Survey and pathogenicity of gummosis associated oomycetes isolates and sensitivity of Alternaria isolates to fungicides from southeastern Minas Gerais

Abstract

Diseases such as gummosis, mainly associated with Phytophthora species, and Alternaria Brown Spot (ABS), caused by Alternaria spp., holds a threat against the development of the orchards. Despite their importance, information regarding pathogen diversity, aggressiveness and fungicide sensitivity remains limited in the ‘Zona da Mata’ region. Therefore, this study aimed to perform a molecular characterization and assess the aggressiveness of oomycetes isolates associated with gummosis in mandarin orchards from the ‘Zona da Mata’ region, Minas Gerais, Brazil, as well to assess the sensitivity of Alternaria spp. isolates to QoI and DMI fungicides. Oomycetes isolates were obtained from rhizosphere soil of symptomatic plants and evaluated for pathogenicity on ‘Ponkan’ mandarin fruit and ‘Rangpur’ lime seedlings. For the molecular analysis, the isolates were identified based on the mitochondrial COI region. The pathogenicity assay showed that the isolates were pathogenic, the mean value of diameter lesion was 32.13 mm on fruit and 4.54 mm on seedlings. The molecular analysis classified the isolates in different species, such as Phytophthora nicotianae, Phytopythium vexans, Phytopythium chamaehyphon and Pythium nodosum. Alternaria spp. isolates collected from mandarin orchards were evaluated for sensitivity to pyraclostrobin, azoxystrobin and difenoconazole, using spore germination and mycelial growth inhibition assays. The results showed a higher frequency of less sensitive isolates to QoI fungicides than to difenoconazole. The absolute frequency of isolates less sensitive to pyraclostrobin and azoxystrobin were 46 and 48 out of 100 isolates, respectively. To difenoconazole, 22 of 100 isolates were classified as less sensitive. Overall, this study provides a first report of Phytopythium species associated with gummosis and showed Alternaria spp. isolates with reduced sensitivity to the most common fungicides in mandarin orchards from southeastern Minas Gerais. Keywords: Alternaria spp.. Sensitivity to fungicides. Rootstock. Oomycetes.Doenças como a gomose, associada principalmente a espécies de Phytophthora, e a mancha marrom de Alternaria, causada por Alternaria spp., representam uma ameaça ao desenvolvimento dos pomares. Apesar da importância, ainda são limitadas as informações sobre diversidade de patógenos, agressividade e sensibilidade a fungicidas na região da Zona da Mata. Dessa forma, esse trabalho tem como objetivo realizar a caracterização molecular e avaliar a agressividade de isolados de oomicetos associados à gomose em pomares de tangerina da região da Zona da Mata, Minas Gerais, Brasil, bem como avaliar a sensibilidade de isolado de Alternaria spp. a fungicidas dos grupos das estrobilurinas e dos triazóis. Os isolados de oomiceto foram obtidos através de amostras de solo da rizosfera de plantas sintomáticas e avaliados quanto à patogenicidade em frutos de tangerina “Ponkan” e mudas de limão ‘Cravo’. Para análise molecular, os isolados foram identificados com base na região mitocondrial COI. O ensaio de patogenicidade demonstrou que os isolados foram patogênicos com diâmetro médio de lesão de 32.13 mm em frutos e 4.54 mm em mudas. A análise molecular classificou os isolados em diferentes espécies: Phytophthora nicotianae, Phytopythium vexans, Phytopythium chamaehyphon e Pythium nodosum. Os isolados de Alternaria spp. coletados em pomares de tangerina foram avaliados quanto à sensibilidade aos fungicidas piraclostrobina, azoxistrobina e difenoconazol, por meio de ensaios de germinação de esporos e inibição do crescimento micelial. Os resultados mostram uma frequência maior de isolados menos sensíveis às estrobilurinas do que ao difenoconazol. A frequência absoluta dos isolados com sensibilidade reduzida à piraclostrobina e à azoxistrobina foi de 46 e 48 em 100 isolados, respectivamente. Ao difenoconazol, 22 de 100 isolados foram classificados como menos sensíveis. Esse estudo fornece um primeiro relato de espécies de Phytopythium associadas à gomose e mostra isolados de Alternaria spp. com sensibilidade reduzida aos fungicidas mais comuns em pomares de tangerina do sudeste de Minas Gerais. Palavras-chave: Alternaria pp.. Sensibilidade a fungicidas. Porta-enxerto. Oomicetos.