Teses e Dissertações
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Teses e dissertações defendidas no contexto dos programas de pós graduação da Instituição.
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Item Avaliação da endogamia em um programa de melhoramento de codornas de corte(Universidade Federal de Viçosa, 2009-02-13) Sousa, Mariele Freitas; Barreto, Sérgio Luiz de Toledo; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4796216J5; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/6460268982239010; Silva, Martinho de Almeida e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783587T3; Braccini Neto, José; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4721855E6Foram utilizados dois grupos genéticos de codornas da subespécie Coturnix coturnix coturnix, totalizando 17985 aves, sendo 8746 da linhagem UFV1 e 9239 da linhagem UFV2, pertencentes ao Programa de Melhoramento de Codornas da Universidade Federal de Viçosa, com o objetivo de avaliar o efeito da endogamia nas características peso corporal das aves aos 28 e 42 dias de idade e produção de ovos. Utilizou-se o programa computacional MTDFNRM ("Multiple Trait Derivative Free Numerator Relationship Matrix"), componente do sistema MTDFREML (Boldman ET AL., 1995) para transformação dos registros dos animais em códigos numéricos, de modo que o número do animal sempre fosse maior que o número dos pais, e obter o coeficiente de endogamia das aves. O arquivo de pedigree completo foi utilizado para análise da estrutura genética da população, executada pelo programa ENDOG v. 4.5 (Gutiérrez E Goyache, 2008). O Grupo Genético UFV 1 apresentou um F médio de 0,54%, coeficiente de relação médio de 1,27% e 0,25% de incremento de endogamia. Do total de animais, 30,85% são endogâmicos, com um F médio de 1,73%, variando de 0,1% a 26,6 %. O tamanho efetivo encontrado foi de 200,38. O Grupo Genético UFV 2 apresentou um F médio de 0,76%, coeficiente de relação médio de 1,83% e 0,30% de incremento de endogamia. Do total de animais, 45,54% são endogâmicos, com um F médio de 1,67%, variando de 0,1% e 25,8 %. O tamanho efetivo encontradofoi de 164,42. A endogamia não influenciou nenhuma das características estudadas (peso corporal aos 28 e 42 dias e produção de ovos). O Grupo Genético UFV 2 apresentou menor tamanho efetivo, maior incremento de endogamia , menor número efetivo de fundadores e de ancestrais do que o UFV 1, requerendo maior controle nos acasalamentos das codornas selecionadas para reprodução.Item Avaliação do crescimento de codornas de corte utilizando modelos de regressão aleatória(Universidade Federal de Viçosa, 2008-02-21) Bonafé, Cristina Moreira; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/2678310373676450; Silva, Martinho de Almeida e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783587T3; Sarmento, José Lindenberg Rocha; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761815E8Os dados utilizados neste estudo são provenientes de 26835 e 27447 observações, de 3909 e 4040 codornas de corte das linhagens UFV-1 e UFV-2, respectivamente, pertencentes ao Programa de Melhoramento Genético de Aves da Universidade Federal de Viçosa. A característica peso corporal foi avaliada nas duas linhagens, aos 1, 7, 14, 21, 28, 35 e 42 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória. A modelagem da variância residual foi avaliada primeiramente por meio de classes de idades, agrupadas como se seguem: CL1: homogênea; CL2: 1 e 7-42 dias; CL3: 1, 7 e 14-42 dias; CL4: 1, 7, 14 e 21-42 dias; CL5: 1, 7, 14, 21 e 28-42 dias; CL6: 1, 7, 14, 21, 28 e 35-42 dias; CL7: 1, 7, 14, 21, 28, 35 e 42 dias de idade e, posteriormente, as ordens de ajuste das funções polinomiais de Legendre, aplicadas aos modelos de regressão aleatória, foram gradualmente aumentadas (ordens variando de 3 a 6), visando determinar a ordem mínima de cada efeito aleatório, necessária para descrever as estruturas de (co)variâncias em função do tempo. Comparando as modelagens do resíduo por meio de classes, observaram-se aumentos no Loge L, significativos (P<0,01) pelo teste da razão de verossimilhança (LRT), com o aumento do número de classes heterogêneas (CL7). De acordo com todos os critérios utilizados para avaliar a qualidade de ajuste, o modelo considerando homogeneidade (CL1) de variâncias residuais mostrou-se inadequado, assim como o modelo de análise unicaracterística (UNI). As estimavas de variâncias, herdabilidades e correlações foram influenciadas pela modelagem da variância residual e pelo ajuste da função polinomial. A utilização de uma função polinomial de Legendre com as ordens 6 para efeito genético aditivo direto e 5 para efeito permanente de animal, para a linhagem UFV-1 e 6 para ambos efeitos aleatórios para a linhagem UFV-2, devem ser utilizados na avaliação genética da curva de crescimento dessas codornas. Portanto, a utilização de heterogeneidade de variância residual e a ordem de ajuste adequada a cada efeito aleatório para modelar as variâncias associadas à curva de crescimento de codornas de corte se fazem necessárias.Item Avaliação genética e estudo do crescimento de matrizes de codorna de corte utilizando modelos de regressão aleatória(Universidade Federal de Viçosa, 2009-12-14) Teixeira, Rafael Bastos; Barreto, Sérgio Luiz de Toledo; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4796216J5; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://lattes.cnpq.br/0466647140925507; Souza, Gustavo Henrique de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4760298P6; Silva, Martinho de Almeida e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783587T3Foram avaliados dados de dois grupos genéticos de matrizes de codorna de corte. O primeiro, composto das informações dos 1026 animais do grupo genético UFV1 e, o segundo, por 1110 codornas do grupo genético UFV2. As características utilizadas na análise foram: peso da ave (P0, P7, P14, P21, P28, P35, P42, P77, P112 e P147), peso médio do ovo (POM1, POM2, POM3 e POM4), peso médio da casca (PCM1, PCM2, PCM3 e PCM4), peso médio da gema (PGM1, PGM2, PGM3 e PGM4), peso médio do albúmen (PAM1, PAM2, PAM3 e PAM4), gravidade específica média do ovo (DM1, DM2, DM3 e DM4), largura média do ovo (LOM1, LOM2, LOM3 e LOM4), comprimento médio do ovo (COM1, COM2, COM3 e COM4), número de ovos (N1, N2, N3 e N4) e idade ao primeiro ovo (IDPO). Foram realizadas análises estatísticas de variância e teste de médias (teste Fischer a 5% de probabilidade) e, para estimar os componentes de variância, foram realizadas análises unicaracterísticas. Utilizou-se a metodologia de componentes principais para definir as variáveis de maior importância nas populações estudadas. Também foram realizadas análises bicaracterísticas para estimação das covariâncias e correlações genéticas das características selecionadas pela técnica de componentes principais. A linhagem UFV2 mostrou-se superior em relação à linhagem UFV1 para as características estudadas. As estimativas de herdabilidade das características estudadas do grupo genético UFV1 foram POM1(0,27), POM2(0,30), POM3(0,54), POM4(0,43), PGM1(0,13), PGM2(0,21), PGM3(0,21), PGM4(0,26), PCM1(0,41), PCM2(0,46), PCM3(0,38), PCM4(0,47), PAM1(0,38), PAM2(0,42), PAM3(0,54), PAM4(0,54), DM1(0,31), DM2(0,15), DM3(0,36), DM4(0,31), IDPO(0,16) e TXT(0,10). As estimativas de herdabilidade das características selecionadas no grupo genético UFV2 foram POM1(0,17), POM2(0,36), POM3(0,55), POM4(0,40), PGM1(0,18), PGM2(0,30), PGM3(0,37), PGM4(0,33), PCM1(0,21), PCM2(0,33), PCM3(0,46), PCM4(0,49), PAM1(0,25), PAM2(0,29), PAM3(0,55), PAM4(0,35), DM1(0,18), DM2(0,16), DM3(0,44), DM4(0,22), IDPO(0,10) e TXT(0,03). A análise de componentes principais indicou como importantes para a linhagem UFV1 as variáveis P7, P14, P77, P147, LOM4, COM2, PGM1, PGM2 e IDPO. De um total de 31 características mensuradas, 9 foram responsáveis por 81,85% da variância total. A análise de componentes principais indicou como importantes para a linhagem UFV2 as variáveis P7, P35, P147, COM1, COM2, COM3, PCM3, PAM4 e TXT. De um total de 30 características mensuradas, 9 foram responsáveis por 79,91% da variância total. Foram testadas duas possíveis modelagens de variância residual heterogênea, sendo agrupadas em 3 classes de idade: CL3: 1-7-14, 21-28-35 dias e 42-77-112-147 dias e 5 classes de idade: CL5: 1-7, 14-21, 28-35, 42-77 e 112-147 dias de idade. Após a escolha da variância residual a ser utilizada na análise, foi realizado o estudo do modelo de regressão aleatória que se melhor aplica-se a curva de crescimento das matrizes. A comparação entre os modelos foi feita pelo Critério de Informação de Akaike (AIC), Critério de Informação Bayesiano de Schwarz (BIC), Logaritimo da função de verossimilhança (Loge L) e teste da razão de verossimilhança (LRT), ao nível de 1% de probabilidade. O modelo que considerou a heterogeneidade de variância residual com 3 classes mostrou-se adequado à linhagem UFV1 e o modelo com 5 classes mostrou-se adequado à linhagem UFV2. A utilização de uma função polinomial de Legendre, com as ordens 5, para efeito genético aditivo direto e 5, para efeito permanente de animal, para a linhagem UFV1, e de ordens 3, para efeito genético aditivo direto e 5, para efeito permanente de animal para a linhagem UFV2, devem ser utilizados na avaliação genética da curva de crescimento de matrizes de codornas de corte em estudo.Item Modelos de regressão aleatória para avaliação genética da curva de crescimento de ovinos da raça Santa Inês(Universidade Federal de Viçosa, 2007-06-22) Sarmento, José Lindenberg Rocha; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4761815E8; Albuquerque, Lúcia Galvão de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787272P9; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8Utilizaram-se 17.767 registros de pesos de 4.210 cordeiros da raça Santa Inês, pertencentes à Empresa Estadual de Pesquisa Agropecuária da Paraíba (EMEPA-PB) e Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA Caprinos e EMBRAPA Tabuleiros Costeiros), com os objetivos de avaliar diferentes modelos de regressão aleatória para estimar componentes de (co)variância e predizer valores genéticos para a curva de crescimento, visando avaliar a importância da inclusão do efeito materno no modelo de análise (genético e ambiente permanente), determinar a modelagem mais adequada para a trajetória média de crescimento, ajustar diferentes estruturas para modelar a variância residual e comparar funções de diferentes ordens para ajustar as mudanças nas variâncias dos diferentes efeitos aleatórios considerados na análise. As regressões fixas e aleatórias foram ajustadas por meio de polinômios de Legendre de diferentes ordens, em análises unicaracterísticas, com auxílio do programa DXMRR. Observou-se melhoria no ajuste do modelo aos dados com a inclusão do efeito materno (genético ou ambiente permanente), evidenciando sua importância. A herdabilidade direta foi inflacionada pelo efeito materno, quando este não foi considerado no modelo de análise. O efeito de ambiente permanente materno contribuiu para a variância materna e inflacionou a herdabilidade materna, quando não incluído no modelo. Uma função polinomial cúbica para ajustar a curva média de crescimento estimou valores mais próximos das médias observadas, quando comparado a ordens inferiores e superiores, principalmente ao final da curva. As herdabilidades diretas estimadas considerando ajuste linear foram superiores às estimadas com a função cúbica. As mudanças no ordenamento dos animais, com base nos valores genéticos preditos empregando ajuste de linear a cúbico, foram pequenas; porém, a diferença na magnitude dos valores genéticos preditos foi maior. O modelo considerando homogeneidade de variâncias residuais mostrou-se inadequado. O ajuste de funções de variâncias com qualquer ordem foi melhor que o obtido por meio de classes, sendo que o polinômio ordinário de ordem seis proporcionou melhor ajuste dentre as estruturas testadas. A modelagem do resíduo interferiu nas estimativas das variâncias de animal (genética e ambiente permanente) e na classificação dos reprodutores com base nos valores genéticos preditos. Uma função contínua com as ordens três, três, cinco e três, respectivamente, para os efeitos genéticos aditivos direto e materno e o ambiente permanente de animal e da mãe, foi suficiente para descrever as mudanças nas variâncias relacionadas à curva de crescimento dos ovinos Santa Inês. As herdabilidades diretas estimadas do nascimento aos 56 dias de idade foram inferiores à materna, refletindo a maior contribuição da mãe sobre o fenótipo da cria nesta fase do crescimento. A partir desta idade, a herdabilidade direta passou a ser superior até o final do período de crescimento estudado. Um modelo de regressão aleatória empregando uma função cúbica para a curva fixa, uma função de variância de ordem seis para o resíduo e funções com as ordens três, três, cinco e três, respectivamente, para os efeitos genéticos direto e materno e ambiente permanente do animal e da mãe, permitiram descrever eficientemente as variâncias e covariâncias relacionadas à curva de crescimento dos ovinos Santa Inês estudados.Item Seleção genética simultânea de famílias endogâmicas e topcrosses em culturas anuais via BLUP multivariado(Universidade Federal de Viçosa, 2010-10-21) Almeida, Ramon Vinicius de; Resende, Marcos Deon Vilela de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4709374E4; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2; Viana, José Marcelo Soriano; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4786170D5; http://lattes.cnpq.br/3867512564062809; Cruz, Cosme Damião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6; Santos, Nerilson Terra; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782537A2A metodologia BLUP, que é amplamente utilizada na avaliação genética animal e florestal também pode ser aplicada no melhoramento de culturas anuais. O objetivo deste estudo foi comparar a acurácia e a eficiência da seleção de famílias endogâmicas e topcrosses, em diferentes populações de milho pipoca, através da utilização do BLUP multivariado contemplando esses dois tipos de família, BLUP univariado e seleção fenotípica. Dados de capacidade de expansão e produção, oriundos de famílias S3 e seus respectivos topcrosses, em populações de milho-pipoca (Beija-Flor e Viçosa), foram analisados. Os testes de progênies foram avaliados em blocos incompletos nos diferentes ambientes. O método BLUP multivariado apresentou maior acurácia e eficiência de seleção quando comparado as outras metodologias. A eficiência de seleção do BLUP multivariado foi dependente da diferença entre as correlações genéticas e ambientais das características. Os ganhos genéticos preditos são superiores quando se utiliza informações das famílias endogâmicas e topcrosses simultaneamente.