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    Ajuste de modelos de platô de resposta para a exigência de zinco em frangos de corte
    (Ciência e Agrotecnologia, 2007-03) Rezende, Douglas Messias Lamounier Camargos; Muniz, Joel Augusto; Ferreira, Daniel Furtado; Silva, Fabyano Fonseca e; Aquino, Luiz Henrique de
    Com este trabalho, objetivou-se estudar a técnica platô de resposta utilizando modelos de regressão segmentada para avaliar sua aplicação no estudo da exigência de Zn em frango de corte. Foram utilizados os dados de uma pesquisa com frangos de corte envolvendo um experimento fatorial 2 x 2 x 9, dois experimentos, dois sexos e nove doses de zinco na ração, considerando 8 repetições. As doses de Zn estudados foram: 0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 ppm . A variável avaliada foi o teor de Zn na tíbia em ppm. Foram utilizadas rotinas no procedimento não-linear (PROC NLIN do SAS®) para estimação dos parâmetros, utilizando-se as médias da variável resposta nas diversas doses. Dois modelos não-lineares (MNLE1 e MNLE2) e o Modelo Polinomial Quadrático (MPQ), ambos com platô, foram comparados. Os três modelos foram estatisticamente equivalentes, contudo o modelo MNLE1 mostrou-se mais adequado devido a sua maior facilidade de interpretação dos parâmetros.
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    Abordagem Bayesiana das curvas de crescimento de duas cultivares de feijoeiro
    (Ciência Rural, 2008-09) Martins Filho, Sebastião; Silva, Fabyano Fonseca e; Carneiro, Antonio Policarpo Souza; Muniz, Joel Augusto
    Neste trabalho foi utilizada a metodologia Bayesiana para ajustar o modelo não-linear logístico para dados de crescimento de duas cultivares de feijoeiro, “Neguinho” e “Carioca”. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente casualizado, com vinte repetições, no esquema de parcelas subdivididas, sendo que os tratamentos principais foram constituídos pelas cultivares e as subparcelas foram constituídas por 17 períodos de avaliações, do plantio até aos 85 dias. A metodologia permitiu comparar as curvas de crescimentos sem utilizar a teoria assintótica e estes resultados mostraram um maior incremento em altura para a cultivar “Carioca”.
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    Inferência Bayesiana na análise genética de populações diplóides: estimação do coeficiente de endogamia e da taxa de fecundação cruzada
    (Ciência Rural, 2008-08) Reis, Ricardo Luis dos; Muniz, Joel Augusto; Silva, Fabyano Fonseca e; Sáfadi, Thelma; Aquino, Luiz Henrique de
    Neste estudo, utilizou-se a metodologia Bayesiana para estimar o coeficiente de endogamia e a taxa de fecundação cruzada de uma população diplóide por meio do modelo aleatório de COCKERHAM para freqüências alélicas. Um sistema de simulação de dados foi estruturado para validar a metodologia utilizada. O algoritmo Gibbs Sampler foi implementado no software R para obter amostras das distribuições marginais a posteriori para o coeficiente de endogamia e para a taxa de fecundação. O método Bayesiano mostrou-se eficiente na estimação dos parâmetros, pois os valores paramétricos utilizados na simulação encontravam-se dentro do intervalo de credibilidade de 95% em todos os cenários considerados. A convergência do algoritmo Gibbs Sampler foi verificada, validando assim os resultados obtidos.
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    Comparação bayesiana de modelos com uma aplicação para o equilíbrio de Hardy-Weinberg usando o coeficiente de desequilíbrio
    (Ciência Rural, 2011-04) Reis, Ricardo Luis dos; Muniz, Joel Augusto; Silva, Fabyano Fonseca e; Sáfadi, Thelma; Aquino, Luiz Henrique de
    O equilíbrio de Hardy-Weinberg é um dos principais assuntos estudados pela Genética de populações. Neste contexto, o presente trabalho aborda a análise e a comparação bayesiana de modelos utilizando o coeficiente de desequilíbrio (D A ). Para isso, realizou-se um estudo de simulação no qual as seguintes distribuições a priori foram consideradas: Dirichlet (modelo 1); beta - função degrau uniforme (modelo 2); uniforme - função degrau uniforme (modelo 3); e as prioris independentes uniformes (modelo 4). Exemplos de aplicação a dados reais de grupos raciais também são apresentados e discutidos. As amostras das distribuições marginais a posteriori para os parâmetros de interesse foram obtidas mediante o algoritmo Metropolis-Hastings, o qual foi implementado no software livre R. A convergência das cadeias geradas por este algoritmo foi monitorada pelos critérios de Geweke e Gelman & Rubin, os quais estão implementados no pacote BOA do R. Quanto às comparações entre os modelos, efetuadas por meio do fator de Bayes, observa-se que, para os dados simulados, o modelo 4 é o mais indicado para os casos de D A =0,146, D A =0,02 e D A =-0,02 com n=200; o modelo 2 é o mais indicado para D A =-0,02 e n=50 e o modelo 3 é o mais indicado para D A =-0,02 e n=1000. Para os dados reais, em cada caso analisado, nota-se uma grande diferenciação na escolha de modelos, em que apenas o modelo 1 não é recomendado.
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    Modelo logístico difásico no estudo do crescimento de fêmeas da raça Hereford
    (Ciência Rural, 2008-10) Mendes, Patrícia Neves; Muniz, Joel Augusto; Silva, Fabyano Fonseca e; Mazzini, Ana Rita de Assumpção
    Este trabalho teve como objetivo comparar modelos logísticos difásicos ponderados aplicados ao estudo de curvas de crescimento de fêmeas Hereford com três diferentes estruturas de erros: erros independentes (EI), auto-regressivos de primeira ordem (AR (1)) e auto-regressivo de segunda ordem (AR (2)) a dados de peso-idade de 55 fêmeas da raça Hereford avaliadas desde o nascimento até 675 dias de idade. Utilizou- se o procedimento model do software Statistical Analysis System (SAS) por meio das opções weight e %AR. A comparação entre os modelos foi realizada com base na interpretação biológica dos parâmetros e nos avaliadores de qualidade de ajuste (coeficiente de determinação ajustado, teste de Durbin- Watson, desvio padrão residual, número de iterações), além do critério de informação de Akaike (AIC) e do teste F para comparação de modelos. Os resultados obtidos para o ajuste dos modelos aos dados médios indicaram que o modelo logístico difásico AR (2) foi o mais eficiente para descrever a curva de crescimento do rebanho. Ao se considerar o conjunto de dados individuais, nenhum dos modelos abordados foi recomendado por produzirem estimativas não condizentes com a realidade.
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    Análise bayesiana para modelos de degradabilidade ruminal
    (Ciência Rural, 2009-10) Savian, Taciana Villela; Muniz, Joel Augusto; Sáfadi, Thelma; Silva, Fabyano Fonseca e
    Neste estudo, utilizou-se a metodologia bayesiana para ajustar os modelos de ORSKOV & MCDONALD (1979) e MCDONALD (1981) a conjuntos de dados simulados e a um conjunto de dados de porcentagem de degradação da fibra em detergente neutro da gramínea coastcross (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfuensis), ao longo do tempo. As amostras das distribuições marginais a posteriori dos parâmetros foram obtidas por meio dos métodos de Monte Carlo com cadeias de Markov (MCMC), especificamente, os algoritmos Amostrador de Gibbs e Metropolis-Hastings. A metodologia bayesiana mostrou-se eficiente, sendo avaliada e comprovada pelo estudo de simulação, que apresentou estimativas bem próximas ao valor paramétrico. As estimativas obtidas para os parâmetros dos modelos por meio da abordagem bayesiana mostraram-se bastante coerentes com os valores relatados na literatura. O modelo de Orskov e McDonald foi mais plausível que o modelo de McDonald na descrição dos dados de degradação.
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    Abordagem bayesiana da sensitividade de modelos para o coeficiente de endogamia
    (Ciência Rural, 2009-09) Reis, Ricardo Luis dos; Muniz, Joel Augusto; Silva, Fabyano Fonseca e; Sáfadi, Thelma; Aquino, Luiz Henrique de
    Este trabalho tem como objetivo realizar uma análise bayesiana de modelos, por meio do fator de Bayes, para o desequilíbrio de Hardy-Weinberg. Pretende-se também testar a metodologia por meio da simulação de dados e aplicá- la a um conjunto de dados reais. Na definição dos modelos, utilizaram-se as prioris Dirichlet (modelo 1), Beta - função degrau Uniforme (modelo 2), Uniforme - função degrau Uniforme (modelo 3) e as prioris independentes Uniformes (modelo 4) relacionadas aos parâmetros coeficiente de endogamia e proporção alélica. Foi implementado um algoritmo no software livre R para realizar a amostragem pelo Metropolis-Hastings das distribuições condicionais a posteriori dos parâmetros dos modelos. A convergência das cadeias foram monitoradas por meio de procedimentos implementados no pacote BOA do software livre R. As comparações entre os modelos indicaram que o mais adequado, ou seja, o que melhor descreve o fenômeno em estudo, é o modelo 1, em comparação aos demais, tanto para os dados simulados, quanto para os dados reais. Em virtude dos resultados apresentados, pode-se atestar que a abordagem Bayesiana apresentou bons resultados, ou seja, por meio das distribuições a posteriori condicionais completas, foram verificadas a confiabilidade e a precisão da metodologia na comparação dos modelos.
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    Aplicação do método Bayesiano na estimação de curva de crescimento em animais da raça nelore
    (Revista Ceres, 2007-03) Silva, Fabyano Fonseca e; Silva, Natascha Almeida Marques da; Muniz, Joel Augusto; Aquino, Luiz Henrique de; Gonçalves, Tarcísio de Moraes
    As curvas de crescimento geralmente são obtidas por meio do ajuste de funções matemáticas não-lineares, em dois estágios: inicialmente, ajustam-se curvas individuais e, posteriormente, identificam-se efeitos ambientais e genéticos sobre os parâmetros dessas curvas. Porém, este tipo de análise estatística promove perdas de informações por não considerar diretamente esses efeitos no processo de obtenção das curvas. Dessa forma, o método bayesiano constitui solução viável por permitir a realização de uma análise conjunta desses dois estágios. Esse método foi utilizado para ajustar o modelo de Gompertz a dados de peso-idade de gado Nelore. As distribuições marginais a posteriori dos parâmetros “a”(peso na maturidade), R (matriz de covariância residual), β (vetor de efeitos fixos) e 2 σ e (variância do erro) foram obtidas por meio do algoritmo Gibbs Sampler, e as dos parâmetros “b”(parâmetro de integração) e “k” (taxa de maturidade) por meio do algoritmo Metropolis-Hastings. Os efeitos ambientais considerados foram: sexo, idade da vaca no parto e estação de nascimento dos animais. Os resultados permitiram evidenciar que não houve influência de época e idade da vaca no parto sobre os parâmetros das curvas. Em relação ao sexo, os machos apresentaram maior peso adulto(a) em relação às fêmeas.