Impacto da escolha de grupos externos em análises de delimitação de espécies de peixes ciclídeos do gênero Australoheros Říčan & Kullander, 2006 (Cichliformes) de bacias costeiras do sul da América do Sul

Abstract

Australoheros é um gênero de peixes ciclídeos, sendo o gênero em sua maioria de água doce, normalmente encontrados na América do Sul e é classificado como um dos 24 gêneros da tribo Heroini. Australoheros tem sido bastante revisado por estudos de delimitação de espécies que seguem abordagens integrativas, unindo dados morfológicos e moleculares, além de diversos métodos distintos. Em 2022, foi publicado o último estudo a respeito do assunto, onde foram reconhecidas 17 espécies válidas para o Australoheros, segundo análises morfológicas e moleculares através do método Bayesian Poisson Tree Processes (bPTP). Porém, uma premissa importante para o método molecular de delimitação escolhido pelos autores não foi seguida: a deleção dos haplótipos idênticos, baixando a confiabilidade dos resultados. Assim, o presente trabalho se propôs a refazer os testes, além de investigar o impacto que a utilização de diferentes grupos externos causa na delimitação de espécies. Foram utilizados oito grupos externos pertencentes às tribos distintas da família Cichlinae e da família Pseudocrenilabrinae, de modo que os primeiros grupos são mais próximos filogeneticamente do gênero analisado. Foram geradas 16 árvores de delimitação de espécies, oito correspondentes ao gene citocromo c oxidase I (COI) com fragmentos de 654 pares de bases e oito do gene citocromo b (CYTB) com fragmentos de 1099 pares de bases. Os resultados indicaram 14 linhagens delimitadas na análise 1, nove linhagens na análise 2, oito linhagens na análise 3, oito linhagens na análise 4, oito linhagens na análise 5, seis linhagens na análise 6, seis linhagens na análise 7 e oito linhagens na análise 8 para o gene COI; 24 linhagens delimitadas na análise 1, 20 linhagens na análise 2, 16 linhagens na análise 3, 14 linhagens nas análise 4, 5, 6, 7 e 8 para o gene CYTB, mostrando que CYTB delimitou mais espécies do que o gene COI, significando que CYTB é um gene mais confiável para delimitação de espécies do gênero Australoheros, indo contra ao resultado apresentado por esse último estudo. Também foi observado que a distância filogenética do grupo externo utilizado para as análises, interferiu na quantidade de espécies delimitadas. Palavras-chave: Bioinformática; Cichlidae; Coalescência; Genes Mitocondriais; Inferência Bayesiana.Australoheros is a genus of cichlid fish, mostly freshwater species, typically found in South America, and it is classified as one of the 24 genera within the tribe Heroini. Australoheros has been extensively reviewed by species delimitation studies employing integrative approaches, combining morphological and molecular data, as well as various distinct methods. In 2022, the latest study on this subject was published, recognizing 17 valid species of Australoheros based on morphological and molecular analyses using the Bayesian Poisson Tree Processes (bPTP) method. However, an important assumption for the molecular delimitation method chosen by the authors was not followed: the deletion of identical haplotypes, which reduced the reliability of the results. Thus, the present work aimed to redo the tests and investigate the impact of using different external groups on species delimitation. Eight external groups from distinct tribes within the family Cichlidae and the family Pseudocrenilabrinae were used, with the former groups being more phylogenetically related to the analyzed genus. Sixteen species delimitation trees were generated, eight corresponding to the cytochrome c oxidase I (COI) gene with 654 base pair fragments and eight to the cytochrome b (CYTB) gene with 1099 base pair fragments. The results indicated 14 lineages delimited in analysis 1, nine lineages in analysis 2, eight lineages in analysis 3, eight lineages in analysis 4, eight lineages in analysis 5, six lineages in analysis 6, six lineages in analysis 7, and eight lineages in analysis 8 for the COI gene; 24 lineages delimited in analysis 1, 20 lineages in analysis 2, 16 lineages in analysis 3, 14 lineages in analyses 4, 5, 6, 7, and 8 for the CYTB gene, showing that CYTB delineated more species than the COI gene, meaning that CYTB is a more reliable gene for species delimitation in the genus Australoheros, contrary to the results presented by the most recent study. It was also observed that the phylogenetic distance of the external group used for the analyses influenced the number of delimited species. Keywords: Bioinformatics; Bayesian Inference; Cichlidae; Coalescence; Mitochondrial Genes.