Characterization of Tomato yellow spot virus, a novel tomato-infecting begomovirus in Brazil

Abstract

The objective of this work was the biological and molecular characterization of a begomovirus detected in São Joaquim de Bicas, Minas Gerais, Brazil, named TGV-[Bi2], by determining its host range, complete nucleotide sequence and phylogenetic relationships with other begomoviruses. Biological characterization consisted of a host range study using either sap inoculation or particle bombardment as inoculation methods. The yellow spot virus can infect plants in Solanaceae and Amaranthaceae, including economically importat crops as sweet pepper, and weeds as Datura stramonium and Nicotiana silvestris. For the molecular characterization, the full-length genome (DNA-A and DNA-B) was amplified, cloned and completely sequenced. Sequence comparisons and phylogenetic analyses indicated that TGV-[Bi2] constitutes a novel begomovirus species named Tomato yellow spot virus (ToYSV), closely related to Sida mottle virus (SiMoV).O objetivo deste trabalho foi a caracterização biológica e molecular de um begomovírus detectado em tomateiros em São Joaquim de Bicas, Minas Gerais, denominado TGV-[Bi2]. A caracterização biológica consistiu em teste de gama de hospedeiros, realizado por meio de inoculação via extrato foliar tamponado ou bombardeamento de partículas. O isolado TGV-[Bi2] infecta plantas das famílias Solanaceae e Amaranthaceae, inclusive espécies economicamente importantes como o pimentão, e algumas plantas daninhas como Datura stramonium e Nicotiana silvestris. A caracterização molecular consistiu na clonagem e seqüenciamento de seu genoma completo (DNA-A e DNA-B). A comparação de seqüências e análise filogenética indicaram que o TGV-[Bi2] constitui uma nova espécie de begomovírus, denominada Tomato yellow spot virus (ToYSV), filogeneticamente relacionado ao Sida mottle virus (SiMoV).