Estatística Aplicada e Biometria

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    Análise de estilo baseada em retornos: um estudo aplicado aos fundos de previdência complementar oferecidos pelo instituto Agros
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-11-04) Prates, Carlos Victor Bragatto; Barbosa, Eduardo Campana; http://lattes.cnpq.br/4525845624417719
    A introdução do Plano Real, em 1994, promoveu uma profunda mudança no cenário econômico nacional, bem como na postura do cidadão brasileiro, no que se refere a gestão do seu patrimônio pessoal e a escolha de estratégias e instrumentos financeiros, que permitam uma administração eficiente do mesmo. Nesse sentido, uma categoria de investimento que vem se destacando é a dos planos de previdência privada, uma importante alternativa para auxiliar o brasileiro no planejamento e no acúmulo de recursos para o futuro. Logo, o objetivo deste trabalho é aplicar a metodologia da Análise de Estilo Baseada em Retornos ou RBSA (do inglês, Return Based Style Analysis), para avaliar as estratégias de investimento ou de alocação de recursos e os retornos de dois planos previdenciários (B e CD) oferecidos pelo Agros, um Instituto da UFV de Seguridade Social, que oferece e administra planos de previdência privada e de saúde, com o intuito de suplementar os benefícios pagos pela previdência social aos servidores e ex-servidores da Universidade Federal de Viçosa (UFV). A referida metodologia utiliza um modelo de regressão linear múltipla, que através da imposição de algumas restrições paramétricas, busca estimar o percentual de alocação de um fundo a determinadas classes de ativos, descritas à priori nos documentos regulatórios do mesmo. Palavras-chave: Economia. Gestão. Investimentos. Restrições paramétricas. Regressão linear múltipla.
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    Painéis de marcadores de baixa densidade para a predição genômica de Coffea arábica L.
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-07-22) Arcanjo, Edilaine Silva; Nascimento, Ana Carolina Campana; http://lattes.cnpq.br/2563424950732312
    Os processos de melhoramento genético são primordiais para o desenvolvimento de novas cultivares. Em decorrência da importância da cafeicultura brasileira, esse setor tem sofrido transformações através das pesquisas em programas de melhoramento. Os progressos do Coffea arábica atingidos pelo melhoramento genético têm propiciado a aquisição e recomendação de inúmeras cultivares que possuem características que a elas foram adicionadas por essa técnica. Entretanto, um dos maiores impasses do melhoramento genético vegetal é que para a obtenção de uma nova cultivar, o processo é muitas vezes lento e demorado. Dessa forma, o uso da biotecnologia, com a utilização dos marcadores moleculares, apresentou-se como uma alternativa para amenizar esse problema. Neste contexto, foi proposto a seleção genômica ampla (Genome Wide Selection-GWS), que parte do pressuposto que todos os segmentos do genoma colaboram para a variação genética e cada segmento está em alto desequilíbrio de ligação (LD) com no mínimo um marcador genético conhecido. A GWS fundamenta-se nos marcadores moleculares do tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphism), que são abundantemente distribuídos ao longo do DNA. Com o advento dos SNPs, os valores genéticos genômicos estimados (GEBVs) puderam ser calculados através dos efeitos desses marcadores. Desse modo, os SNPs têm proporcionado a melhor cobertura do genoma; no entanto, normalmente a execução da seleção genômica requer uma grande genotipagem populacional para os indivíduos de treinamento e os candidatos à seleção, o que pode ocasionar em um aumento do custo total do programa de melhoramento. Assim, este trabalho teve por objetivo avaliar a viabilidade do uso de painéis de marcadores de baixa densidade na predição do GEBV de características economicamente importantes de C. arábica, com a finalidade de reduzir os custos de genotipagem a partir da utilização de chips customizados. Os resultados obtidos neste estudo demonstraram que o uso desses painéis na GWS pode ser uma ferramenta útil para o melhoramento dessa espécie, uma vez que modelos baseados nestes painéis apresentaram boas estimativas de capacidades preditivas e substanciais valores de concordância em termos de seleção quando comparados à modelos de maior densidade de marcadores. Palavras-chave: Melhoramento Genético. Café. Seleção Genômica. G-BLUP.
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    Análise Geoestatística e multivariada para definição de zonas de manejo de cana-de- açúcar (Saccharum officinarum) na Guatemala
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-06-28) Hernández, Marianna Mendoza; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://lattes.cnpq.br/7003527687447257
    As zonas de manejo (ZM) são delimitações de subáreas com características comuns. Dentro da mesma ZM, o potencial de produção pode ser semelhante, ao passo que pode diferir entre as diversas ZM. Estudos recentes em agricultura de precisão consideram eficiente o uso de ZM para a aplicação de fertilizantes baseada na variabilidade espacial dos atributos do solo. Diante disso, os objetivos deste trabalho foram analisar a variabilidade espacial dos atributos físico- químicos do solo em lavoura de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum), por meio de Geoestatística e delinear zonas de manejo homogêneas usando análise Geoestatística e multivariada. Foram analisados dados de uma área de produção de cana-de-açúcar de 1.516,33 ha, localizada na fazenda Tehuantepec, no município de Santa Lucía Cotzumalguapa, Escuintla, Guatemala. Foram utilizados 17 atributos físico-químicos, obtidos da amostragem do solo de 153 pontos georreferenciados da área de estudo, na safra 2019-2020. Foram eles: potencial hidrogeniônico, fósforo, cobre, zinco, ferro, manganês, boro, matéria orgânica, capacidade de troca catiônica, cálcio, magnésio, sódio, potássio, saturação de bases, argila, silte e areia. A determinação da dependência espacial de cada variável foi analisada pela análise variográfica, considerando para seu ajuste as variáveis que não apresentaram efeito pepita puro. Os modelos esférico e exponencial foram ajustados aos variogramas experimentais usando o método dos mínimos quadrados. Para avaliar a qualidade do ajuste do modelo teórico dos variogramas, utilizou-se o processo de validação cruzada e, para delimitar as zonas de manejo, foi utilizado o algoritmo fuzzy K-means. A análise de componentes principais (ACP) foi aplicada aos valores preditos dos atributos do solo, obtidos pela técnica de interpolação krigagem como método de entrada de dados para o algoritmo fuzzy K-means. O número de ZM foi definido com os critérios do coeficiente de partição difusa (FPC) e entropia de partição normalizada (NCE). A área estudada apresentou variabilidade espacial para 16 dos 17 atributos de solo. Foram delineadas duas zonas de manejo para a cultura da cana-de-açúcar. Palavras-chave: Agricultura de precisão. Atributos físico-químicos do solo. Componentes principais. Krigagem. Variabilidade espacial. Fuzzy K-means.
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    Análise da detecção e da influência de outliers na avaliação da acurácia posicional de produtos cartográficos
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-08-27) Cristo, Sabrina Lourdes Pereira de; Santos, Nerilson Terra; http://lattes.cnpq.br/4426790564356034
    Outliers são dados que se diferem do conjunto de dados ao qual pertence e podem ser identificados aplicando métodos próprios para esta finalidade. A detecção de candidatos a outliers é objeto de interesse de várias áreas, dentre elas o controle de qualidade cartográfica, que tem por objetivo avaliar a qualidade de um produto cartográfico e assegurar para qual finalidade o produto cartográfico pode ser utilizado. Um dos elementos do controle de qualidade cartográfica é a acurácia posicional, que mede a qualidade da posição geográfica de dados geoespaciais. A análise da qualidade da posicional deve ser avaliada em termos de precisão e tendência. A precisão é feita seguindo as recomendações do Decreto 89.817, ET- ADGV e ET-CQDG, enquanto para a tendência podem ser utilizados testes inferenciais, como o Teste t de Student, e a estatística espacial, usando a média direcional e a variância circular. A presença de outliers pode comprometer tanto a precisão quanto a tendência e apesar da importância da detecção de candidatos a outliers, essa etapa não é bem definida nas normas, que não a tratam como obrigatória. Dessa forma, objetivou-se analisar o impacto da detecção de candidatos a outliers na avaliação da acurácia posicional e avaliar o desempenho de diferentes métodos de detecção de candidatos a outliers. Para isso, foram avaliados cinco produtos cartográficos quanto a sua acurácia posicional de duas formas, a primeira sem realizar a etapa de detecção de candidatos a outliers, fazendo a análise de precisão e tendência, e a segunda maneira acrescentando a detecção de candidatos a outliers, aplicando sete métodos para cada base de dados, sendo eles: Método 3σ, Diagrama Box-Plot, Método Standard Deviation, Método Hampel, Teste de Dixon, Teste de Grubbs e Teste de Chauvenet. Com isso, notou-se que a presença de pontos outliers afeta a qualidade do produto cartográfico e que após sua remoção, a classificação dos dados quanto à acurácia posicional tem uma melhoria. Palavras-chave: Outliers. Controle de Qualidade Cartográfica. Acurácia Posicional.
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    Desempenho de testes de homogeneidade de variâncias em diferentes cenários simulados
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-06-30) Menezes, Gleynner Ghiotto Lima; Santos, Nerilson Terra; http://lattes.cnpq.br/4019897827963986
    A confiabilidade nos resultados obtidos a partir dos testes de hipóteses estão sujeitos ao atendimento de pressuposições, o qual, quando pelo menos uma delas não é satisfeita, seu desempenho ou nível de confiança pode estar comprometido, levando a conclusões errôneas. Deste modo, existem diversos testes na literatura que foram propostos a fim de verificar a suposição de homogeneidade de variâncias em análises estatísticas, sendo esta tomada por diversos autores como o fator de maior influência sobre a sensibilidade dos resultados. No entanto, não existe um consenso sobre o melhor cenário de aplicação para cada um deles. Neste trabalho, pretende-se comparar os testes de homogeneidade de variâncias paramétricos de Bartlett, Levene, Brown- Forsythe, Cochran e Hartley, e os testes não paramétricos de Fligner- Killeen, Conover e Mood, através de um estudo de simulação utilizando o software R, onde, serão realizadas comparações segundo um Delineamento Inteiramente Casualisado sobre os seguintes aspectos de avaliação: proporção de heterogeneidade, proporção de desbalanceamento e diferentes distribuições de probabilidades. A hipótese de homocedasticidade foi adotada para analisar a taxa empírica do erro tipo I (𝛼̂) e, a de heterocedasticidade, para analisar a taxa empírica do poder do teste (𝜋̂). Diante disso, foi observado que, sob distribuição normal, o teste paramétrico de Bartlett obtém o melhor controle da taxa empírica do erro tipo I e obtém alto poder nos cenários balanceados e desbalanceados. Quando os conjuntos de dados são provenientes de populações não normais, o teste paramétrico de Brown- Forsythe foi o mais indicado. Dentre os testes não paramétricos, o teste de Mood foi o mais indicado para atuar sobre as três distribuições de probabilidades avaliadas. Palavras-chave: Heterocedasticidade. Robustez. Poder.
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    Métodos aplicados aos estudos de associação genômica via regiões cromossômicas considerando efeitos aditivos e de dominância
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-03-01) Lima, Leísa Pires; Azevedo, Camila Ferreira; http://lattes.cnpq.br/1919088712911346
    Os avanços na biologia molecular e as inovações nas tecnologias de sequenciamento e de genotipagem permitiram o desenvolvimento de novos marcadores moleculares favorecendo os estudos de associação genômica ampla (Genome Wide Association Studies - GWAS). A análise via marcas únicas se destaca como o principal procedimento para estudar a associação entre marcas e QTL (Quantitative Trait Loci), porém metodologias que consideraram grupos de marcadores para flanquear regiões genômicas vem elucidando importantes resultados para estudos de associação. Várias abordagens estatísticas veem sendo propostas no âmbito da GWAS, no entanto, estudos comparativos revelam que os métodos bayesianos são superiores em termos do poder em detectar marcadores com associações significativas. Entre os critérios existentes de seleção de regiões se destacam, a seleção pela porcentagem da variância explicada por regiões genômicas (%var), o critério de seleção de tagSNPs (tagSNPs) e a seleção com base na probabilidade a posteriori da associação de regiões genômicas (WPPA - Window Posterior Probability of Association). Para também detectar regiões potencialmente associadas, foi proposto o critério baseado na probabilidade a posteriori do intervalo (Posterior Probability of Interval - 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 ) que visa selecionar regiões com base nos marcadores de maiores efeitos estimados via método bayesiano, neste estudo o BayesD𝜋. Além disso, uma metodologia alternativa, denominada mapeamento de herdabilidades regionais (Regional Heritability Mapping - RHM) vem apresentando importantes resultados. Dessa forma, o primeiro capítulo deste trabalho consiste em uma revisão de literatura sobre a GWAS apresentando sua definição e importância no melhoramento genético e abordando detalhes teóricos acerca dos critérios citados acima. Já o capítulo 2 visa propor a medida 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 e compará-la às demais abordagens, tagSNP, %var, WPPA conjuntamente ao BayesD𝜋 e metodologia de marcas únicas, quanto a eficiência em selecionar e identificar marcadores ou regiões associados a QTL. Para isso, utilizou-se dados simulados considerando seis cenários diferentes, sendo os SNPs alocados em regiões genômicas não sobrepostas. Os resultados do segundo capítulo indicaram que para características com herança oligogênica, o critério WPPA seguido dos critérios %var e 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 se mostraram superiores, apresentando maiores valores de poder de detecção, capturando maiores porcentagens de variância genética e maiores áreas. Para características com herança poligênica, os critérios 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 e WPPA foram considerados superiores aos demais. Ademais, o capítulo 3 avalia os critérios, 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 e WPPA, que se mostraram superiores no capítulo 2 junto aos métodos de análise via marcas únicas e o RHM. No entanto, a eficiência em termos de poder de detecção e de falsos positivos destes métodos foi avaliada considerando ou não a inclusão dos efeitos de dominância nos modelos estatísticos. Para isso, foram utilizados dados simulados em dezoito cenários com diferentes níveis de herdabilidade, arquitetura genética e grau médio de dominância. Os resultados indicaram que para os efeitos aditivos considerando características com arquitetura genética oligogênica, os critérios WPPA, RHM e 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 se mostraram superiores para todos os graus de dominância analisados. Já para características com herança poligênica, os critérios 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 e WPPA podem ser considerados superiores aos demais. Considerando apenas os efeitos devido à dominância, os critérios WPPA, RHM, análise via marcas únicas e 𝑃𝑃 𝑖𝑛𝑡 apresentaram resultados relevantes com relação as medidas de eficiência para as características controladas por 3 QTL. Palavras-chave: Regiões Genômicas. Marcadores Moleculares. Métodos Bayesianos. Variância Genética.
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    Análise de fatores aplicada a predição genômica considerando seleção de marcadores em Oryza sativa
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-02-19) Fialho, Izabela Clara; Azevedo, Camila Ferreira; http://lattes.cnpq.br/1414652656084772
    O arroz asiático Oryza sativa é um dos alimentos mais consumidos em grande parte do mundo. Assim, o crescimento populacional justifica o interesse dos pesquisadores em tornar as variedades deste arroz altamente produtivas. Para alcançar esse objetivo, a Seleção Genômica Ampla (Genome Wide Selection - GWS) é uma ferramenta utilizada pelos programas de melhoramento. A GWS emprega dados fenotípicos e genotípicos por meio de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) amplamente distribuídos no genoma. Porém, nem todos estes SNPs estão associados as características de relevância para o pesquisador, o que torna necessário o uso de métodos estatísticos para a seleção de marcadores. O BLUP genômico (Genomic best linear unbiased prediction – G-BLUP) é um método amplamente aplicado a predição genômica, e quando este está associado a seleção de marcadores dá origem ao chamado G-BLUP supervisionado. Dessa forma, o presente trabalho objetivou-se avaliar a eficiência na predição genômica ao combinar a análise de fatores e a seleção de marcadores via G-BLUP supervisionado para grupos de características de interesse. O conjunto de dados de arroz utilizado é público e faz parte de dois projetos, o Projeto OryzaSNP e o Projeto OMAP e está disponível no site http://ricediversity.org/data/. O arquivo contém informações de 28 características fenotípicas e 36.901 marcadores SNPs de 413 indivíduos. Os resultados obtidos indicam que a aplicação da análise de fatores combinada à seleção de marcadores SNPs para a predição genômica se mostrou eficiente, visto que apresentaram valores semelhantes para capacidade preditiva em relação aos encontrados considerando as análises individuais das variáveis (em ambas as análises obteve-se variação entre 0,6 a 0,8 de capacidade preditiva) e alta concordância (acima de 50% de concordância para todos os grupos de marcadores) entre os indivíduos selecionados considerando o fator e as variáveis individuais. Palavras-chave: Arroz. Seleção genômica. G-BLUP.
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    Uso da geoestatística univariada e multivariada para análise de atributos do solo
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-02-22) Máquina, Calisto Manuel; Santos, Nerilson Terra; http://lattes.cnpq.br/5155559602294538
    A produção agrícola é uma das vias utilizadas para a melhoria da economia não só de cidadãos comuns, mas também de um país, devido à crescente procura de alimentos associada ao crescimento populacional.Assim, a aposta de grandes agricultores está na melhoria das técnicas de produção agrícola, tendo em conta não só o ganho financeiro, mas também a diminuição do impacto ambiental. A análise da variabilidade dos atributos do solo tem sido um dos focos para melhor controlar o uso dos insumos agrícolas. Contudo, poucos trabalhos focaram o efeito que a variabilidade espacial conjunta desses atributos tem no delineamento de zonas de manejo. Pelo exposto, o objetivo deste trabalho foi utilizar a geoestatística multivariada para o delineamento de zonas de manejo, considerando a variabilidade espacial conjunta de atributos que sabiamente têm efeito na produtividade de uma cultura. Foram identificados pares de atributos químicos que, por meio do algoritmo Fuzzy c-means, permitiram o mapeamento de zonas de manejo. O número ótimo de zonas de manejo de cada par de atributos, considerando três cenários diferentes, nomeadamente 100%, 75% e 50% de pontos amostrados dos atributos primários, foi determinado após a avaliação conjunta das funções Índice de Performance Fuzzy (FPI) e Entropia de Partição Modificada (MPE). O índice Kappa indicou concordância significativamente entre zonas de manejo dentro do mesmo par de atributos, o que atestou o uso da cokrigagem ordinária para o delineamento de zonas de manejo. Palavras-chave: Agricultura de precisão. Delineamento de zonas de manejo. Estatística Espacial.
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    Data-driven Cluster Analysis Method: uma nova metodologia para detecção de outliers em dados multivariados
    (Universidade Federal de Viçosa, 2021-04-20) Barbosa, Josino José; Oliveira, Fernando Luiz Pereira de; http://lattes.cnpq.br/1948800098593563
    Metodologias para identificação de outliers multivariados são de grande importância em análise estatística. Observações aberrantes podem revelar informações relevantes para variáveis sob investigação. Aplicações estatís- ticas sem uma prévia identificação de possíveis valores extremos podem apresentar resultados controversos e induzir decisões equivocadas. Além disso, em diversos contextos, os outliers são pontos de grande interesse prático e sua identificação torna-se o principal objetivo. Diante disso, esse estudo tem por objetivo propor uma nova técnica de detecção de outliers multivariados baseada em análise de agrupamentos. A técnica considera informações inerentes ao próprio banco de dados e também informações de conhecimento prévio do pesquisador acerca das populações sob investigação. A avaliação da metodologia foi conduzida através de calibração e comparação com três métodos de detecção já difundidos por meio de dados simulados. A investigação comparativa considera duas técnicas de detecção baseadas na clássica distância de Mahalanobis e uma técnica também baseada em análise de agrupamentos. As medidas de sensibilidade, especificidade e acurácia são utilizadas para aferir a qualidade dos métodos, assim como uma análise quanto ao tempo computacional necessário para a execução dos procedimentos. Além disso, os métodos foram empregados num conjunto de dados reais. A nova técnica proposta revelou uma notória superioridade em relação às demais, tanto na qualidade de detecção de outliers através dos dados simulados, quanto na adequabilidade na aplicação do conjunto de dados reais. Palavras-chave: Outliers multivariados. Simulação. Análise de agrupamentos. DDCAM.