Genética e Melhoramento
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Item Filogeografia molecular de poaia (Psychotria ipecacuanha (Brot.) Stokes)(Universidade Federal de Viçosa, 2004-03-01) Barros, Willian Silva; Cruz, Cosme Damião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6; Santos, Jorge Abdala Dergam dos; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780131D9; Oliveira, Luiz Orlando de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781626T2; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4737461Z0; Bruckner, Claudio Horst; http://lattes.cnpq.br/8023964479574271; Dias, Luiz Antonio dos Santos; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763137P6Psychotria ipecacuanha é uma espécie medicinal da família Rubiaceae, conhecida popularmente como poaia e que se desenvolve em agregados perenes, denominados reboleiras, em áreas úmidas e sombrias do sub-bosque das matas tropicais do continente americano. O presente trabalho visou investigar a filogeografia da poaia. Para isto, seqüenciou-se o gene cloroplastídico trnT-trnL de 40 indivíduos originários de 15 populações naturais. Nove destas populações foram identificadas na região Sudeste e seis na região Centro-Oeste do Brasil. Os dados de seqüenciamento possibilitaram a obtenção de um total de 959 bases. O alinhamento destas seqüências mostrou a existência de 13 sítios polimórficos entre elas, que diferenciaram oito haplótipos. Todos os indivíduos amostrados na região Centro-Oeste possuíam um único haplótipo, enquanto cada um dos indivíduos da região Sudeste foi alocado em um dos sete haplótipos restantes. A análise dos dados via nested clade analyses possibilitou a obtenção de uma rede única e se inferiu que os componentes desta rede estão agrupados em nível de cladograma total, de acordo com a região geográfica de procedência. A separação entre as populações do Sudeste e do Centro-Oeste segue um padrão que sugere fragmentação alopátrica, enquanto certas populações restritas ao Sudeste estão sofrendo restrição ao fluxo gênico por isolamento à distância. Na elaboração de um programa de conservação genética, as populações do Parque Estadual do Rio Doce, Itaperuna e Guaraciaba podem ser indicadas como prioritárias, pois além de apresentarem variação no número de haplótipos dentro da população, possuem também cinco haplótipos privativos. Além disso, as três populações detêm juntas, 75% da variabilidade das linhagens do gene trnT-trnL.Item Genotipagem seletiva e outras estratégias de amostragem no mapeamento genético e na detecção de QTL em populações F2 simuladas(Universidade Federal de Viçosa, 2007-03-28) Barros, Willian Silva; Viana, José Marcelo Soriano; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4786170D5; Carneiro, Pedro Crescêncio Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728227T6; Cruz, Cosme Damião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4737461Z0; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2; Caixeta, Eveline Teixeira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728636Z7A análise genética ao nível de DNA está se tornado cada vez mais eficiente. Grande quantidade de informações sobre genomas de plantas cultivadas está sendo gerada. No entanto, o principal desafio hoje refere-se à utilização deste conhecimento de forma integrada na prática efetiva do melhoramento genético de plantas. O mapeamento genético e de QTL contém um número considerável de estudos de natureza analítica. Porém, genotipagem de grande número de indivíduos para vários marcadores é uma limitação, mesmo com a revolução causada pela introdução de técnicas baseadas em PCR Polymerase Chain Reaction . Dessa forma, são necessários estudos que envolvem estratégias experimentais como a genotipagem seletiva, que permitem reduzir o número de indivíduos genotipados, mantendo-se o poder de detecção do QTL. A simulação em computador tem sido utilizada para obtenção de propriedades e verificação do desempenho de modelos, métodos, tamanho e tipos de população no mapeamento genético e detecção de QTL. Portanto, o objetivo do trabalho foi investigar, por meio de simulação, tomando como referência populações F2 com 1.000 indivíduos em 36 cenários para características fenotípicas, a influência dos níveis de herdabilidade, da ação gênica e da saturação dos grupos de ligação no mapeamento genético e detecção do QTL. Outro objetivo foi investigar a influência da intensidade de seleção em amostras obtidas por genotipagem seletiva das populações F2 simuladas no mapeamento genético e detecção do QTL. Para intensidade de seleção de 20%, os resultados obtidos pela genotipagem seletiva foram comparados com outras estratégias experimentais de amostragem sistemática, mista e aleatória. Verificou-se no primeiro capítulo que o mapeamento genético em todas as 3.600 populações F2 foi de acordo com o genoma simulado. Em relação à detecção de QTL, pode-se observar que níveis de herdabilidade de 20% e níveis de ação gênica de 5 e 10%, independente da saturação do grupo de ligação, são cenários que não permitem detectar facilmente o QTL. No segundo capítulo, quando a intensidade de seleção da genotipagem seletiva foi de 10%, em muitos cenários, o mapa de ligação obtido foi diferente do esperado. Nas outras intensidades de seleção foi possível a recuperação do mapa de ligação como esperado, mesmo com distorções das marcas próxima ao QTL simulado. Quanto à detecção do QTL, os valores médios dos LOD scores nas populações de 500, 300 e 200 indivíduos amostrados por genotipagem seletiva foram ligeiramente menores que os encontrados nas populações com 1.000 indivíduos. Os resultados obtidos das análises genômica em estratégias experimentais de amostragem mista e genotipagem seletiva foram satisfatórios. Eles mantiveram, em média mapas, de ligação próximos ao esperado, com alto poder de detecção de QTL em comparação com resultados obtidos em amostragem aleatória e sistemática.