Navegando por Autor "Sousa, Maíra Paula de"
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Item Ammonium removal from high-salinity oilfield-produced water: assessing the microbial community dynamics at increasing salt concentrations(Appl Microbiol Biotechnol, 2016-11-04) Quartaroli, Larissa; Silva, Lívia C. Fidélis; Silva, Claudio Mudadu; Lima, Helena Santiago; Paula, Sergio Oliveira de; Oliveira, Valéria Maia de; Silva, Marliane de Cássia S. da; Kasuya, Maria Catarina M.; Sousa, Maíra Paula de; Torres, Ana Paula R.; Souza, Rodrigo Suhett; Bassin, João Paulo; Silva, Cynthia Canêdo daWater generated during oil exploration is chemically complex and contains high concentrations of ammonium and, in some cases, high salinity. The most common way to remove ammonium from effluent is a biological process, which can be performed by different routes and different groups of microorganisms. However, the presence of salts in the effluents could be an inhibiting factor for biological processes, interfering directly with treatment. This study aimed to evaluate changes in the profile of a microbial community involved in the process of ammonium removal when subjected to a gradual increase of salt (NaCl), in which the complete inhibition of the ammonium removal process occurred at 125 g L−1 NaCl. During the sludge acclimatization process, samples were collected and submitted to denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and massive sequencing of the 16S ribosomal RNA (rRNA) genes. As the salt concentration increased in the reactor, a change in the microbial community was observed by the DGGE band profiles. As a result, there was a reduction in the presence of bacterial populations, and an increase in archaeal populations was found. The sequencing data suggested that ammonium removal in the reactor was carried out by different metabolic routes by autotrophic nitrifying bacteria, such as Nitrosococcus, Nitrosomonas, Nitrosovibrio, Nitrospira, and Nitrococcus; ammonium-oxidizing archaea Candidatus nitrosoarchaeum; ANAMMOX microorganisms, such as Candidatus brocadia, Candidatus kuenenia, and Candidatus scalindua; and microorganisms with the potential to be heterotrophic nitrifying, such as Paracoccus spp., Pseudomonas spp., Bacillus spp., Marinobacter sp., and Alcaligenes spp.Item Avaliação da tecnologia de bacteriófagos em sistemas de fluxo dinâmico (loopings) para controle de biofilmes e bactérias redutoras de sulfato na indústria do petróleo(Universidade Federal de Viçosa, 2023-02-07) Sousa, Maíra Paula de; Paula, Sérgio Oliveira de; http://lattes.cnpq.br/7452116967390776A aplicação da tecnologia de bacteriófagos na indústria do petróleo tem sido considerada uma alternativa promissora para o controle de contaminações microbianas associadas à biocorrosão e à geração biogênica de sulfeto de hidrogênio (H2S). Essas contaminações estão presentes ao longo de toda a cadeia produtiva do petróleo, representando riscos ocupacionais e operacionais. Seu controle se dá principalmente pela aplicação de biocidas que, em geral, apresentam um baixo poder de penetração em biofilmes e, portanto, são pouco eficazes. Isso ocorre devido às substâncias extracelulares produzidas pelos microrganismos, que funcionam como uma barreira de proteção. Nesse contexto, os bacteriófagos podem conferir vantagens sobre os biocidas, uma vez que: podem se multiplicar no ambiente, possibilitando a redução da dosagem; possuem enzimas capazes de romper a matriz dos biofilmes, conferindo poder de penetração e maior eficácia; e, podem apresentar menores impactos ocupacionais, operacionais e ambientais. O presente trabalho teve como objetivos: (i ) avaliar em sistemas de fluxo dinâmico (Loopings) o efeito de coquetéis fágicos sobre biofilmes enriquecidos com bactérias redutoras de sulfato (BRS), representativos de tanques de plataformas de petróleo; e, (i i ) avaliar um coquetel fágico pré-selecionado quanto a potenciais impactos ambientais e operacionais. Os resultados obtidos demonstraram que os fagos avaliados possuem ação sobre esses biofilmes, com redução de cerca de 80% do H2S gerado e indicaram efeito na desaceleração do processo de corrosão e de formação de pits. Além disso, o coquetel fágico pré-selecionado, apresenta características vantajosas em comparação aos biocidas, tanto do ponto de vista ambiental (menor ecotoxicidade e maior biodegradabilidade), quanto operacional (menor corrosividade e menor impacto sobre o processo de nitrificação do sistema de tratamento biológico de água de produção). Palavras-chave: Biocorrosão. Corrosão Influenciada por Microrganismos. Acidulação Biogênica. Bactérias Redutoras de Sulfato. Sulfeto de Hidrogênio. H2S. Bacteriófagos.Item Desulfovibrio alaskensis prophages and their possible involvement in the horizontal transfer of genes by outer membrane vesicles(Gene, 2019-06) Crispim, Josicelli Souza; Dias, Roberto Sousa; Laguardia, Clara Nogueira; Araújo, Larissa Cristina; Silva, Jéssica Duarte da; Vidigal, Pedro Marcus Pereira; Sousa, Maíra Paula de; Silva, Cynthia Canêdo da; Santana, Mateus Ferreira; Paula, Sérgio Oliveira de; Sousa, Maíra Paula deDesulfovibrio alaskensis is a Gram-negative bacterial species that belongs to the group of Sulphate Reducing Bacteria (SRB) and presents prophages in genomes, a common characteristic of the genus Desulfovibrio. Genetic material can be transported by outer membrane vesicles, however, no data regarding the production of these vesicles has been reported for D. alaskensis. To verify the expression of D. alaskensis prophages and their involvement with outer membrane vesicles, the DSM16109 strain was used. The DSM16109 strain had three prophages and presented reduced growth after mitomycin C addition when compared to the control culture. This reduction was accompanied by the presence of virus-like particles (VLPs), indicating mitomycin C dependent prophage induction. The increase in the number of cap gene copies and transcriptions of the three prophages was verified in the control sample, however, without the formation of VLPs. Prophage genes were identified in outer membrane vesicles from cultures treated and not treated with mitomycin C. DSM16109 prophages are expressed spontaneously but only in the presence of mitomycin C was it possible to observe VLP formation. Due to the genetic material detection from the prophages within outer membrane vesicles, this property may be related to the horizontal transfer of viral genes.Item Níveis de fósforo total em dietas para alevinos de tilápia-do-nilo(Revista Brasileira de Zootecnia, 2006-07) Ribeiro, Felipe Barbosa; Lanna, Eduardo Arruda Teixeira; Bomfim, Marcos Antonio Delmondes; Donzele, Juarez Lopes; Freitas, Anderson Saraiva de; Sousa, Maíra Paula de; Quadros, MoisésObjetivando-se determinar a exigência de fósforo em dietas para alevinos de tilápia-do-nilo (Oreochromis niloticus), foram utilizados 432 alevinos com peso inicial de 0,60 ± 0,02 g, mantidos em 36 aquários de 150 L. Foi utilizado delineamento inteiramente casualizado, com seis tratamentos (0,55; 0,73; 0,94; 1,14; 1,37 e 1,59% de fósforo total), seis repetições e 12 peixes por unidade experimental. Os peixes foram alimentados com rações contendo 32% de PB e 3.000 kcal ED/kg, durante 40 dias. Verificou-se efeito quadrático dos níveis de fósforo na dieta sobre a conversão alimentar e a taxa de eficiência protéica, sendo estimados os melhores resultados com 1,10% de fósforo total. Houve efeito linear dos níveis de fósforo na dieta sobre a taxa de eficiência de retenção de P e a taxa de eficiência de P. Para as demais variáveis, não houve efeito dos níveis de fósforo da dieta. A exigência de P em dietas para alevinos de tilápia-do-nilo é de 1,10%.Item Níveis de lisina digestível em rações para alevinos de tilápia-do-nilo(Revista Brasileira de Zootecnia, 2008-11-24) Takishita, Sylvia Sanae; Lanna, Eduardo Arruda Teixeira; Donzele, Juarez Lopes; Bomfim, Marcos Antonio Delmondes; Quadros, Moisés; Sousa, Maíra Paula deAvaliaram-se níveis de lisina digestível em rações para alevinos de tilápia-do-nilo (Oreochromis niloticus), linhagem tailandesa, com base no conceito de proteína ideal. Utilizaram-se 432 alevinos com peso inicial de 0,98 ± 0,03 g, distribuídos em delineamento inteiramente casualizado, com 6 tratamentos, 6 repetições e 12 peixes por unidade experimental. Os tratamentos constaram de seis rações isoenergéticas (3.000 kcal de ED/kg de ração) e isoproteicas (39,14% de PB) contendo 1,50; 1,66; 1,82; 1,98; 2,14 ou 2,30% de lisina digestível. Foram avaliados o consumo de ração, o consumo de lisina digestível, o ganho de peso, a taxa de crescimento específico, a taxa de sobrevivência, a conversão alimentar, as taxas de deposição diária de proteína e gordura corporais, a composição química corporal (teores de umidade, proteína e gordura corporais) e a eficiência de retenção de nitrogênio. O consumo de lisina digestível, a conversão alimentar, a porcentagem de proteína corporal e a deposição de proteína corporal melhoraram de forma linear de acordo com o nível de lisina digestível. O modelo Linear Response Plateau foi o de melhor ajuste para consumo de ração, ganho de peso, taxa de crescimento específico e eficiência de retenção de nitrogênio e estimou em 2,06; 2,17; 2,14 e 2,12%, respectivamente, os níveis de lisina digestível para melhorar cada um desses parâmetros. A exigência de lisina digestível e total em rações para alevinos de tilápia-do-nilo é, respectivamente, de 2,17% (0,723%/Mcal de energia digestível) e de 2,32% (0,773%/Mcal de energia digestível) para atender às principais características de desempenho e de carcaça utilizando-se o conceito de proteína ideal na formulação das rações.Item Níveis de lisina, com base no conceito de proteína ideal, em rações para alevinos de tilápia-do-nilo(Revista Brasileira de Zootecnia, 2009-02-12) Bomfim, Marcos Antonio Delmondes; Lanna, Eduardo Arruda Teixeira; Donzele, Juarez Lopes; Quadros, Moisés; Ribeiro, Felipe Barbosa; Sousa, Maíra Paula deAvaliaram-se os efeitos dos níveis de lisina digestível da ração, com base no conceito de proteína ideal, no desempenho de alevinos de de tilápia-do-nilo (Oreochromis niloticus). Utilizaram-se 432 alevinos revertidos, linhagem tailandesa, com peso inicial de 1,12 ± 0,02 g, em delineamento inteiramente ao acaso, composto de 6 dietas, 6 repetições e 12 peixes por unidade experimental. Como tratamentos, avaliaram-se uma dieta basal com 29,12% de proteína bruta e 3.000 kcal de energia digestível/kg, suplementada com aminoácidos sintéticos, resultando em dietas com 0,95; 1,10; 1,25; 1,40; 1,55 e 1,70% de lisina digestível e relações mínimas entre metionina + cistina, treonina, triptofano, isoleucina e arginina com a lisina (66, 77, 23, 64 e 85%, respectivamente), com base em valores digestíveis. Os peixes foram mantidos em aquários de 130 litros, dotados de abastecimento de água, temperatura controlada e aeração individual, e alimentados à vontade em seis refeições diárias durante 30 dias. Avaliaram-se os parâmetros de desempenho, a composição corporal, a deposição de proteína e gordura corporais e a eficiência de retenção de nitrogênio dos peixes. A elevação do teor de lisina digestível na ração não influenciou a taxa de sobrevivência e o teor de gordura corporal dos peixes, mas melhorou de forma linear todos os demais parâmetros avaliados, com exceção da eficiência de utilização de lisina e a umidade corporal, que pioraram de forma quadrática e linear, respectivamente. O nível de 1,80% de lisina total (0,600% Mcal de ED) e o de 1,70% de lisina digestível (0,567% Mcal de ED) proporcionam os melhores resultados de desempenho e características de carcaça de alevinos de tilápia-do-nilo quando se utiliza o conceito de proteína ideal na formulação das rações experimentais.Item Organismos planctônicos de sistemas de lagoas de tratamento de esgotos sanitários como alimento natural na criação de tilápia do Nilo(Universidade Federal de Viçosa, 2007-03-02) Sousa, Maíra Paula de; Bastos, Rafael Kopschitz Xavier; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781284H6; Brustolini, Paulo César; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783304U3; Lanna, Eduardo Arruda Teixeira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788116T3; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4774909Y2; Euclydes, Rosane Maria de Aguiar; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4786094T9; Okano, Walter Yoshizo; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4794558U8Uma das alternativas para o reúso de água é a utilização de efluentes sanitários tratados para o abastecimento de tanques de piscicultura. Em sistemas integrados de lagoas de estabilização/polimento e piscicultura, as lagoas promovem a produção de alimento natural (plâncton) para os peixes, e os tanques de piscicultura podem contribuir com a melhoria de qualidade da água descartada, minimizando o processo de eutrofização nos corpos d´água receptores. O conhecimento dos parâmetros físicos e químicos e da composição da comunidade planctônica nestes sistemas torna-se relevante para a prática da piscicultura, uma vez que, para a viabilidade de produção, é necessário determinar não só a quantidade, mas também a qualidade do alimento, bem como avaliar o aproveitamento do alimento natural pelas espécies de peixes de interesse de criação. Neste trabalho, um sistema integrado de lagoas de polimento e tanques de piscicultura em escala piloto foi avaliado com os objetivos de (i) identificar e quantificar os principais grupos de organismos fito e zooplanctônicos encontrados em efluentes sanitários tratados em lagoas de polimento e utilizados em tanques de criação de peixes; (ii) identificar quais desses organismos são ingeridos, digeridos (total ou parcialmente), ou não digeridos, por indivíduos da espécie Oreochromis niloticus (Tilápia do Nilo) de diferentes tamanhos; e (iii) avaliar a qualidade da água descartada como efluente final, após sua utilização em tanques de piscicultura. Concluiu-se que, a maior parte dos organismos fito e zooplanctônicos encontrados nos efluentes utilizados é consumida e aproveitada como fonte de alimento natural pelas tilápias; e que, o sistema de piscicultura contíguo às lagoas de polimento, atua como uma etapa de tratamento, contribuindo com a melhoria da qualidade da água descartada como efluente final.Item Screening and characterization of prophages in Desulfovibrio genomes(Scientific Reports, 2018) Crispim, Josicelli Souza; Dias, Roberto Sousa; Vidigal, Pedro Marcus Pereira; Sousa, Maíra Paula de; Silva, Cynthia Canêdo da; Santana, Mateus Ferreira; Paula, Sérgio Oliveira deBacteria of the genus Desulfovibrio belong to the group of Sulphate Reducing Bacteria (SRB). SRB generate significant liabilities in the petroleum industry, mainly due to their ability to microbiologically induce corrosion, biofilm formation and H2S production. Bacteriophages are an alternative control method for SRB, whose information for this group of bacteria however, is scarce. The present study developed a workflow for the identification of complete prophages in Desulfovibrio. Poly-lysogenesis was shown to be common in Desulfovibrio. In the 47 genomes analyzed 53 complete prophages were identified. These were classified within the order Caudovirales, with 69.82% belonging to the Myoviridade family. More than half the prophages identified have genes coding for lysozyme or holin. Four of the analyzed bacterial genomes present prophages with identity above 50% in the same strain, whose comparative analysis demonstrated the existence of colinearity between the sequences. Of the 17 closed bacterial genomes analyzed, 6 have the CRISPR-Cas system classified as inactive. The identification of bacterial poly-lysogeny, the proximity between the complete prophages and the possible inactivity of the CRISPR-Cas in closed bacterial genomes analyzed allowed the choice of poly-lysogenic strains with prophages belonging to the Myoviridae family for the isolation of prophages and testing of related strains for subsequent studies.