Meta-Analysis of Data from Quantitative Trait Loci Mapping Studies on Pig Chromosome 4

Abstract

Nas últimas décadas houve um grande aumento no conhecimento do genoma das espécies animais. A identificação de diversos tipos de marcadores e a construção de mapas genéticos possibilitou a realização de vários estudos de ligação. Como resultado, um grande número de estudos em suínos tem sido publicado com QTL envolvidos nas características de crescimento, carcaça, qualidade da carne e reprodutivas. Entre os QTL, vários foram identificados no cromossomo 4. A primeira parte deste estudo apresenta um estudo de ligação no cromossomo 4 suíno para várias características em um cruzamento entre machos da raça naturalizada brasileira Piau e fêmeas de linha comercial (Large White x Landrace x Piétrain). Características relacionadas com crescimento, carcaça e qualidade da carne foram medidas. No total foram identificados 11 QTL ao nível cromossômico e genômico. Os QTL mais significativos foram detectados para característica de carcaça na região FAT. Na segunda parte deste estudo, meta-análise foi realizada utilizando diversos QTL presentes em banco de dados disponíveis online, além dos identificados na primeira parte deste trabalho. Apesar de vários estudos relatarem a existência de QTL para uma característica específica no mesmo cromossomo, a posição estimada dos QTL tem variado consideravelmente entre os diferentes estudos. Sendo assim, objetivou-se melhorar as estimativas de posição dos QTL e a redução dos intervalos de confiança. Para isso,meta-análise foi realizada para características individuais, para características correlacionadas com o rendimento de lombo e para inúmeras características as quais puderam ser classificadas em três categorias. Observou-se que a meta-análise melhorou as estimativas de posição e reduziu o intervalo de confiança dos QTL quando comparados com os estudos iniciais. Entretanto, apesar dos ganhos nas estimativas de posição, a meta-análise por si só não forneceu a resolução suficiente para detecção de genes, mas pode servir como um passo preliminar para selecionar um número menor de genes candidatos presentes nas regiões de QTL para a realização de outros estudos.