Navegando por Autor "Malhado, Carlos Henrique Mendes"
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Item A raça Indubrasil no Nordeste brasileiro: melhoramento e estrutura populacional(Revista Brasileira de Zootecnia, 1998-12-11) Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Martins Filho, Raimundo; Carneiro, Antonio Policarpo Souza; Silva, Fabyano Fonseca e; Torres, Robledo de AlmeidaCom o intuito de fornecer subsídios para programas de melhoramento, conservação e expansão da raça Indubrasil do Nordeste brasileiro, avaliaram-se o histórico evolutivo, as estimativas de parâmetros genéticos e a estrutura populacional da raça. Foram utilizadas informações do pedigree de animais nascidos no período de 1964 a 2006 e dados dos pesos ajustados aos 205, 365 e 550 dias de idade de bovinos nascidos a partir de 1976. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram menores que as encontradas na literatura para os pesos ajustados nas três idades (P205: direta 0,11 ± 0,03 e materna 0,01 ± 0,03; P365: direta 0,16 ± 0,04 e P550: direta 0,15 ± 0,05) e os ganhos genéticos para as características decresceram no período avaliado (P205: -0,028 kg/ano; P365: -0,030 kg/ano e P550: -0,025 kg/ano). A baixa variabilidade genética e o ganho genético negativo provavelmente devem-se à redução do tamanho efetivo e ao aumento da endogamia nesse período. Além disso, a redução significativa no número de nascimentos por ano e a pouca utilização de reprodutores externos nos rebanhos colocam a raça Indubrasil do Nordeste brasileiro como um grupo genético sob risco de extinção, fato que sugere a necessidade de programas visando sua conservação e expansão.Item Análise de agrupamento na seleção de modelos de regressão não-lineares para curvas de crescimento de ovinos cruzados(Ciência Rural, 2016-04) Silveira, Fernanda Gomes da; Silva, Fabyano Fonseca e; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Muniz, Joel AugustoEste estudo teve como objetivo utilizar a análise de agrupamento para classificar modelos de regressão não-lineares usados para descrever a curva de crescimento de ovinos cruzados, tendo em vista os resultados de diferentes avaliadores de qualidade de ajuste. Para tanto, utilizaram-se dados de peso- idade dos seguintes cruzamentos entre raças de ovinos de corte: Dorper x Morada Nova, Dorper x Rabo Largo e Dorper x Santa Inês. Após a indicação do melhor modelo, objetivou-se ainda aplicar a técnica de identidade de modelos a fim de identificar o cruzamento mais produtivo. Foram ajustados doze modelos não-lineares, cuja qualidade de ajuste foi medida pelo coeficiente de determinação ajustado, critérios de informação de Akaike e Bayesiano, erro quadrático médio de predição e coeficiente de determinação de predição. A análise de agrupamento indicou o modelo Richards como o mais adequado para descrever as curvas de crescimento dos três grupos genéticos considerados, e os testes de identidade de modelos indicaram o cruzamento Dorper x Santa Inês como sendo o mais indicado para a pecuária local.Item Classificação multivariada de modelos de crescimento para grupos genéticos de ovinos de corte(Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, 2012-01) Silveira, Fernanda Gomes da; Silva, Fabyano Fonseca e; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique MendesObjetivou-se com a realização deste trabalho, principalmente, utilizar a análise de agrupamento para classificar modelos de crescimento não-lineares tendo em vista os resultados de diferentes avaliadores de qualidade de ajuste ao considerar dados dos seguintes grupos genéticos de ovinos de corte: Dorper x Morada Nova, Dorper x Rabo Largo e Dorper x Santa Inês. Após a indicação do modelo comum adequado aos três grupos, objetivou-se aplicar o teste de identidade de modelos para identificar o grupo genético com maior eficiência de crescimento. Foram realizados ajustes individuais para cada animal, consideraram-se 12 modelos não-lineares, cuja qualidade de ajuste foi medida pelo coeficiente de determinação ajustado, critério de informação de Akaike, critério de informação Bayesiano, erro quadrático médio de predição, coeficiente de determinação de predição e percentual de convergência. A análise de agrupamento permitiu indicar o modelo von Bertalanffy como o mais adequado para descrever as curvas de crescimento dos três grupos genéticos considerados. De acordo com testes de identidade de modelos, o grupo genético Dorper x Santa Inês foi o que apresentou maior peso adulto, portanto, este, o mais recomendado para exploração de carne.Item Comparação de métodos de seleção em populações simuladas de frangos de corte(Pesquisa Agropecuária Brasileira, 2005-10) Cunha, Elizângela Emídio; Oliveira, Claudine Gonçalves de; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Euclydes, Ricardo Frederico; Malhado, Carlos Henrique MendesPopulações de frangos de corte foram simuladas utilizando-se o programa GENESYS, com o objetivo de avaliar a seleção com base no método da melhor predição linear não-viesada (BLUP - best linear unbiased prediction), a seleção individual para três tamanhos efetivos de população e três sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados. Simulou-se um genoma constituído de uma característica quantitativa, com valor de herdabilidade igual a 0,30, em seleção praticada durante 15 gerações consecutivas, com 30 repetições por geração. Para um mesmo tamanho efetivo e sistema de acasalamento, o BLUP foi sempre superior à seleção individual nas 15 gerações de seleção avaliadas.Item Endogamia, fixação de alelos e limite de seleção em populações selecionadas por métodos tradicionais e associados a marcadores moleculares(Revista Brasileira de Zootecnia, 2006-10-06) Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Euclydes, Ricardo Frederico; Carneiro, Antonio Policarpo Souza; Cunha, Elizângela EmídioObjetivou-se avaliar o coeficiente de endogamia, a fixação de alelos e o limite de seleção em populações selecionadas durante 20 gerações. A seleção foi baseada nos valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP) e pelo BLUP marcadores (BLUPM) e na seleção individual (SI) utilizando diferentes sistemas de acasalamento. Para se obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados 100 marcadores moleculares do tipo microssatélite, por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclidiana média para dados quantitativos. Para comparar os diferentes métodos de seleção, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições. Observou-se maior incremento de endogamia para o BLUPM, seguido pelo BLUP e SI. Os métodos baseados no BLUP levaram a maior fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis. O BLUPM foi o método que proporcionou maior redução no limite de seleção nas 20 gerações avaliadas. Os acasalamentos dos reprodutores selecionados que excluíram o acasalamento entre irmãos resultaram em menor taxa de incremento de endogamia, menores perdas pela fixação de alelos desfavoráveis e menor redução no limite da seleção.Item Genetic improvement and population structure of the Nelore breed in Northern Brazil(Pesquisa Agropecuária Brasileira, 2010-10) Malhado, Ana Claudia Mendes; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Martins Filho, Raimundo; Bozzi, Riccardo; Ladle, Richard JamesThe objective of this work was to evaluate the population structure and the genetic and phenotypic progress of Nelore cattle in Northern Brazil. Pedigree information concerning animals born between 1942 and 2006 were analyzed. Population structure was performed using the Endog program. Out of the 140,628 animals studied, 67.7, 14.52 and 3.18% had complete pedigree record of the first, second and third parental generation, respectively. Inbreeding and average relatedness coefficients were low: 0.2 and 0.13%, respectively. However, these parameters may have been underestimated, since information on pedigree was incomplete. The effective number of founders was 370 and the genetic contribution of 10, 50 and 448 most influent ancestors explained 13.2, 28 and 50% of the genetic variability in the population, respectively. The genetic variability for growth traits and population structure demonstrates high probability of increasing productivity through selective breeding. Moreover, management strategies to reduce the currently observed age at first calving and generation intervals are important for Nelore cattle genetic improvement.Item History of registered Gyr breed in Brazilian Northeast: population structure and genetic improvement of growth traits(Ciência Rural, 2010-06) Malhado, Ana Claudia Mendes; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Martins, Jorge André Matias; Martins Filho, Raimundo; Bozzi, RiccardoThis paper provides an evaluation of the population structure, phenotype and genetic trends of registered Gyr herd cattle in northeast Brazil. The study provides important baseline information for the management, conservation and potential population expansion of this economically and culturally important cattle breed. Pedigree data were analyzed for individuals born between 1964 and 2006. Body weight values were adjusted to 205 and 365 days of age for animals born between 1978 and 2006. Phenotypic change of zebu Gyr in northeast Brazil is solely due to environmental improvement. However, there is potential for artificial selection for weight gain in young cattle. Effective population size decreased during the 1990s and the average inbreeding coefficient increased during the studied period. An increase of the effective population size of Gyr in northeast Brazil is strongly recommended, along with an increase in the management of the mating process to prevent inbreeding and to maintain the genetic variability of the breed.Item Identidade de modelos não lineares para comparar curvas de crescimento de bovinos da raça Tabapuã(Pesquisa Agropecuária Brasileira, 2014-01) Carneiro, Antonio Policarpo Souza; Muniz, Joel Augusto; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Martins- Filho, Raimundo; Silva, Fabyano Fonseca eO objetivo deste trabalho foi avaliar o uso de teste de identidade de modelos não lineares, na comparação de curvas de crescimento de bovinos da raça Tabapuã, de cinco regiões de produção do Nordeste do Brasil. Foram analisados dados de peso de 3.695 machos e 4.236 fêmeas, originários das regiões Maranhão, Gado Algodão, Mata Agreste, Sertão e Itapetinga-Valadares. Após ajuste do modelo Brody, aplicou-se o teste da razão de verossimilhança, com aproximação de qui-quadrado, para avaliar a igualdade de parâmetros de curvas de crescimento entre as regiões. O modelo reduzido, com igualdade da taxa de maturidade, com 14 parâmetros, foi o mais adequado para descrever o crescimento dos animais. As curvas de crescimento dos machos apresentaram taxas de maturidade em comum nas regiões de produção Gado Algodão e Mata Agreste, Maranhão e Itapetinga-Valadares, e Sertão. Para as fêmeas, as regiões com taxas de maturidade em comum foram: Mata Agreste e Sertão, Maranhão e Itapetinga-Valadares, e Gado Algodão. A utilização de uma única curva não é adequada para descrever o crescimento de bovinos da raça Tabapuã nas regiões estudadas.Item Inbreeding depression in Holstein cattle in Brazil(Brazilian Journal of Animal Science, 2019-09-09) Silva, Mário Henrique Magalhães Araújo da; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Kern, Elisandra Lurdes; Daltro, Darlene dos Santos; Cobuci, Jaime Araujo; Carneiro, Paulo Luiz SouzaThe objective of this study was to evaluate inbreeding depression in Holstein cows in Brazil, considering their 305-day milk production (MP), age of first calving (AFC), and calving interval (CI). The effects of inbreeding depression on the traits were determined using four regression models (linear, quadratic, exponential, and Michaelis-Menten) about the errors generated by the animal model. The linear model was significant for CI, and the quadratic model was significant for CI and AFC. The Michaelis-Menten and exponential models were significant for MP, AFC, and CI. Inbreeding depression affected MP and CI. Cows with inbreeding coefficient of 15% produced approximately 260 kg less milk than non-inbred cows. A 1% increase in the inbreeding level resulted in an unfavorable increase of CI of 1.88 days. The quadratic and exponential models showed no variations for CI with increasing inbreeding level; however, the Michaelis-Menten model showed a positive effect of inbreeding on CI. Despite of the small number of inbred Holstein cows, the inbreeding negatively affected milk production and calving intervals. Therefore, breeders should monitor their cattle inbreeding levels. The Michaelis-Menten and exponential non-linear models are best suited to fit inbreeding data of Holstein cowsItem Multivariate analysis of productive and nutritional traits and feeding behavior of sheep fed roughage-free diets(Brazilian Journal of Animal Science, 2018-10-30) Santana, Elizângela Oliveira Cardoso; Santana Júnior, Hermógenes Almeida de; Almeida, Eva Clícia de Jesus; Freitas, Tiago Brandão; Figueiredo, Cibelle Borges; Dias, Carlos Tadeu dos Santos; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique MendesThe objective of this study was to evaluate productive traits in sheep fed roughage-free diets by multivariate analysis. Forty lambs were used in this study: 20 Santa Inês animals, consisting of 10 uncastrated males and 10 females; and 20 crossbreds (½ Santa Inês × Dorper), consisting of 10 uncastrated males and 10 females, at an average age of five months. Lambs were randomly allocated into the following treatments: Santa Inês males fed once daily (SM1); Santa Inês males fed twice daily (SM2); Santa Inês females fed once daily (SF1); Santa Inês females fed twice daily (SF2); crossbred males fed once daily (CM1); crossbred males fed twice daily (CM2); crossbred females fed once daily (CF1); and crossbred females fed twice daily (CF2). In the multivariate analysis, a difference was detected between the mean values for production classes and feeding-behavior variables (Wilks, Pillai, Hotelling-Lawley, and Roy tests). Tocher’s optimization method had two groups formed: Group I, comprising treatments SM1, SM2, SF1, SF2, CF1, and CF2; and Group II, containing treatments CM1 and CM2 (crossbred males). When production and cud chews per day were evaluated, neutral detergent fiber digestibility and final weight were the performance-digestibility variables that most contributed to explaining the variation between treatments. When the feeding behavior was assessed, the time spent on other activities was the variable that most contributed. The crossbred genotype (½ Santa Inês × Dorper) and the male sex have superior performance for weight-related traits. However, when these animals are confined with females, it is recommended to supply the feed only once daily, irrespective of the genetic groupItem Oscilação genética em populações submetidas a métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares(Revista Brasileira de Zootecnia, 2005-08-11) Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Euclydes, Ricardo Frederico; Torres, Robledo de Almeida; Lopes, Paulo Sávio; Carneiro, Antonio Policarpo Souza; Cunha, Elizângela EmídioCom o objetivo de avaliar o efeito da oscilação genética em populações sob seleção com diferentes tamanhos efetivos, foram simulados dados utilizando-se o programa GENESYS. A seleção foi praticada durante 20 gerações consecutivas, com base na seleção individual (SI) e nos valores genéticos preditos pelo BLUP Clássico (BLUP) e pelo BLUP Marcadores (BLUPM), com 30 repetições. A matriz de similaridade adotada no BLUP Marcadores foi obtida utilizando-se 100 marcadores moleculares do tipo microssatélite, por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclidiana média para dados quantitativos. Foram simuladas seis populações de seleção, correspondendo a dois tamanhos efetivos (18,18 e 66,66) e três sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados (reprodutores acasalados ao acaso, exclusão de irmãos completos e exclusão de irmãos completos e meio-irmãos). O parâmetro avaliado foi o valor fenotípico médio. Observou-se grande variação nos valores fenotípicos obtidos pelos métodos, em razão da oscilação genética, principalmente para a seleção baseada nos valores genéticos preditos pelo BLUP e BLUPM e para as populações com tamanho efetivo menor (18,18). Os resultados sugerem que, em programas de melhoramento que utilizam pequenas populações sob seleção, os resultados podem ser influenciados pela oscilação genética, podendo apresentar grandes variações nos ganhos genéticos.Item Seleção tradicional e associada a marcadores moleculares na avaliação genética animal(Pesquisa Agropecuária Brasileira, 2006-04) Euclydes, Ricardo Frederico; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Torres, Robledo de Almeida; Lopes, Paulo Sávio; Carneiro, Antonio Policarpo Souza; Cunha, Elizângela EmídioO objetivo deste trabalho foi comparar a seleção, utilizando valores genéticos preditos pelo BLUP clássico (BLUP), BLUP marcadores (BLUPM) e pela seleção individual (SI), usando simulação com o programa Genesys. Para obter a matriz de similaridade genética utilizada no BLUPM, foram simulados cem marcadores moleculares do tipo microssatélite (SSR – Simple Sequence Repeat), por meio de um coeficiente de similaridade correspondente à distância euclideana média para dados quantitativos. A fim de comparar os diferentes métodos, utilizaram-se populações com tamanho efetivo de 66,66 e média de 30 repetições, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Os ganhos ao longo das 20 gerações de seleção foram maiores para o BLUP em relação ao BLUPM, e este foi superior à SI. Quanto ao ganho obtido nas cinco primeiras gerações, o BLUPM apresentou ganhos semelhantes ao BLUP e superiores à SI. Diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados não revelaram diferenças em ganho genético nos métodos baseados no BLUP.Item Traditional and alternative nonlinear models for estimating the growth of Morada Nova sheep(Revista Brasileira de Zootecnia, 2013-04-24) Souza, Laaina de Andrade; Carneiro, Paulo Luiz Souza; Malhado, Carlos Henrique Mendes; Silva, Fabyano Fonseca e; Silveira, Fernanda Gomes daIn the present study, alternative and traditional nonlinear models to describe growth curves of Morada Nova sheep reared in the state of Bahia, Brazil, were applied. The nonlinear models were: Schnute, Mitscherlich, Gompertz, Logistic, Meloun I Meloun II, III Meloun, Gamito and Meloun IV. The model adjustment was evaluated by using: Adjusted Coefficient of Determination (R2aj), Akaike Information Criterion (AIC), Bayesian Information Criterion (BIC), Mean Squared Error of Prediction (MEP) and Coefficient of Determination of Prediction (R2p). The selection of the best model was based on cluster analysis, using the evaluators as variables. Six out of the nine tested models converged, while Meloun I and Meloun IV were equally effective in explaining animal growth, without significant influence of sex or type of parturition over the curve parameters. The models Meloun I and IV have the best adjustment and reveal a remarkable reduction of weight gain after 150 days of age, which indicates special attention should be given to feeding at this stage.