizados em arquivos, com a finalidade de se verificar alterações na magnitude das predições e no ordenamento dos animais, quanto aos dois métodos de correção para os efeitos não-aditivos. Correlações de Pearson e Spearman entre os valores genéticos para o peso aos 205 dias foram superiores a 0,94, podendo os efeitos não-aditivos serem incluídos nos modelos como covariáveis.Item Avaliação genética de suínos utilizando abordagens freqüentistas e bayesianas(Universidade Federal de Viçosa, 2007-07-09) Barbosa, Leandro; Regazzi, Adair José; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783586A7; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760232T2; Pires, Aldrin Vieira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799003J7; Pereira, Idalmo Garcia; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4705763T5Objetivou-se, neste estudo, estimar componentes de (co) variância e parâmetros genéticos em características de importância econômica em uma população de suínos da raça Large White. As características avaliadas foram idade para atingir 100 kg de peso vivo (IDA) e espessura de toucinho ajustada para 100 kg de peso vivo (ET) como características de desempenho e número de leitões nascidos (NLT) como característica reprodutiva. Para obtenção dos componentes de (co)variância foi utilizado o método da Máxima Verossimilhança Restrita, com o algoritmo Livre de Derivadas, por meio dos programas DFREML e MTDFREML, e o algoritmo Amostrador de Gibbs, por meio do programa MTGSAM. Este estudo foi organizado em quatro capítulos, em que os dois primeiros trataram das características IDA e ET e os dois últimos da característica NLT. No primeiro capítulo, foram utilizados quatro diferentes modelos mistos. Para a escolha do modelo que melhor se ajustou aos dados, foram utilizados o teste da razão de verossimilhança (LRT) e o critério de informação de Akaike (AIC). O modelo que incluiu os efeitos genético aditivo materno e comum de leitegada, além do genético aditivo direto, foi o que melhor se ajustou aos dados. As estimativas de herdabilidades aditiva direta foram médias (em torno de 0,28 e 0,45) e as herdabilidade aditiva materna foram baixas (em torno de 0,06 e 0,05) para IDA e ET, respectivamente. As correlações entre os efeitos genéticos aditivo direto e aditivo materno foram negativas, evidenciando antagonismo entre esses efeitos. As estimativas para efeito comum de leitegada foram em torno de 0,11 e 0,03 para IDA e ET, respectivamente. No segundo capítulo foi utilizado o algoritmo do Amostrador de Gibbs. O modelo misto utilizado continha efeito fixo de grupo contemporâneo e os seguintes efeitos aleatórios: efeito genético aditivo direto, efeito genético aditivo materno, efeito comum de leitegada e efeito residual. As médias das estimativas de herdabilidade aditiva direta foram de 0,33 e 0,44 para IDA e ET, respectivamente. As médias das estimativas do efeito comum de leitegada foram de 0,09 e 0,02 para IDA e ET, respectivamente. A estimativa de correlação genética aditiva entre as características foi próxima de zero (-0,015). No terceiro capítulo foram avaliados dois modelos mistos (modelo aditivo e modelo de repetibilidade) para a característica de tamanho de leitegada. O modelo aditivo foi utilizado para a primeira ordem de parto e continha efeito fixo de grupo contemporâneo e os seguintes efeitos aleatórios: efeito genético aditivo direto e efeito residual. O modelo de repetibilidade foi utilizado para a segunda, terceira e quarta ordens de parto e continha os mesmos efeitos do modelo aditivo mais o efeito fixo de ordem de parto e o efeito aleatório não correlacionado de ambiente permanente do animal. As estimativas de herdabilidades aditivas diretas foram de 0,15 e 0,20 para NLT nos modelos aditivo e de repetibilidade, respectivamente. A estimativa do efeito permanente de ambiente da porca (c2) foi de 0,09. As estimativas de tendências genéticas anuais obtidas nos modelos aditivos e de repetibilidade apresentaram comportamentos similares (em torno de 0,02 leitão/fêmea/ ano). No quarto capítulo, o modelo misto continha o efeito fixo de grupo contemporâneo e os seguintes efeitos aleatórios: efeito genético aditivo direto e efeito residual. Dados das primeiras quatro parições foram usados para NLT em duas análises, unicaracterísticas e multicaracterísticas separadas em séries de análises bicaracterísticas, com cada parição tratada como característica diferente. As estimativas de herdabilidades aditivas diretas para as diferentes parições variaram de 0,14 a 0,20 nas análises unicaracterísticas. As estimativas de herdabilidade aditiva direta nas análises multicaracterísticas entre as parições foram consistentes com as estimativas obtidas nas análises unicaracterísticas. Estimativas de correlações fenotípicas foram muito menores comparadas às correlações genéticas. As correlações genéticas foram menores que 0,75 em todas as parições, exceto entre a terceira e a quarta parição, que apresentou correlação alta (0,91). A menor correlação genética foi observada entre a primeira e a segunda ordem de parto (0,60).Item Avaliação genética em bubalinos leiteiros utilizando modelo de regressão aleatória(Universidade Federal de Viçosa, 2009-03-06) Chaves, Luciara Celi da Silva; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4764819P0; Carneiro, Paulo Luiz Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4795534Y2; Braccini Neto, José; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4721855E6Com objetivo de avaliar seis medidas de persistência da produção de leite e o progresso genético em bubalinos leiteiros a partir das tendências genéticas da produção acumulada até 301 dias e da persistência da produção de leite em primeiras lactações de búfalas da raça Murrah, utilizaram-se 9.219 registros de produção de leite no dia do controle provenientes da primeira lactação de 646 búfalas leiteiras da raça Murrah, controladas de 1987 a 2006. As produções no dia do controle foram analisadas por meio de modelo de regressão aleatória, considerando como efeitos fixos: grupo contemporâneo, número de ordenhas, efeitos linear e quadrático da covariável idade da búfala ao parto e coeficientes de regressão aleatória sobre os dias em lactação, modelados por polinômios ortogonais de Legendre de ordem três. Os coeficientes de regressão aleatória dos efeitos aleatórios genético aditivo e de ambiente permanente foram modeladas pela função logaritmica de Ali e Schaeffer. A média de produção de leite no dia de controle foi igual a 6,63 ± 2,49 kg. Os valores genéticos para produção de leite de fêmeas e touros ao longo dos dias em produção foram crescentes e negativos no início da trajetória até próximos aos 30 dias de lactação; valores máximos em torno dos 60 a 90 dias. A variável de persistência PS1, definida como PS1 = 280 Σ t=61 (VGP1 VGP60), onde VGP1 e VGP60 correspondem aos valores genéticos preditos no t-ésimo dia e aos 60 dias em produção, respectivamente, foi eleita como critério de seleção para persistência da produção de leite. Verificou-se que a seleção de indivíduos com maiores valores genéticos para a produção de leite acumulada aos 301 dias em produção (VGP301ac) favorece a seleção de animais com maiores valores genéticos para produção de leite no início da lactação e menos persistentes e, ainda, que a seleção de indivíduos com maior valor genético para persistência, implica na seleção de animais com maiores valores genéticos para produção de leite no final da lactação. .Analisando o comportamento da tendência fenotípica, verificou-se incremento de 26,91 kg de leite por ano, o que corresponde a 1,69% da média geral da produção total de leite. As tendências genéticas da PS1 para os reprodutores foi negativa (-3,41 kg/ano) e positiva para as matrizes (0,88 kg/ano). Para os animais com registros de produção, a tendência genética desse critério de seleção indicou redução de 2,12 kg de leite por ano. Para tendência genética da VGP301ac, os valores foram positivo para os reprodutores (4,71 kg/ano), negativo para as matrizes (mães) (-0,16 kg/ano) e positivo para animais com registro de produção (1,86 kg/ano). O valor estimado de tendência genética de reprodutores corresponde a 0,29% da média geral da produção de leite. Os resultados indicaram que a seleção simultânea para VGP301ac e PS1 implica na escolha de animais mais persistentes e produtivos. E, ainda, que maior incremento sobre a produção de leite ao longo dos anos se deu pela melhoria de fatores não genéticos, porém houve melhoria genética dos reprodutores para produção de leite nos últimos anos e diminuição da persistência da produção de leite.Item Certificação genealógica em Bovinos Gir Leiteiro por meio de exame de paternidade pelo DNA(Universidade Federal de Viçosa, 2010-03-05) Pinto, Isabella Silvestre Barreto; Machado, Marco Antonio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4797231Z4; Verneque, Rui da Silva; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4789462T1; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; http://lattes.cnpq.br/3538824509400890; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8; Souza, Gustavo Henrique de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P6A Embrapa Gado de Leite e a ABCGIL vêm desenvolvendo há 25 anos o Programa Nacional de Melhoramento de Gir Leiteiro PNMGIL que tem como objetivo promover o melhoramento genético da raça Gir por meio da seleção de touros geneticamente superiores, por meio de informações de suas progênies. Para avaliação genética dos touros em teste de progênie utiliza-se as informações das suas filhas, sendo importante a precisa informação de paternidade, uma vez que erros de identificação de filiação podem afetar o ganho genético. O objetivo deste trabalho foi utilizar marcadores moleculares para verificar a genealogia de animais pertencentes ao PNMGIL, verificar a freqüência de erros de paternidade encontrada por fazenda e touro analisados, a freqüência dos alelos encontrados na população e a eficiência dos marcadores utilizados. Para isso foram coletadas amostras de sangue de 303 filhas de 55 touros diferentes em 74 fazendas, sendo 15 fazendas criadoras de Gir puro e 59 criadoras de Gir x Holandês. Foram analisados 11 marcadores pertencentes ao Kit StockMarks for Cattle® Bovine Paternity PCR Typing recomendados pela ISAG (International Society of Animal Genetics) e cinco marcadores adicionais. Os produtos de PCR foram analisados no seqüenciador de DNA Megabace 1000, a análise dos fragmentos foi feita no software Fragment Profiler e os valores de heterozigosidade esperada e observada, freqüência alélica e número de alelos foram calculados com o aplicativo POPGENE 1.32. Os valores de PIC (conteúdo polimórfico informativo) foram calculados no programa PowerStats v1.2 e os valores das freqüências de erros por fazendas foram calculados no software SAS®. A exclusão de paternidade foi considerada quando os alelos de dois ou mais marcadores não foram compartilhados entre pai e filha. Foi encontrado um total de 18,15% de erros de paternidade em todos os casos analisados. Erros de 19,28% e 17,73% foram encontrados nas fazendas de gado Gir e Gir x Holandês, respectivamente. Analisando o número de erros por touros foi encontrado que 22 touros não apresentaram erros e 33 touros tiveram pelo menos um erro de paternidade. Os touros com sêmen mais difundido para inseminação das vacas apresentaram maior número de erros, quando comparados aos touros com sêmen menos difundido. Os marcadores com maior número de alelos foram o ETH3, 11-3 e 28-2 com 17 alelos cada um e o marcador com menor número foi o BM1824 com 9 alelos. As médias da heterozigosidade esperada e observada dos marcadores foram de 0,7682 e de 0,7136, respectivamente. O valor médio de PIC para todos os marcadores foi de 0,78, variando de 0,59 (ETH3) a 0,86 (28-2), valores que demonstram o alto índice de polimorfismo dos marcadores. O poder de exclusão combinado para os marcadores utilizados no presente estudo foi maior que 99,99%, mostrando que estes foram eficientes para realização do teste de paternidade mesmo não sendo específicos para a população analisada. Utilizando-se marcadores mais informativos para a população analisada pode-se reduzir o número de marcadores utilizados, o que poderá diminuir o custo dos testes de paternidade. Para isso, um painel específico para zebuínos deve ser elaborado.Item Comparação de modelos de crescimento e interação genótipos por ambientes na avaliação genética de codornas de corte(Universidade Federal de Viçosa, 2014-05-26) Silva, Luciano Pinheiro da; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/1958956061179986; Rossi, Robson Marcelo; http://lattes.cnpq.br/8288606794071770; Ventura, Henrique Torres; http://lattes.cnpq.br/2208756336864833; Martins Filho, Sebastião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723282T5No primeiro capítulo foram utilizados dados de sete pesos corporais, do nascimento a sexta semana de vida de codornas de corte e a partir deste conjunto de dados foram ajustados 15 modelos não lineares: Brody, Gompertz, Hill, Janoschek, Logístico, Meloun I, Meloun II, Mitscherlich, Michaelis-Menten, Michaelis-Menten modificado, Richards, Schnute, Von Bertalanffy, Weibull e Morgan-Mercer-Flodin. Foram utilizados os parâmetros de coeficiente de determinação ajustado, critérios de Akaike e bayesiano de Schwarz, teste de Durbin-Watson, Coeficientes de variação e porcentagem de convergência, agrupados utilizando a metodologia de componentes principais. Os modelos que agruparam o maior número de parâmetros de qualidade de ajuste foram Weibull, Gompertz, Logístico e Janoschek, sendo estes os mais recomendáveis para ajustes de curvas de crescimento em codornas de corte. Em um segundo capítulo avaliou- se um método em duas etapas para o estudo da interação genótipos x ambientes em curvas de crescimento. Foram utilizados dados de 2274 codornas de corte de duas linhagens, em dez níveis de proteína bruta (24 a 33% PB), pesadas do nascimento até a sexta semana de idade. O modelo de Gompertz foi ajustado e os parâmetros utilizados como fenótipo para análise de normas de reação sob modelo animal tendo como gradiente ambiental o nível de proteína na dieta. Normas de reação dos valores genéticos dos parâmetros da curva, herdabilidades, correlações genéticas e curvas de crescimento projetadas a partir da média de efeitos fixos e valores genéticos de cada animal. O parâmetro relacionado a peso assintótico foi o mais estável, tanto em normas de reação quanto em herdabilidades e correlações genéticas, porém os parâmetros relacionados às condições iniciais e à taxa de crescimento sofreram forte influência do gradiente nutricional. O ambiente em plantéis em seleção deve ser similar ao utilizado em escala industrial para minimizar diferenças em relação àquela conseguida pelos trabalhos de melhoramento.Item Detecção de Locos de Características Quantitativas (QTL) nos Cromossomos 5, 7 e 8 de suínos(Universidade Federal de Viçosa, 2008-02-25) Sousa, Katiene Régia Silva; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Machado, Marco Antonio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4797231Z4; Guimarães, Simone Eliza Facioni; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2; http://lattes.cnpq.br/8086289246837212; Paiva, Samuel Rezende; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767878U7; Peixoto, Jane de Oliveira; http://lattes.cnpq.br/2693613497106612Marcadores moleculares podem ser usados para identificar regiões cromossômicas que contêm locos de características quantitativas (QTL) que controlam fenótipos de importância econômica em animais de produção. Para estudá-los em suínos, foi gerada uma população de um cruzamento entre dois varrões da raça naturalizada Piau e dezoito fêmeas da linha comercial (Landrace x Large White x Pietrain). Uma progênie de 614 animais na F2 foi produzida de 50 acasalamentos da F1. Os dados fenotípicos de desempenho, carcaça, órgãos internos, vísceras, corte de carcaça e qualidade de carne foram coletados nos animais F2. Os animais parentais, F1 e F2 foram genotipados para 17 marcadores tipo microssatélites cobrindo os cromossomos 5, 7 e 8. Os locos foram considerados adequados para estudos de características quantitativas, quando foram analisados os valores de heterozigosidade observada (Ho), heterozigosidade esperada (He) e conteúdo de informação polimórfica (PIC). No cromossomo 5, os valores das médias de Ho, He e PIC encontrados foram 0,73; 0,66 e 0,61; no cromossomo 7, os valores encontrados foram 0,81, 071 e 0,67 e no cromossomo 8 os valores foram 0,65; 0,65 e 0,61. Com o resultado da genotipagem foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. As análises de associação foram feitas utilizando mapeamento por intervalo por regressão para detecção de QTL. Foram detectados 17 QTL para características de carcaça e corte de carcaça nos três cromossomos, enquanto para característica de desempenho apenas um QTL para conversão alimentar foi encontrado no cromossomo oito. Não foram encontrados nas literaturas consultadas QTL para Peso de Carré e Espessura de Bacon no cromossomo sete. As informações dos QTL significativos encontrados servem para estudos futuros como o mapeamento fino e identificação de genes que ajudam no melhor entendimento da fisiologia e características de produção de suínos.Item Detecção de locos de características quantitativas com efeito da origem parental dos alelos nos cromossomos 1, 2 e 4 de suínos(Universidade Federal de Viçosa, 2010-02-23) Silva Filho, Miguel Inácio da; Guimarães, Simone Eliza Facioni; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2; Fonseca, Ricardo da; http://lattes.cnpq.br/0308352373545558; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; http://lattes.cnpq.br/0470045409906299; Nascimento, Carlos Souza do; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4734058H3; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2Com o objetivo de detectar QTL com efeito da origem parental dos alelos, foram utilizados dados de uma população F2 de suínos, composta de 600 animais, obtidos a partir do cruzamento de machos Piau e fêmeas comerciais. Nos animais F2, foram avaliadas características de desempenho, carcaça, órgãos e vísceras, cortes de carcaça e qualidade de carne. Para a genotipagem de todos os animais, foram utilizados 16 locos de microssatélites distribuídos nos cromossomos 1, 2 e 4. Com o resultado da genotipagem, foi construído o mapa de ligação específico dos marcadores para a população desenvolvida. As análises de associação foram baseadas no mapeamento por intervalo usando métodos de regressão. Para identificar QTL com efeito da origem parental dos alelos, foi utilizada uma árvore de decisão baseada em testes contra o modelo de expressão Mendeliana. Usando o método de análise para esse tipo de expressão, foram detectados 23 QTL mendelianos: três no cromossomo 1, cinco no cromossomo 2 e 15 no cromossomo 4. Foram detectados também 12 QTL com efeito da origem parental dos alelos: seis no cromossomo 1 (três de expressão paterna e três de expressão materna), outros três no cromossomo 2 (um de expressão paterna e os outros dois de expressão materna) e três no cromossomo 4 (todos de expressão paterna). Nenhum dos QTL com efeito da origem parental dos alelos foi identificado pelo modelo Mendeliano. Os resultados obtidos podem contribuir para o melhor entendimento dos mecanismos genéticos envolvidos no controle das características quantitativas.Item Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 9 e 10 de suínos(Universidade Federal de Viçosa, 2008-07-28) Pinto, Ana Paula Gomes; Guimarães, Simone Eliza Facioni; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; http://lattes.cnpq.br/3914299583893924; Carneiro, Paulo Luiz Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4795534Y2; Pires, Aldrin Vieira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799003J7; Machado, Marco Antonio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4797231Z4QTL são associações estatísticas entre dados relativos a uma região genômica e a variabilidade fenotípica existente entre populações segregantes. Para identificação e avaliação dos efeitos de tais associações, foi feito o mapeamento dos cromossomos 9 e 10 de suínos pertencentes a uma população F2, oriunda do cruzamento entre as raças Piau e Comercial (Landrace X Large White X Pietrain), composta por 714 animais. A população foi avaliada em relação a características de desempenho, carcaça, órgãos e vísceras, cortes de carcaça e qualidade da carne. Foram estudados um total de 9 locos microssatélites distribuídos nos cromossomos, sendo seis localizados no cromossomo 9 e três no cromossomo 10. Os locos foram avaliados em relação à freqüência alélica, heterozigosidade observada, heterozigosidade esperada e conteúdo de informação polimórfica, sendo que aqueles considerados informativos foram utilizados na construção dos mapas de ligação, a partir do programa CRIMAP versão 2.4. A ordem dos marcadores no presente mapa foi semelhante àquela apresentada pelo mapa do USDA-MARC. No entanto, os mapas médios entre sexos dos cromossomos 9 e 10 obtidos no presente estudo possuem comprimentos superiores, respectivamente, 27,75% e 124,60% em relação aos mapas do USDA-MARC. As análises de associação foram feitas utilizando mapeamento de intervalo por regressão para detecção de QTL, com o auxílio do programa QTL EXPRESS. Foram detectados três QTL significativos ao nível cromossômico no cromossomo 9 para peso total do carré (P<0,01), peso do lombo (P<0,05) e comprimento total do intestino delgado (P<0,05), respondendo, respectivamente, por 6,7%, 4,0% e 4,9% da variação fenotípica. No cromossomo 10, foram detectados dois QTL significativos ao nível cromossômico para maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorso-lombar (P<0,05) e índice de vermelho (P<0,05), ambos respondendo por 2,4% da variação fenotípica, e um QTL significativo ao nível genômico para peso de fígado (P<0,01), respondendo por 6,9% da variação fenotípica. As informações dos QTL significativos encontrados servem para estudos futuros como o mapeamento fino e a identificação de genes que ajudem no melhor entendimento da fisiologia e das características de produção de suínos.Item Differentially expressed genes and miRNA identification in pig skeletal muscle(Universidade Federal de Viçosa, 2011-07-25) Verardo, Lucas Lima; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Nascimento, Carlos Souza do; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4734058H3; Guimarães, Simone Eliza Facioni; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2; http://lattes.cnpq.br/8538270961609589; Guimarães, Marta Fonseca Martins; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4790685D6O suíno (Sus scrofa) é considerado um animal de grande importância para produção de carne, sendo seu potencial de crescimento muscular objeto de grande interesse e geralmente associado com características determinadas na fase pré-natal durante a miogênese. Para o estudo de genes responsáveis por estas características, as etiquetas de sequências expressas (Expressed Sequence Tags - EST) fornecem informações diretas sobre o transcriptoma e indiretas sobre a relação entre o genoma e diferentes fenótipos, proporcionando o conhecimento sobre genes diferencialmente expressos (GDE) bem como sequências genômicas transcritas para o controle da expressão gênica como, por exemplo, alguns RNAs não codificantes. Características de tecidos musculares em suínos podem ser influenciadas diretamente por genes, e estes sendo regulados como, por exemplo, através de miRNAs, em diferentes fases de desenvolvimento. O presente trabalho teve como objetivo a identificação e a anotação in sílico de GDE e sequências não codificantes, com enfoque aos miRNAs, de bibliotecas de cDNA construídas a partir do músculo esquelético semi-membranoso de três diferentes raças de suínos (Duroc, Large White e naturalizada brasileira Piau) bem como a análise dos níveis de expressão dos genes identificados e miRNAs em sete fases de desenvolvimento do Longissimus Dorsi (21, 40, 70 e 90 dias pré-natal e 107, 121 e 171 dias pós-natal) de animais de linha comercial. Foram identificados 34 GDE sendo 21 pertencentes a uma rede gênica musculo-específica. Destes, 13 genes tiveram seus perfis de expressão analisados com o uso do qRT-PCR durante os sete períodos citados, formando quatro grupos de expressão semelhantes, um com maior expressão na fase pós-natal e três na fase pré-natal. Nas análises das sequências não codificantes um resultado importante foi a identificação de dois novos miRNAs em suínos, os quais tiveram suas sequências maduras similares aos miRNAs hsa-miR-1207-5p e hsa-miR-665 foram classificadas como verdadeiras pelo programa MiPred e formaram estruturas secundárias. Destes, encontrou-se 289 e 214 genes regulados por eles respectivamente, dos quais quatro são músculo-específicos. Os novos miRNAs tiveram seus perfis de expressão analisados com o uso do PCR em tempo real durante os sete períodos citados juntamente com outros três já identificados em suínos. Seus níveis de expressão mostraram diferenças entre os estágios pré- e pós-natal. Estes estudos podem fornecer valiosas informações possibilitando um maior entendimento dos mecanismos moleculares envolvidos no desenvolvimento muscular. As análises de GDE em fases pré e pós-natal sugerem a presença de genes atuando especificamente em determinados estágios de desenvolvimento do músculo, contribuindo para melhor explicar suas funções. A identificação de dois novos miRNAs, somados a outros já identificados e postados nos bancos de dados em suínos, podem contribuir para um maior entendimento dos modos de regulação gênica, sendo de importância para os estudos de genética e melhoramento animal, permitindo o entendimento da fisiologia da deposição de músculo para produção de carne em suínos.Item Efeito da mutação em populações selecionadas utilizando simulação genômica(Universidade Federal de Viçosa, 2009-07-31) Martins, Marília Albuquerque de Sousa; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; http://lattes.cnpq.br/8028758129735366; Souza, Gustavo Henrique de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P6; Ribeiro Junior, José Ivo; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723282Y6Este trabalho teve como objetivo estudar o efeito de diferentes taxas de mutação em populações submetidas à seleção individual, considerando diferentes sistemas de acasalamento e intensidades de seleção em característica de baixa e alta herdabilidade, utilizando-se os seguintes parâmetros: valores fenotípicos, endogamia, fixação de alelos desfavoráveis e favoráveis e limite de seleção, a longo prazo. Para possibilitar o desenvolvimento deste trabalho, foram simulados por meio do programa GENESYS, separadamente, doze genomas constituídos de uma única característica quantitativa que se distingue entre si pelo valor da herdabilidade e pela taxa de mutação. Foram simulados dois valores de herdabilidade para a característica em estudo: alta herdabilidade (h2 = 0,60) e baixa herdabilidade (h2 = 0,20) e três taxas de mutação: M1 = 1:10.000; M2 = 1: 100.000; M3 = 1:1.000.000. Essas taxas de mutação são expressas em termos de proporção de mutações/locus/geração, indicando a probabilidade de que 1(um) em cada 10.000, 100.000 ou 1.000.000 de genes simulados ocorrerá uma mutação. A partir de cada genoma simulado foi obtida inicialmente uma populaçãobase, constituída de 3.000 indivíduos com taxa endogâmica igual a zero e proporção igual entre machos e fêmeas, todos heterozigotos. A partir de cada população-base simulada foram amostrados aleatoriamente 10 machos e 250 fêmeas. Por meio do acasalamento desses indivíduos amostrados, foram obtidas as populações iniciais, num total de doze populações, apresentando as seguintes estruturas: a) seis populações iniciais constituídas de 1250 indivíduos correspondentes a um número de 5 descendentes por fêmea; b) seis populações iniciais com 500 indivíduos correspondentes a um número de 2 descendentes por fêmea. Depois de formadas as populações iniciais, teve início a formação das populações de seleção, num total de trinta e seis, correspondendo a duas intensidades de seleção (IS1 = Maior Intensidade de Seleção; IS2 = Menor Intensidade de Seleção), três taxas de mutação (M1=1:10.000; M2 =1:100.000; M3=1:1.000.000) e três sistemas de acasalamento (RAA=Reprodutores Acasalados Aleatoriamente; EIC=Exclusão de Irmãos Completos; EICMI=Exclusão de Irmãos Completos e Meio-Irmãos). Os acasalamentos eram praticados entre os reprodutores que tiveram os melhores desempenhos, sendo estes escolhidos para pais da geração seguinte, tendo por base a seleção individual. Este método de seleção foi praticado por 20 gerações consecutivas e para minimizar os efeitos da flutuação gênica, foram efetuadas 5 repetições por geração. Para as populações com maior intensidade de seleção (IS1), em cada geração, foram escolhidos 10 machos e 250 fêmeas e gerados 5 descendentes por acasalamento, totalizando 1250 indivíduos, com igual proporção entre machos e fêmeas (625 machos e 625 fêmeas), correspondendo a uma intensidade de seleção de 2,47 e 0,97 dos machos e das fêmeas selecionados, respectivamente. Já para as populações com menor intensidade de seleção (IS2) foram escolhidos o mesmo número de machos e fêmeas (10 e 250), respectivamente, gerando apenas 2 descendentes por acasalamento, totalizando 500 indivíduos, com igual proporção entre machos e fêmeas (250 machos e 250 fêmeas) correspondendo a uma intensidade de seleção de 2,16 para os machos. As populações tiveram em comum o mesmo tamanho efetivo, de 38,46. Observou-se que os ganhos obtidos ao longo das 20 gerações de seleção foi superior para a taxa de maior ocorrência de mutações (1:10.000) em relação às taxas M2 (1:100.000) e M3 (1:1.000.000), para todos os sistemas de acasalamento (RAA, EIC e EICMI) e herdabilidades (h2= 0,60 e h2= 0,20) nas populações submetidas a maior intensidade de seleção. Entretanto, maior taxa de mutação e maior intensidade de seleção resultaram em aumento da endogamia, maior fixação de alelos desfavoráveis e redução acentuada no limite de seleção. Os sistemas que excluem o acasalamento entre irmãos proporcionaram menores coeficientes de endogamia. Ao relacionar estes resultados com as herdabilidades estudadas (0,20 e 0,60), todos os resultaods apresentados mostraram-se mais expressivos para o caráter de herdabilidade alta.Item Efeito de polimorfismo nos loci CSN1S1, GH, DGAT1 e POU1F1 sobre os valores genéticos de produção e composição do leite de cabra(Universidade Federal de Viçosa, 2012-07-18) Melo, Ana Lúcia Puerro de; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2; Rodrigues, Marcelo Teixeira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788161Y5; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/4393320939032077; Ribeiro Junior, José Ivo; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723282Y6; Gasparino, Eliane; http://lattes.cnpq.br/9359055581511557Objetivamos com este trabalho, verificar se os polimorfismos nos genes CSN1S1, GH, DGAT1 e POU1F1 de caprinos estão associados com a produção de leite até os 270 dias de lactação, duração da lactação, contagem de células somáticas, produção e porcentagens de gordura, proteína, lactose e extrato seco total no leite. Para este propósito foram consideradas 2173 lactações de 1064 cabras de grupamentos genéticos das raças Saanen e Alpina, pertencentes ao rebanho do Setor de Caprinocultura da Universidade Federal de Viçosa, utilizadas para estimar os valores genéticos dos animais para estas características. O modelo animal utilizado continha os efeitos aleatórios de animal e de ambiente permanente; e os efeitos fixos de grupo contemporâneo, tipo de parto, grupamento genético e ordem de parto. Foram obtidos os genótipos de 215, 184, 104 e 182 fêmeas, respectivamente, para CSN1S1, GH, DGAT1 e POU1F1. Para verificar os efeitos dos genótipos sobre os valores genéticos das características, foram realizadas análises de variância, estimativas de contrates e comparações de médias pelo teste de Tukey (α=0,05). Observou-se associação entre os diferentes genótipos do CSN1S1 e os valores genéticos da maioria das características avaliadas. Além disso, foram encontradas evidências de efeitos de sobredominância entre os alelos no genótipo AE para duração da lactação, produções de proteína, lactose e extrato seco total e porcentagem de gordura no leite. Nenhum efeito dos genótipos do GH e POU1F1 sobre os valores genéticos das características de produção e qualidade do leite de cabra foi observado. O polimorfismo VNTR identificado na região promotora do gene DGAT1 teve influência sobre a duração da lactação, sendo que o alelo com maior número repetições em tandem apresentou uma associação positiva com esta característica.Item Endogamia na raça Gir(Universidade Federal de Viçosa, 2006-02-10) Reis Filho, João Cruz; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4706265D6; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Verneque, Rui da Silva; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4789462T1; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Martinez, Mário Luiz; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787024T0Os arquivos de pedigree e produção da raça Gir selecionada para produção de leite, armazenados na Embrapa Gado de Leite, foram utilizados para análise da estrutura genética da população, estudo do efeito da endogamia sobre características produtivas e reprodutivas, e avaliação genética comparativa entre base genética completa e selecionada. O programa ENDOG utilizou 27.610 animais no cálculo dos coeficientes individuais de endogamia (F) e de relação médio (CR), número efetivo de animais (Ne), de fundadores (fe) e de ancestrais(fa), e do intervalo de gerações (IG). Os coeficientes F e CR médios da população foram 2,82% e 2,10%, respectivamente. O Ne variou de 16,1 a 125,3 entre as gerações completas. O fe estimado foi 146 e o fa foi 75, sendo que apenas 28 ancestrais foram responsáveis pela origem de 50% dos genes da população. O IG total foi de 8,41 anos, sendo maior para machos e menor para fêmeas. Registros de 24.045 lactações ocorridas entre 1960 e 2004, de 8.879 vacas distribuídas em 26 rebanhos, foram utilizados para verificação do efeito da endogamia sobre as características produtivas: produções de leite (PL), de gordura (PGOR), de proteína (PPRO), de lactose (PLAC) e de sólidos totais (PSOL) e duração da lactação (DLAC); e reprodutivas: idade ao primeiro parto (ID1P) e intervalo de partos (INTP). As análises de variância e de regressão utilizaram procedimentos do SAS. A análise de variância para as características produtivas e intervalo de partos considerou os efeitos fixos de rebanho, ano-estação do parto, classe de geração (CG) aninhado em rebanho, classe de endogamia (CF) e idade da vaca ao parto, como covariável, nos termos linear e quadrático). Para idade ao primeiro parto, o modelo incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano do nascimento, época de nascimento, CF e CG-rebanho. As características produtivas foram afetadas por todas as fontes de variação (p<0,05). A idade da vaca ao parto e estação de nascimento não afetaram (p>0,05) o intervalo de partos e idade ao primeiro parto, respectivamente. Realizou-se um estudo de regressão das características, ajustadas para as outras fontes de variação, em função do coeficiente médio de endogamia de cada classe, ponderando-se pelo número de observações de cada classe. Os termos linear e quadrático do modelo de regressão foram significativos (p<0,01) para as características produtivas, cujas maiores produções estiveram associadas a coeficientes de endogamia entre 10 e 12%. Somente o termo linear foi significativo (p<0,05) para ID1P. O modelo de regressão proposto não explicou (p>0,05) a característica INTP. As avaliações genéticas para produção de leite foram realizadas pelo sistema MTDFREML e utilizaram como base o arquivo de produção, acrescido de pai e mãe da vaca. Variou-se somente a informação de pedigree, ora utilizando toda informação disponível, ou base genética completa (BGC), ora utilizando apenas as informações de pedigree dos touros submetidos ao teste de progênie, ou base genética selecionada (BGS). A utilização da BGS, em média, subestimou os valores genéticos dos animais. Altas correlações de Pearson e Spearman entre os valores genéticos preditos pela utilização das duas bases foram obtidas. Contudo, a seleção de animais diferentes quando se utiliza uma base genética ou outra poderia incorrer em redução nos ganhos genéticos, sobretudo nos machos, mais influenciados pela informação de parentes.
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