Teses e Dissertações

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Teses e dissertações defendidas no contexto dos programas de pós graduação da Instituição.

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    Estudo citogenético, molecular e anatômico em genitores e híbridos de Passiflora spp.
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-10-01) Soares, Wellington dos Santos; Bruckner, Cláudio Horst; http://lattes.cnpq.br/0580272196877556
    A ampla variabilidade de Passiflora no Brasil é algo que vem sendo cada vez mais explorado, uma vez que várias espécies silvestres possuem alelos de interesse ao melhoramento. Estes são responsáveis por características como longevidade, adaptação às condições climáticas adversas, período de florescimento ampliado, maior concentração de componentes químicos de interesse para indústria farmacêutica e cosmética e resistência a doenças. Assim, o melhoramento do maracujazeiro pode seguir várias vertentes em função da região e da parte da planta a ser considerada. Os caracteres de interesse têm sido transferidos de uma espécie para outra mediante o processo de hibridação por cruzamentos interespecíficos. Todavia, é necessário a confirmação dos híbridos e outros caracteres para conhecer melhor sua constituição genotípica e fenotípica, a fim de que as mesmas possam ser disponibilizadas para uso em programas de melhoramento. Cabe salientar que a obtenção de híbridos via cruzamento nem sempre ocorre, uma vez que espécies mais distantes geneticamente podem não ser compatíveis para o processo de hibridação, dificultando assim a obtenção de híbridos e, posteriormente, ciclos de autofecundação, quando o objetivo do programa de melhoramento for produzir plantas homozigotas. Um modo de se obter plantas homozigotas de modo mais rápido é a utilização do cultivo de anteras, micrósporos e óvulos não fertilizados na cultura de tecidos. Porém, a literatura traz poucas informações acerca desta técnica para o gênero Passiflora. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi a confirmação de híbridos interespecíficos de Passiflora via citogenética molecular, sua caracterização fitoquímica, hormonal e molecular, e a descrição dos processos que ocorrem no processo de indução da embriogênese na cultura de anteras. O material vegetal foi composto por Passiflora mucronata, Passiflora gibertii, Passiflora cincinnata; híbridos H-328, H-103, H-108, H- 387, os quais tiveram folhas coletadas para realizar análises de citometria de fluxo e citogenética molecular para confirmação da natureza híbrida, caracterização fitoquímica, hormonal e molecular. Em relação aos processos de indução de embriogênese o material vegetal consistiu em botões florais coletados em pré antese, em plantas adultas de Passiflora gibertii, mantida sob polinização aberta. As anteras foram excisadas e colocadas em meio de cultura com concentrações hormonais adequadas para indução embriogênica. Para análise foram coletados calos embriogênicos com intervalos de 5 dias no total de 45 dias, sendo fixados, cortados e corados para análise anatômica estrutural e histoquímica. Para evidenciar a ploidia dos calos, amostras também foram submetidas a análise de citometria de fluxo. Em relação a confirmação de hibridação, confirmado os genitores interespecificos P. gibertii x P. mucronata e P. gibertii x P. cincinnata para o hibridos analisados; os cromossomos metacéntrico e submetacéntrico foram conservados nos híbridos, o que deduz compatibilidade para cruzamentos entre as espécies; e a técnica de GISH inferiu a origem dos cromossomos de cada parental nos híbridos, assim como a possível combinação de DNA, pressupondo uma mescla de caracteres. Os resultados também apontaram que as espécies genitoras e seus híbridos apresentam uma gama de compostos polifenólicos do grupo de flavonoides glicosilados. As poliaminas e níveis de expressão de microRNAs não apresentaram diferenças significativas entre genitores e híbridos testados; os flavonoides obtidos neste estudo podem ser objetivos de estudos futuros relacionados a farmacologia. Sobre o protocolo avaliado para indução de embriões a partir de anteras, estes foram gerados no cultivo de anteras de P. gibertii. As avaliações citológicas demonstraram eventos ocorrentes durante o processo embriogênico em anteras, que ainda não tinham sido relatadas para o gênero Passiflora, até o presente momento, ampliando o conhecimento das camadas celulares e teciduais envolvidas nos eventos morfogênicos que levam à regeneração e podem contribuir positivamente para aumentar a eficiência da técnica, para diferentes espécies de Passiflora. Palavras-chaves: Híbridos interespecíficos. GISH/ FISH. Fitoquimica. Androgênese.
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    Adaptabilidade e estabilidade da produtividade de genótipos de café arabica resistentes a ferrugem em duas regiões cafeeiras de Minas Gerais
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-03-14) Oliveira, Diondevon Rocha; Caixeta, Eveline Teixeira; http://lattes.cnpq.br/7602245642772460
    Para alcançar o atual patamar de importância, a cafeicultura brasileira de um modo geral e a cafeicultura mineira contaram com árduo trabalho técnico e científico ao longo de vários anos. Entre as principais ações científicas para o desenvolvimento da cafeicultura, certamente está na instalação de programas de melhoramento genético, responsáveis pelo desenvolvimento de materiais genéticos mais produtivos, tolerantes à seca, com arquitetura adequada e resistentes às moléstias agrícolas que assolam o café, sobretudo a ferrugem, causada pelo fungo Hemileia vastatrix Berk. et Br., que é a principal doença da cafeicultura mundial. Assim como a ferrugem, a bienalidade de produção, ou seja, a variação de uma alta produção seguida de safra com uma baixa produção, é outro problema que assola cafeicultores cm todo Brasil. A seleção de genótipos com potencial produtivo, resistência a ferrugem, que sofram pouco com o efeito da bienalidade e apresente alta adaptabilidade contudo, não é tarefa fácil, principalmente devido a existência de interação entre genótipos e ambiente, ou seja, os genótipos respondem de forma diferenciada aos diferentes ambientes. Várias metodologias estão disponíveis para se avaliar os genótipos e classificá-los quanto à estabilidade e adaptabilidade, de maneira que possam ser selecionados ou recomendados para diferentes ambientes. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi avaliar o comportamento de 32 genótipos de cafeeiros Arábica, portadores de genes de resistência à ferrugem, bem como estudar a bienalidade, adaptabilidade e estabilidade mesmos, em Viçosa e Patrocínio, duas importantes regiões produtoras de café de Minas Gerais. Foram instalados, em fevereiro de 2006, um ensaio no município de Viçosa, em área experimental da Universidade Federal de Viçosa e outro no Campo Experimental de Patrocínio/Epamig, no município de Patrocínio. Os experimentos foram montados no delineamento experimental de blocos ao acaso, com 32 tratamentos, quatro repetições e parcelas de seis plantas. A produtividade para as colheitas (2008 a 2013) em sacas de café beneficiado por hectare (sc/ha) foi estimada, considerando-se um rendimento médio de 480 litros de café da roça por saca de 60 kg de café beneficiado. Para análise da adaptabilidade e estabilidade foram utilizadas quatro diferentes metodologias estatísticas. A bienalidade foi menor em todos os tratamentos nas condições de Patrocínio — MG. Esse resultado demonstra que a região de Patrocínio detém melhores condições que Viçosa para a regeneração dos ramos plagiotrópicos. O genótipo IPR 103 apresentou a maior média geral de produtividade (31,86 sacas de 60 kg/há) ao longo das seis colheitas nos dois locais de estudo. O material genético IPR 100 demonstrou ser um genótipo muito responsivo em produtividade, para um manejo de alto nível tecnológico, ao passo que o genótipo IPR 103 apresentou adaptabilidade geral para os ambientes em estudo. Outros genótipos como Acauã e Catucaí Amarelo 24/137 apesar da produtividade elevada apresentaram baixa previsibilidade de desempenho. De forma geral os genótipos com fontes de resistência a ferrugem apresentaram bom desempenho e são, portanto, materiais genéticos recomendados para as condições de estudo.
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    Estudo da interação genótipo × ambiente e predição genômica de híbridos de sorgo biomassa
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-09-06) Oliveira, Isadora Cristina Martins; Carneiro, José Eustáquio de Souza; http://lattes.cnpq.br/8764189756801400
    O sorgo biomassa é uma cultura que vem sendo demandada pelo mercado sucroenergético devido à suas características agronômicas, especialmente tolerância a estresses abióticos e alta acúmulo de biomassa, para a produção de energia. Neste contexto, com base no banco de dados históricos do programa de melhoramento de sorgo bioenergia da Embrapa Milho e Sorgo, buscou-se: i) investigar as fontes de interação genótipo × ambiente (G×A) e selecionar genótipos produtivos e adaptados e/ou estáveis, às diferentes condições ambientais usando análise de fatores; ii) avaliar a acurácia de predição de híbridos usando informação de marcadores SNPs e dados de múltiplos ambientes; iii) comparar a acurácia de modelos aditivos e aditivos-dominantes; e iv) predizer híbridos ainda não testados do programa. Os dados foram genotipados, via genotipagem por sequenciamento (GBS), sendo 17 linhagens R (macho-fértil) e 46 linhagens A (macho-estéril), das quais deram origem à 202 híbridos, que foram fenotipados em diversas regiões no território brasileiro. Devido ao alto desbalanceamento entre os ensaios nos diferentes anos, e entre os ensaios preliminares (APH) e finais (VCU) de avaliação de híbridos, adotou-se os métodos de modelos mistos para análise dos dados, com o auxílio do pacote ASReml disponível no software R. Constatou-se alta interação G×A entre os ambientes avaliados, com correlações genotípicas variando de -0,09 a 0,68. Por meio da análise de PCA os dois primeiros fatores explicaram 48.81% da variação genética, e foram capazes de distinguir os ambientes em avaliação. Por meio do biplot também foi possível selecionar genótipos com ampla adaptabilidade ou adaptabilidade específica à alguns ambientes. Analisando a regressão latente, com base nos genótipos mais produtivos, os híbridos H16 e H64 se mostraram os mais adaptados, e H17 o mais estável, aos ambientes avaliados. No contexto da seleção genômica, após obtidas as matrizes de relacionamento genético, os genitores foram distintos em dois grupos, o primeiro agrupando os genitores masculinos (linhagens R) e o segundo os femininos (linhagens A). Os modelos de predição apresentaram boa acurácia preditiva, exceto os esquemas de validação cruzada para híbridos avaliados em mais de cinco locais (CV3.1 e CV3.2), devido a menor informatividade da população de treinamento. Também observou-se que a adição da matriz de efeitos não-aditivos, proporciona um relativo aumento na acurácia de predição de híbridos em múltiplos ambientes, quando comparado aos modelos aditivos. Já para a predição de híbridos ainda não testados, também foram observadas altas acurácias, no entanto o menor tamanho da população de treinamento, e predições baseadas em informação de machos, levou a uma redução da acurácia em todos os esquemas testados. Dessa forma, os métodos de modelos mistos podem ser usados com eficiência nos programas de melhoramento de sorgo biomassa, possibilitando selecionar genótipos mais produtivos, e adaptados e/ou estáveis a uma ampla gama de ambientes, ou à ambientes específicos, além de predizer híbridos ainda não avaliados, ou avaliados em múltiplos ambientes, apresentando alta acurácia. Palavras-chave: Sorghum bicolor. Modelos mistos. Melhoramento de plantas. Validação Cruzada.
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    Mapeamento de QTLs, associação genômica ampla e seleção genômica para estresses abióticos em sorgo
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-08-30) Bernardino, Karine da Costa; Carneiro, Pedro Crescêncio Souza; http://lattes.cnpq.br/1482143069200398
    O cultivo de sorgo em solos ácidos, caracterizados por múltiplos estresses como deficiência de fósforo (P) e toxidez por alumínio (Al), relevou uma necessidade pelo desenvolvimento de cultivares adaptados, uma vez que a susceptibilidade a estas condições acarreta reduções na produção de grãos. Nesse contexto, este estudo almejou elucidar o controle genético da resposta a condições baixa disponibilidade de P e níveis tóxicos de Al em sorgo. Assim, buscou-se: i) identificar regiões genômicas, via mapeamento associativo (GWAS) e mapeamento de QTLs (Quantitative trait loci), associadas a características relacionadas à eficiência no uso de P, produção de grãos e morfologia radicular em baixo P, bem como à tolerância ao Al, utilizando uma população RILs (396 linhagens) e uma população multiparental de acasalamento ao acaso (200 progênies em ciclo S2); ii) selecionar progênies S2 superiores de acordo com a presença de alelos favoráveis para SNPs que no GWAS foram associados a características de interesse; iii) realizar análises de seleção genômica sem e com genes de efeito maior. RILs e progênies S2 foram genotipadas via genotipagem por sequenciamento (GBS) e via Kasp para SNPs gene-específicos para os genes SbPSTOL1 e SbMATE (relacionados à eficiência na aquisição de P e à tolerância ao Al em sorgo, respectivamente). Ambas as populações apresentaram variabilidade genética para todas as características avaliadas, com valores de herdabilidade entre 0,34 e 0,83. Constatou-se que a eficiência na aquisição de fósforo é o principal componente na eficiência do uso de P em sorgo. As co-localizações entre genes SbPSTOL1 e QTLs para eficiência de P nas RILs, sugeriram que os genes SbPSTOL1 são uma ferramenta promissora para desenvolvimento de cultivares superiores em condições de estresse de P. A população BRP13R foi considerada um recurso polivalente, útil para a descoberta de genes e para a seleção de progênies que acumulem alelos favoráveis em múltiplos locos, ocasionando uma adaptação mais ampla a diversas condições de estresse. Além disso, a população BRP13R é indicada para estudos de seleção genômica usando modelos que acomodem efeitos aditivos e dominantes, sendo a acurácia preditiva aprimorada pela adição de marcadores de efeito fixo em desequilíbrio de ligação com os genes principais. Palavras-chave: Mapeamento de QTLs. GWAS. Seleção genômica. Sorgo. Estresse abiótico.
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    Linhagens de introgressão derivadas de Solanum pennellii: Tolerância ao déficit hídrico durante a germinação e no estádio de plântula
    (Universidade Federal de Viçosa, 2018-02-23) Pessoa, Herika Paula; Gomes, Carlos Nick; http://lattes.cnpq.br/1447589936760348
    A espécie silvestre próxima ao tomateiro Solanum pennellii é tolerante ao déficit hídrico. Esse trabalho teve como objetivo identificar linhagens de introgressão (ILs), derivadas de S. pennellii, tolerantes ao déficit hídrico durante a germinação e avaliar a eficiência de duas metodologias para discriminação de genótipos tolerantes e sensíveis ao déficit hídrico. Foram utilizadas 47 ILs, o acesso LA716, padrão de tolerância e as cultivares M-82 e Santa Clara, padrões de sensibilidade. Sementes desses genótipos foram submetidas a teste de germinação sob déficit hídrico induzido por solução de PEG 6000 (-0,3 MPa). Foram avaliadas as variáveis, comprimento de radícula, comprimento de parte aérea, comprimento total, porcentagem de germinação na primeira contagem, porcentagem final de germinação, índice de velocidade de germinação, tempo para 50% da germinação máxima e taxa de germinação. O desempenho dos genótipos na presença e ausência de déficit hídrico foi comparado por meio da razão e diferença entre os dados obtidos na condição controle e na condição com PEG. Os dados de razão e diferença foram submetidos a análise de fatores para agrupamento das variáveis e dos genótipos. O índice FAI-BLUP foi utilizado para ranquear os genótipos. A análise de fatores agrupou as variáveis em três fatores, um com as características de germinação e outros dois com as características de comprimento da plântula, indicando que o déficit hídrico atua de maneira diferente sobre esses dois fenômenos. O agrupamento e ranqueamento dos genótipos com base nos dados de razão foram coerentes, indicando que essa é a melhor maneira para comparar o desempenho dos genótipos e inferir sobre sua tolerância ao déficit hídrico. Considerando uma intensidade de seleção de 15% as linhagens selecionadas pelo índice FAI-BLUP com os dados de razão foram IL 1-4-18, IL 2-3, IL 1-2, IL 9-2 e IL 10-1. Logo, fragmentos de S. pennellii introgredidos nos cromossomos 1, 2, 9 e 10 condicionam a tolerância ao déficit hídrico durante a germinação.
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    Estratégias para mitigar os efeitos do deficit hídrico no tomateiro
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-05-29) Alves, Flávia Maria; Gomes, Carlos Nick; http://lattes.cnpq.br/5278233849019375
    A tomaticultura demanda uma grande quantidade de água. Visando tornar os sistemas de produção mais sustentáveis é necessário obter cultivares que sob menor volume de água mantenham sua performance agronômica, sem reduzir sua produção. Diante disso, esse trabalho teve dois objetivos: i) avaliar as respostas fisiológicas de plantas de tomate enxertadas em Solanum pennellii e Solanum peruvianum sob deficit hídrico; ii) avaliar os índices de tolerância e selecionar genótipos com potencial para tolerância ao deficit hídrico. No primeiro experimento, os porta-enxertos utilizados foram dois acessos de tomateiro S. pennellii (PN) e S. peruvianum (PR) que são tolerantes ao deficit hídrico e a cultivar ‘M ultifort ’ (MU). O enxerto utilizado foi ‘ HM 1823’ (HM), também foi realizada a autoenxertia nessa cultivar. O tratamento consistiu em plantas irrigadas periodicamente (controle) e plantas não irrigadas (sob deficit hídrico) onde a água foi suprimida totalmente. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, em esquema fatorial 2x5. Foram realizadas avaliações dos parâmetros fisiológicos e as análises do teor de malonaldeído e prolina. No segundo experimento, foram utilizados 29 acessos de Solanum sp., do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV). Dentre esses acessos, o BGH-6904 e BGH-6906 (S. peruvianum) são tolerantes ao deficit hídrico. Além dos acessos, duas cultivares, ‘Santa Clara’ (padrão de susceptibilidade) e ‘Gabryelle’ também foram usadas no experimento. Os acessos e as cultivares (genótipos) foram avaliados durante a germinação e estádio reprodutivo sob deficit hídrico. O delineamento experimental utilizado durante a germinação foi inteiramente casualizado com quatro repetições e durante o estádio reprodutivo o delineamento foi em blocos casualizados, com e sem deficit hídrico, com três repetições. Foram testados dois índices de tolerância e a seleção dos melhores genótipos foi feita pelo índice de seleção FAI-BLUP (factor analysis and genotype-ideotype distance). No primeiro experimento, HM/PN e HM/PR, sob deficit hídrico, apresentaram maiores valores para potencial hídrico, teor relativo de água, assimilação líquida de CO 2 , eficiência intrínseca e instantânea do uso de água. O agrupamento realizado com os dados obtidos por meio da razão entre os caracteres do tratamento deficit hídrico e controle alocou ‘Santa Clara’ (padrão de susceptibilidade) e BGH-6904 e BGH-6906 (padrões de tolerância) no mesmo grupo, ou seja, esses três genótipos são considerados similares. Os genótipos selecionados pelo índice FAI-BLUP durante a germinação, não foram os mesmos selecionados durante o estádio reprodutivo. Portanto, de acordo com os resultados do primeiro experimento, os tomates silvestres utilizados como porta-enxertos podem ser uma estratégia para se obter a tolerância ao deficit hídrico. Com base nos resultados do segundo experimento, é possível concluir que para esse conjunto de dados a forma mais eficiente para selecionar genótipos durante a germinação e estádio reprodutivo sob deficit hídrico é usando os dados obtidos por meio da diferença entre os caracteres do tratamento controle e do deficit hídrico. Os genótipos mais promissores visando a tolerância ao deficit hídrico durante a germinação foram BGH-2014, BGH-6904, BGH-3493, BGH-2020, BGH-2208, BGH-1988 e BGH-6906. Durante o estádio reprodutivo os genótipos tolerantes foram BGH-6912, BGH-3394, BGH-6924, BGH- 3500, BGH-7299, BGH-2051 e BGH-2202.
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    Estratificação ambiental via GGE biplot para otimização de rede de ensaios de soja
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-07-26) Rodrigues, Fernanda Cupertino; Silva, Felipe Lopes da; http://lattes.cnpq.br/6260940747572830
    Ensaios de Valor de Cultivo e Uso (VCU) são conduzidos por programas de melhoramento genético de soja com o intuito de selecionar e recomendar novas cultivares superiores para regiões específicas. Estes ensaios demandam muito trabalho e são financeiramente dispendiosos. Assim, encontrar ferramentas que, na prática, podem contribuir para a otimização deste processo através do aumento de sua eficiência e da minimização dos custos é muito importante. Diante disso, objetivou-se com este estudo, por meio da estratificação ambiental via GGE Biplot, otimizar redes de ensaios de soja distribuídos em municípios dos estados do Mato Grosso do Sul, Paraná, São Paulo e Santa Catarina. Para tanto, utilizou-se os dados de produção de 43 ensaios, distribuídos em 23 municípios dos estados de Mato Grosso do Sul, Paraná, São Paulo e Santa Catarina em quatro safras (2011/12; 2012/13; 2013/14 e 2015/16). Para a realização das análises utilizou-se o método de estratificação GGE Biplot, este é um método biplot que faz uso das análises de componentes principais, e identifica a existência de estratos ambientais por meio da avaliação da interação genótipo x ambiente (interação GA). Deste modo, os estratos serão formados de modo que a interação seja minimizada e que as cidades que participam do mesmo estrato tenham características ambientais homogêneas. Plotou-se para cada ensaio um gráfico GGE Biplot, os quais deram origem a uma matriz de coincidência que, por sua vez, deu origem a uma rede de similaridade ambiental para cada safra. Também foram construídas, através das matrizes, redes de similaridade envolvendo três safras e outra envolvendo todas as safras. Por meio das redes foi possível identificar a formação de alguns estratos. A rede conjunta de todas as safras revelou a existência de quatro estratos, sendo o primeiro composto pelos municípios de Toledo e Palotina; o segundo pelos municípios de Cafelândia, Palotina e Mamborê; o terceiro pelos municípios de Mamborê, Palotina e Maracaju e quarto composto pelos municípios de pelos municípios de Maracaju, Naviraí e Dourados. As cidades de Bela Vista do Paraíso e Rolândia não foram alocadas em um estrato, sendo, portanto, consideradas cidades essenciais para os ensaios, uma vez que estas possuem características ambientais diferentes das demais. As cidades que compõem um mesmo estrato são consideradas redundantes, deste modo, algumas podem ser eliminadas ou substituídas, afim de que a região seja melhor representada. Concluiu-se que para esta região os nove municípios coincidentes entre as safras podem ser representados por quatro, sendo estes: Maracaju, Palotina, Rolândia e Bela Vista do Paraíso. Deste modo, cinco municípios foram eliminados, e os recursos que eram a estes investidos podem ser remanejados para a introdução mais ambientes e /ou genótipos nestes ensaios. Palavras-chave: interação GA. GGE Biplot. mega-ambinetes.
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    Diversidade genética e estrutura populacional de progênies meios irmãos e irmãos completos de maracujazeiro azedo
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-07-30) Marques Junior, Edilson; Santos, Carlos Eduardo Magalhães dos; http://lattes.cnpq.br/1510990740500832
    Nas últimas décadas, houve uma expressiva expansão dos cultivos de maracujazeiro azedo nas diversas regiões brasileiras. Entretanto, a produtividade média dos cultivos é considerada baixa, frente ao potencial de produção da cultura. Fatores, como falta de cultivares adaptados a diversas regiões de produção, e alta incidência de pragas e doenças, são os limitantes para aumento da produtividade da cultura. Pesquisas visando superar estes entraves, principalmente de melhoramento genético, que visam o lançamento de cultivares superiores estão sendo desenvolvidas. O sucesso desses programas está intrinsicamente ligado ao conhecimento da estrutura e diversidade genética das populações trabalhadas e, dessa forma, permitem ao melhorista traçar eficientes estratégias de seleção para obtenção de maiores ganhos. Objetivou- se com este trabalho estudar e comparar a estrutura e a diversidade genética de progênies de meios irmãos e irmãos completos de Passiflora edulis Sims, comumente utilizadas no melhoramento da cultura. Duas progênies híbridas de irmãos completos (PHA e PHB) foram obtidas por cruzamento controlado de genitores contrastantes e uma progênie de meios irmãos foi obtida a partir de polinização aberta (PPA). Um total de 36 genótipos de cada progênie de irmãos completos e 45 genótipos da progênie de meios irmãos, juntamente com seus genitores foram analisados com marcadores SSR. A estrutura genética das populações foi verificada por meio de meio de uma abordagem bayesiana no Software Structure, e da AMOVA de Excoffier. A diversidade genética das progênies foi estudada por meio de agrupamentos hierárquicos gerados a partir da matriz de distância do índice de diversidade de Nei. Ao comparar as três progênies, maior proporção da diversidade genética é encontrada dentro das progênies. Comparando as progênies aos pares, maior diversidade é também encontrada dentro das progênies, inclusive ao comparar a progênie de meios irmãos com as progênies de irmãos completos. A estruturação das progênies pela abordagem bayesiana, estruturou as três progênies em duas progênies hipotéticas geneticamente, em que PHA e PPA apresentaram estrutura genética distinta entre si. A progênie PHB apresentou uma estrutura genética intermediária entre PHA e PPA, possivelmente pela relação de parentesco com essas duas progênies. Ao estudar a diversidade genética, observou-se que as progênies de irmãos completos apresentaram maior grau de diversidade genética, do que a progênie de meios irmãos. Quando comparadas as progênies híbridas entre si, não se observou um padrão de distribuição dos indivíduos relacionados as suas progênies, onde praticamente todos os grupos formados era constituído de indivíduos de ambas as progênies, possivelmente pela relação de parentesco. Entretanto, a progênie de meios irmãos tende a se caracterizar em relação às progênies híbridas no agrupamento, possivelmente pela menor proporção de alelos comuns com estas progênies, visto que é formada pela contribuição genética de mais de um genitor masculino. Por outro lado, esta progênie apresenta menor índice de diversidade genética entre seus indivíduos, possivelmente pela ocorrência de cruzamentos correlacionados na formação da progênie, o que pode causar implicações em estratégias de melhoramento de maracujazeiro azedo.
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    Caracterização de uma região genômica do híbrido de timor CIFC 832/2 associada à resistência à Hemileia vastatrix
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-07-31) Alves, Danúbia Rodrigues; Caixeta, Eveline Teixeira; http://lattes.cnpq.br/4920273401747338
    A ferrugem do cafeeiro, causada pelo fungo biotrófico Hemileia vastatrix é a principal doença de importância econômica dessa cultura, sendo responsável por grandes prejuízos à cafeicultura mundial. Novas raças do patógeno têm surgido infectando cultivares de café comercializados como resistentes a essa doença. Desse modo, devido ao alto potencial adaptativo do fungo, a busca por cafeeiros resistentes a essa doença é uma atividade recorrente nos programas de melhoramento. Estudos com o Híbrido de Timor (HdT), tem sido realizados em pesquisas que visam resistência durável à ferrugem e outras doenças do cafeeiro. Compreender a natureza da resistência duradoura em genótipos do HdT e descrever os genes envolvidos na defesa das plantas é fundamental para o uso eficiente dos recursos disponíveis nesse híbrido natural. A utilização de ferramentas moleculares e de bioinformática tem mostrado resultados significativos para a ampliação do conhecimento dos genes envolvidos no patossistema Coffea - H. vastatrix. Desse modo, objetivou-se com esse estudo sequenciar e caracterizar, por meio de análises de bioinformática, uma região do genoma do Híbrido de Timor CIFC 832/2, que contém marcadores associados à resistência à H. vastatrix. Para isso foi realizado o sequenciamento do clone BAC 70-22F contendo a marca funcional de resistência, por meio da Plataforma Illumina MiSeq (paired – end reads). Posteriormente foi feita a montagem dos contigs e a predição dos genes. Realizou-se a anotação gênica com base nos genomas de Coffea arabica, Coffea canephora e Coffea eugenioides, utilizando a ferramenta BLAST. A anotação gênica revelou a presença de genes candidatos relacionados ao mecanismo de resistência de hospedeiros contra patógenos. Foram anotados 991 genes do clone BAC 70-22F. Desses genes, 340 foram anotados com similaridade com o genoma de C. arabica (var. Caturra), 337 com o genoma de C. eugenioides e 314 com o genoma de C. canephora (clone IF 200). Com base na anotação gênica foram selecionadas duas sequências de genes candidatos a receptores like kinases (RLK) e desenhados primers para estudo do perfil de expressão gênica durante a interação Coffea - H. vastatrix. Um possível gene de resistência, LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2, foi descrito e apresentou um perfil de expressão correspondente a uma resposta de resistência pré-haustorial. O outro possível receptor like kinase em estudo, apresentando um domínio LRR, exibiu uma diminuição na expressão gênica pré-haustorial em genótipos incompatíveis. As análises filogenéticas desses genes, bem como os estudos de identidade e similaridade genética da região genômica clonada, demonstraram uma relação mais próxima entre o clone BAC 70-22F e a espécie C. arabica e corroboram com a diversidade genética descrita para o HdT. Os resultados sugerem que a região genômica clonada do HdT CIFC 832/2 possui importantes genes candidatos a resistência do cafeeiro à H. vastatrix e apresentam informações relevantes para ampliar o conhecimento sobre o HdT, podendo contribuir para futuros planejamentos de estratégias de melhoramento do cafeeiro.
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    Validação de marcadores moleculares SNP para alto conteúdo de proteína em grãos de soja [Glycine max (L.) Merr.]
    (Universidade Federal de Viçosa, 2019-02-22) Bernardeli, Arthur Martins Almeida; Oliveira, Aluizio Borem de; http://lattes.cnpq.br/0208140000693434
    O objetivo deste estudo foi estimar o efeito de marcadores moleculares SNP sobre o fenótipo (𝑟 2 ), determinar a herdabilidade dos conteúdos de proteína e óleo em grãos de soja e o coeficiente de correlação entre estes dois caracteres, e identificar as progênies superiores via seleção assistida e fenotipagem. Para isto, 271 RILs derivadas de F5 foram testadas em ensaios de campo em Capinópolis e Viçosa, em 2017, genotipadas, e fenotipadas para conteúdos de proteína e óleo via NIR. Os genótipos apresentaram diferenças significativas entre si e ao longo dos ambientes testados, sendo que os resultados de Capinópolis foram maiores para conteúdo de proteína das RILs (47,845 %) e os de Viçosa para o conteúdo de óleo das testemunhas (23,291 %). As herdabilidades foram maiores para a análise conjunta dos dados que para a análise 2 individual, em que ℎ 𝑝𝑟𝑜𝑡𝑒í𝑛𝑎 = 79,490 % e 72,810 %, e ℎ ó𝑙𝑒𝑜 = 84,190 % e 79,520 %, 2 para Capinópolis e Viçosa, respectivamente; e ℎ 𝑝𝑟𝑜𝑡𝑒í𝑛𝑎 = 88,230 % e ℎ ó𝑙𝑒𝑜 = 91,050 %, para análise conjunta. Os coeficientes de Correlação de Pearson para dados fenotípicos foram de 𝑟 𝐶𝑎𝑝𝑖𝑛. = -0,664 e 𝑟 𝑉𝑖ç𝑜𝑠𝑎 = -0,587. Dos marcadores moleculares avaliados, ss56, ss62, ss115 e ss190 associaram para o conteúdo de proteína em Capinópolis; e ss56, ss62 e ss190 para este mesmo caráter em Viçosa. Os marcadores ss62, ss115 e ss190 associaram para o conteúdo de óleo em ambas as localidades. O marcador ss190 destacou-se ao apresentar 𝑟 2 entre 25-29 % para ambos os conteúdos nas duas localidades. Efeito pleiotrópico de todos os marcadores foi observado, exceto para ss56, em que seu uso na seleção assistida promove o aumento do conteúdo de proteína e não onera o de óleo. Em termos práticos, as progênies superiores para alta proteína foram as que reuniram todos ou a maioria dos alelos favoráveis. As progênies 61-9, 78-38, 84-13 e 84-33 foram superiores para o conteúdo de proteína e em desempenho de campo, além de reunirem alelos favoráveis identificados via seleção assistida das marcas associadas neste estudo, justificando seu uso no programa de melhoramento.