Métodos de agrupamento: avaliação e aplicação ao estudo de divergência genética em acessos de alho
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Data
2012-02-13
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Editor
Universidade Federal de Viçosa
Resumo
Este estudo teve por objetivo avaliar, quanto a consistência do agrupamento, os
métodos de agrupamentos hierárquicos UPGMA e Ward e os de otimização de
Tocher e Tocher modificado, pela aplicação da análise discriminante de Fisher
aos grupos obtidos com cada método, em estudo da divergência genética entre
acessos de alho, identificando também os acessos mais dissimilares. Os
agrupamentos foram realizados com base na distância generalizada de Mahalanobis, que também permitiu quantificar a importância relativa dos caracteres. Os acessos que apresentaram maior dissimilaridade foram os acessos 13 (BGH 4505) e 61 (BGH 5958), principalmente em relação ao peso médio do bulbo e produtividade. Os métodos de Tocher modificado, UPGMA e algoritmo de Ward apresentaram resultados concordantes entre si quanto a formação dos grupos. No entanto, pela análise discriminante de Fisher aplicada aos grupos dos métodos hierárquicos (UPGMA e Ward) observou-se as menores taxas de erro aparente, sendo, portanto, os métodos mais consistentes para o estudo da diversidade genética de acessos de alho.
This study aimed to assess, as the consistency of the grouping, hierarchical clustering methods UPGMA and Ward and optimization Tocher and modified Tocher by application of Fisher discriminant analysis in groups obtained with each method in the study of genetic divergence among garlic accessions, also identifying the most dissimilar access. The groupings were based on the Mahalanobis distance, which also allowed to quantify the relative importance of characters. The accessions with the highest dissimilarity accesses were 13 (BGH 4505) and 61 (BGH 5958), especially in relation to the average weight of the bulb and productivity. Modified Tocher methods, UPGMA and Ward algorithm presented results agree with each other and form groups. However, the Fisher discriminant analysis applied to groups of hierarchical methods (UPGMA and Ward) showed the lowest apparent error, therefore, more consistent methods for studying the genetic diversity of garlic accessions.
This study aimed to assess, as the consistency of the grouping, hierarchical clustering methods UPGMA and Ward and optimization Tocher and modified Tocher by application of Fisher discriminant analysis in groups obtained with each method in the study of genetic divergence among garlic accessions, also identifying the most dissimilar access. The groupings were based on the Mahalanobis distance, which also allowed to quantify the relative importance of characters. The accessions with the highest dissimilarity accesses were 13 (BGH 4505) and 61 (BGH 5958), especially in relation to the average weight of the bulb and productivity. Modified Tocher methods, UPGMA and Ward algorithm presented results agree with each other and form groups. However, the Fisher discriminant analysis applied to groups of hierarchical methods (UPGMA and Ward) showed the lowest apparent error, therefore, more consistent methods for studying the genetic diversity of garlic accessions.
Descrição
Palavras-chave
Allium sativum L., Análise de cluster, Análise discriminante, Allium sativum L., Cluster analysis, Discriminant analysis
Citação
SILVA, Anderson Rodrigo da. Clustering methods: evaluation and application for study of genetic divergence in garlic accessions. 2012. 83 f. Dissertação (Mestrado em Estatística Aplicada e Biometria) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2012.