Diversity and genetic relatedness among genotypes of Vitis spp. using microsatellite molecular markers

Abstract

The purpose of this research was to study the genetic diversity and genetic relatedness of 60 genotypes of grapevines derived from the Germplasm Bank of Embrapa Semiárido, Juazeiro, BA, Brazil. Seven previously characterized microsatellite markers were used: VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVMD3, ssrVrZAG79 and ssrVrZAG62. The expected heterozygosity (He) and polymorphic information content (PIC) were calculated, and the cluster analysis were processed to generate a dendrogram using the algorithm UPGMA. The He ranged from 81.8% to 88.1%, with a mean of 84.8%. The loci VrZAG79 and VVMD7 were the most informative, with a PIC of 87 and 86%, respectively, while VrZAG62 was the least informative, with a PIC value of 80%. Cluster analysis by UPGMA method allowed separation of the genotypes according to their genealogy and identification of possible parentage for the cultivars 'Dominga', 'Isaura', 'CG 26916', 'CG28467' and 'Roni Redi'.O presente trabalho teve como objetivo estudar a diversidade genética e as relações de parentesco de 60 genótipos de videira procedentes do Banco de Germoplasma da Embrapa Semiárido, Juazeiro-BA. Sete marcadores microssatélites previamente caracterizados foram utilizados: VVS2, VVMD5, VVMD7, VVMD27, VVMD3, ssrVrZAG79 e ssrVrZAG62. Foram calculadas a heterozigosidade esperada (He), conteúdo de informação polimórfica (PIC), e as análises de agrupamento foram processadas para gerar um dendograma, utilizando-se do algoritmo UPGMA. A He variou de 81,8 a 88,1%, com média de 84,8%. Os lócus VrZAG79 e VVMD7 foram os mais informativos, com PIC de 87 e 86%, respectivamente, enquanto VrZAG62 foi o menos informativo, com um valor de PIC de 80%. A análise de agrupamento pelo método UPGMA permitiu separar os genótipos de acordo com sua genealogia e identificar possíveis parentais para as cultivares 'Dominga', 'Isaura', 'CG 26916', 'CG28467' e 'Roni Redi'.