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2006 - 200912010 - 20112

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Data inicial: 1990Autor: search.filters.author.Cruz, Cosme DamiãoAssunto: search.filters.subject.Genetic mapping

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    Método para mapeamento de locos controladores de características oligogênicas
    (Ciência Rural, 2010-02) Rocha, Rodrigo Barros; Barros, Willian Silva; Muro-Abad, Júpiter Israel; Tomaz, Rafael Simões; Cruz, Cosme Damião; Barros, Everaldo Gonçalves de; Araújo, Elza Fernandes de
    Características oligogênicas de distribuição discreta e expressão governada por poucos genes de maior efeito têm se mostrado importantes na condução dos programas de melhoramento, com destaque para a resposta de resistência das plantas às doenças. Métodos tradicionais de detecção de QTL’s, que pressupõem normalidade e herança governada por múltiplos fatores, não deveriam ser utilizados para mapeamento dessas características de distribuição discreta e interação epistática predominante. O objetivo deste trabalho é avaliar os resultados de um método para mapeamento e detecção de locos controladores da expressão de características oligogênicas, OTL’s (Oligogenic Trait Loci). Esse método, definido como MMCO (Método de Mapeamento de Características Oligogênicas), utiliza funções de verossimilhança para obtenção de estimativas de ligação fatorial entre locos marcadores e locos controladores de características oligogênicas. Os resultados indicam que o método foi adequado para detecção de OTL’s em populações F2 relativamente pequenas, compostas por 200 indivíduos, e que a determinação a priori do padrão de herança é condição necessária para a utilização dessa estratégia, que se diferencia por atender as pressuposições de análise, não necessitar de informação prévia de ordenamento entre as marcas e por permitir a obtenção de estimativas a partir da informação contida em todas as classes genotípicas.
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    Detection and mapping of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population
    (Pesquisa Agropecuária Brasileira, 2011-09-13) Rosado, Tatiana Barbosa; Tomaz, Rafael Simões; Rocha, Rodrigo Barros; Rosado, Antônio Marcos; Alves, Alexandre Alonso; Araújo, Elza Fernandes de; Alfenas, Acelino Couto; Cruz, Cosme Damião
    The objective of this work was to verify the existence of a lethal locus in a eucalyptus hybrid population, and to quantify the segregation distortion in the linkage group 3 of the Eucalyptus genome. A E. grandis x E. urophylla hybrid population, which segregates for rust resistance, was genotyped with 19 microsatellite markers belonging to linkage group 3 of the Eucalyptus genome. To quantify the segregation distortion, maximum likelihood (ML) models, specific to outbreeding populations, were used. These models consider the observed marker genotypes and the lethal locus viability as parameters. The ML solutions were obtained using the expectation‑maximization algorithm. A lethal locus in the linkage group 3 was verified and mapped, with high confidence, between the microssatellites EMBRA 189 e EMBRA 122. This lethal locus causes an intense gametic selection from the male side. Its map position is 25 cM from the locus which controls the rust resistance in this population.
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    Mapping of QTLs related with wood quality and developmental characteristics in hybrids (Eucalyptus grandis x Eucalyptus urophylla)
    (Revista Árvore, 2006-09-13) Rocha, Rodrigo Barros; Barros, Everaldo Gonçalves; Cruz, Cosme Damião; Rosado, Antônio Marcos; Araújo, Elza Fernandes de
    The present work aimed to characterize and identify QTLs for wood quality and growth traits in E. grandis x E. urophylla hybrids. For this purpose a RAPD linkage map was developed for the hybrids (LOD=3 and r=0.40) containing 52 markers and 12 linkage groups. Traits related to wood quality and growth were evaluated in the QTL analyses. QTL analyses were performed using chi-square tests, single-marker, interval mapping and composite interval mapping analyses. All approaches led to the identification of similar QTLs associated with wood density, cellulose pulp yield and percentage of extractives, which were detected and confirmed by both the interval mapping and composite interval mapping methodologies. Some QTLs regions were confirmed only by the composite interval mapping methodology: percentage of soluble lignin, percentage of insoluble lignin, CBH and total height. Overlapping QTLs regions were detected, and these, can be the result of major genes involved in the regulation and control of the growth traits by epistatic interactions. In order to evaluate the effect of early selection using RAPD molecular data, molecular markers adjacent to QTLs were used genotype selection. The analysis of selection differential values suggests that for all the traits the phenotypic selection at seven years should generate larger genetic gains than early selection assisted by molecular markers and the combination of the strategies should elevate the selection efficiency.