Genética e Melhoramento

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    Variacao da densidade basica da madeira e capacidade de regeneracao entre e dentro de origens de Eucalyptus grandis W. Hill ex. Maiden
    (Universidade Federal de Viçosa, 1981) Oliveira, Raimunda Janiguassú Diaci Pinheiro de; Brune, Arno
    Com o objetivo de estimar diferentes parametros genéticos em progênies de Eucalyptus grandis W. Hill ex. Maiden, foram analisados os dados de densidade básica da madeira aos 6 meses de idade e número de brotações por planta aos 8 meses de idade, de 69 progênies distribuídas em 5 origens. O número de plantas por progênie, necessária para calcular a densidade básica das rudas, foi de 35, para um erro permissível de 2,5% da média da densidade básica da madeira é para um intervalo de confiança a 95% de probabilidade para a média populacional. Não foram detectadas diferenças entre origens ao nível de 1% de probabilidade, para o caráter densidade básica da madeira, enquanto para o caráter número de brotações por planta ocorreram diferenças signiticativas entre origens ao nível de 1% de probabilidade. Diferenças entre progênies para uma mesna origem, ao nível de 1% de probabilidade, foram detectadas para os dois caracteres em estudo, com exceção das progênies pertencentes à origem 4, que não apresentaram diferenças significativas entre sí, ao nível de 1% de probabilidade, para o caráter número de brotações por planta. Esse comportamento pode se dever ao fato de a parte amostrada, constituída por 10 matrizes, não ser representativa da população em seu local de origem, uma vez que as espécies do gênero Eucalyptus apresentam uma variabilidade natural muito grande para imímeros caracteres. As estimativas dos coeficientes de herdabilidades variaram de 0,78 a 0,92 para o caráter densidade básica da madeira e de 0,41 a 0,92 para o caráter número de brotações por planta. De uma forma geral, o controle genético é alto e pode-se esperar ganho genético através da seleção praticada dentro do ensaio. Todas as progênies das 5 origens estudadas apresentaram estimativas dos coeficientes de correlações fenotípica e ambiental, entre os caracteres densidade básica da madeira e número de brotações por planta, não significativas ao nível de 1% de probabilidade. Quanto à estimativa do coeficiente de correlação gegotípica, entre os dois caracteres estudados, as progênies tiveram comportamentos diferentes, de acordo com a origem . Nas progênies pertencentes às origens 2, 3 e 5, essas estima tivas foram de -0,0241, -0,1951 e -0,4069, respectivamente. Já para as progênies pertencentes às origens l e 4, as estimativas dos coeficientes de correlações foram elevadas, positivas e significativas ao nível de 1% de probabilidade. As correlações indicam que a seleção de mudas para alta densidade básica da madeira não afetará o número de brotações por planta nas origens 2, 3 e 5, podendo aumentar este número nas origens 1 e 4.
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    Estrutura genética e fenóis totais de populações naturais de barbatimão (Stryphnodendron adstringens)
    (Universidade Federal de Viçosa, 2007-02-14) Glasenapp, Jacqueline Siqueira; Cruz, Cosme Damião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6; Martins, Ernane Ronie; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723823P8; Casali, Vicente Wagner Dias; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783038Y4; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4737394P3; Figueiredo, Lourdes Silva de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4700880Y2
    Foram estudadas quatro populações naturais de Stryphnodendron adstringens no cerrado stricto sensu, norte de Minas Gerais, três no município de Grão Mogol e uma no município de Montes Claros. Por meio da análise de 5 locos isoenzimáticos polimórficos foram obtidas estimativas das frequências alélicas de 276 indivíduos adultos. Com base nas heterozigosidades observadas e esperadas foram estimadas as estatísticas F de Wright (1951). Foi verificado excesso de heterozigotos dentro (FIS = - 0.3866) e no conjunto das populações (FIT = - 0.3065) e, baixa divergência genética entre populações (FST = 0,0578). Conforme a medida de diferenciação genética GST de Nei (1973), cerca de 94% da variabilidade genética está contida dentro das populações e cerca de 6% são atribuídos às diferenças entre populações. Estimativas de tamanho efetivo (Ne) foram superiores ao número de indivíduos amostrados indicando adequada representatividade genética nas amostras obtidas. Apesar da aparente distinção observada por meio da técnica de agrupamento UPGMA, entre as populações de Grão Mogol e Montes Claros, com base nos resultados da Análise Heterozigosidade de Weir (1996), não há divergência genética significativa entre populações. Os valores de fluxo gênico (Nm) obtidos foram extremamente altos indicando grande potencial panmítico, o que pode explicar a baixa divergência genética entre populações e o fato da maior parte da variação total está contida dentro delas. Adicionalmente, foram quantificados os teores de fenóis totais e, verificadas médias de 18,58% nas cascas, 14,27% nos frutos e 9,35% nas folhas. De forma geral, as cascas são mais recomendadas na obtenção de matéria prima e, acredita-se que estratégias visando a conservação da diversidade genética de S. adstringens impliquem na manutenção de populações com grande número de indivíduos.
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    Ganhos preditivos e realizados em duas populações de milho após seleção recorrente intra e interpopulacional
    (Universidade Federal de Viçosa, 2006-09-18) Doná, Anderson Afonso; Carneiro, José Eustáquio de Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783648T9; Souza, Moacil Alves de; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780557T1; Miranda, Glauco Vieira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782667H6; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4771685P7; Galvão, João Carlos Cardoso; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784805H4; Pereira, Messias Gonzaga; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781675A2
    As seleções recorrentes intra (SRIA) e interpopulacionais (SRIE) são métodos de melhoramento utilizados para aumentar as médias das populações de plantas, sem reduzir drasticamente a variabilidade genética após repetidos ciclos de seleção. No entanto, a SRIE não tem sido eficiente em aumentar as médias das duas populações simultaneamente. Um método alternativo pode ser a combinação das SRIA e SRIE. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar os ganhos genéticos das populações Sinduro e Sindente, utilizando o método de melhoramento seleção recorrente intra e interpopulacional. Para isso, foram utilizadas duas populações sintéticas de milho, Sinduro e Sindentado, provenientes da Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS). A população Sinduro foi utilizada como testadora da população Sindentado (método interpopulacional) e testadora da própria população Sinduro (método intrapopulacional). Foram realizados dois ciclos de recombinação, sendo 144 progênies S1 por ciclo. Essas progênies foram cruzadas com o testador Sinduro, gerando progênies de meios-irmãos interpopulacionais Sinduro x Sindentado e intrapopulacionais Sinduro x Sinduro. As progênies foram avaliadas em cinco ambientes no primeiro ciclo e em três no segundo, em látice 12 x 12, com uma fileira por parcela e duas repetições. As características avaliadas foram altura de planta e espiga, prolificidade e peso de espiga. Foram realizadas análises de variância e co-variância e estimados, para as progênies intra e interpopulacionais, os componentes de variância genética, aditiva, ambiental e co-variância genética. Pelo método proposto, os novos componentes de variância foram definidos como sendo a variância genética dos desvios dos efeitos aditivos inter por intrapopulacionais e co-variância genética dos efeitos aditivos intrapopulacionais com os desvios dos efeitos aditivos inter por intrapopulacionais. Observou-se a existência de variabilidade genética para todas as características no primeiro ciclo e apenas para AE e AP, no segundo. A intensidade da seleção praticada no primeiro ciclo exauriu a variabilidade genética para peso de espiga e prolificidade, dificultando a continuidade do melhoramento das populações. Portanto, a continuidade do programa de melhoramento depende do aumento da variabilidade genética nas populações progenitoras.
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    Expressão diferencial de genes em células foliculares de suínos
    (Universidade Federal de Viçosa, 2007-07-13) Miranda, Cristiana Libardi; Guimarães, Marta Fonseca Martins; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4790685D6; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Guimarães, Simone Eliza Facioni; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4718446T8; Guimarães, José Domingos; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782270U6; Iguma, Lilian Tamy; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4707954P2
    Dentre as características produtivas, o número de leitões é fundamental para o sucesso na produção de suínos. A taxa de ovulação é um dos principais fatores que determinam o tamanho da leitegada. Deste modo, o estudo da expressão gênica nos folículos ovarianos, mais precisamente nas células foliculares, pode causar grande avanço no entendimento desta característica. Portanto o presente trabalho foi realizado com o objetivo de identificar a expressão diferencial dos genes STAR (Proteína esteroidogênica regulatória aguda), GATA (Proteína de ligação GATA-4), PGF2α (Prostaglandina F2α), P4R (Receptor de progesterona 4), FSHR (Receptor do hormônio folículo estimulante) e CYP19 (Citocromo aromatase P450) em células foliculares, coletadas durante a fase folicular do ciclo estral de três fêmeas suínas de alta e três de baixa prolificidade, provenientes de um tricross das raças Landrace, Large White e Pietrain, por meio da metodologia de PCR quantitativo em tempo real (qPCR). Nas fêmeas com alta prolificidade, utilizadas neste estudo, a média do número de leitões por leitegada foi 8,51 enquanto para as fêmeas com baixa prolificidade foi de 12,03. Para examinar se algum dos genes relacionados acima afetava as taxas de prolicifidade nos animais deste estudo, o RNA total do líquido folicular foi extraído e, em seguida, fez-se dois pools com o RNA total, sendo um do grupo de fêmeas com alta prolificidade e o outro do grupo com baixa prolificidade. O RNA total de cada um dos pools foi usado na confecção da primeira fita de cDNA. As reações de qPCR foram realizadas usando-se o gene β-Actina como controle endógeno. Os primers foram gerados a partir de seqüências obtidas nos bancos de ESTs de suínos. A maior diferença de expressão foi observada para o gene P4R, que foi expresso 7,73 vezes a mais nos animais com baixa prolificidade. O gene PGF2α apresentou expressão diferencial de 2,84 vezes a mais nas fêmeas hipoprolíficas. A expressão do gene STAR, que codifica para uma proteína reguladora da síntese de hormônios esteróides, foi 2,32 vezes maior nos animais com baixa prolificidade. A expressão do gene GATA foi 2,31 vezes maior nas fêmeas hipoprolíficas. Esse gene codifica para a proteína de ligação GATA-4, pertencente a um grupo de fatores de transcrição responsáveis pela expressão de vários genes e a diferenciação de diversos tipos celulares. A expressão do CYP19 leva à produção de uma enzima chave na biossíntese de estrogênio, a Citocromo aromatase P450 (P450aro), sendo que, para este gene, foi observada uma expressão relativa de 2,30 vezes a mais nas fêmeas de baixa prolificidade. O gene FSHR não atingiu o limiar de diferença de expressão, estabelecido neste estudo (1,5 vezes). A expressão dos genes STAR, GATA, PGF2α, FSHR, P4R e CYP19 nas células foliculares possibilitou a identificação de diferenças de expressão entre as fêmeas com alta e baixa prolificidade, sendo que a maior diferença de expressão para os genes estudados foi verificada nos animais de baixa prolificidade, exceto para o gene FSHR, que não foi considerado diferencialmente expresso nesse trabalho. Com vistas ao melhor entendimento dos fenótipos reprodutivos em suínos, é necessário que estudos sejam conduzifos no sentido de examinar a expressão desses e de outros genes relacionados, durante todo do ciclo reprodutivo das fêmeas, pois, a expressão de um gene depende, dentre outros fatores, do estádio do desenvolvimento do tecido e da idade do animal.
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    Análise discriminante na caracterização de novos descritores em soja [Glycine max (L.) Merrill]
    (Universidade Federal de Viçosa, 2007-03-19) Nogueira, Ana Paula Oliveira; Cruz, Cosme Damião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6; Reis, Múcio Silva; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783370J4; Sediyama, Tuneo; http://lattes.cnpq.br/4911178878735418; http://lattes.cnpq.br/0999266992389089; Carneiro, José Eustáquio de Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783648T9; Araújo, Eduardo Fontes; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4787131J6
    Este trabalho teve como objetivos avaliar novas características morfológicas de soja para fins de discriminação de cultivares; avaliar os subestádios reprodutivos para diferenciação de cultivares; e caracterizar o tipo de crescimento de cultivares de soja. Foram conduzidos quatro experimentos em condições de casa de vegetação, na Universidade Federal de Viçosa, realizados em duas épocas de semeadura no período de verão (dezembro e fevereiro) e duas épocas de semeadura no período de inverno (maio e junho). Os tratamentos foram constituídos de 16 cultivares de soja (Pelicano, Viçoja, UFV-1, UFV-16, UFV-18, Conquista, Primavera, FTAbyara, FT-Estrela, FT-Cristalina, Emgopa-316, DM-339, M-SOY 9001, MSOY 6101, IAC-Foscarin 31 e Bossier), dispostos em delineamento experimental inteiramente casualizado, com cinco repetições. Cada unidade experimental foi constituída por duas plantas, cultivadas em vaso, contendo solo com 1/3 de matéria orgânica. Os resultados indicaram ser possível distinguir as cultivares de soja pelas características comprimento do hipocótilo, comprimento do epicótilo, comprimento do pecíolo da folha unifoliolada, comprimento do pecíolo e da raque da primeira folha trifoliolada e forma da folha unifoliolada. No entanto, pela decomposição da interação de cultivares x épocas de semeadura e pelas estimativas de correlações fenotípicas verificou-se que o comprimento do hipocótilo e do epicótilo são altamente influenciados pela época de semeadura, enquanto, para as demais características esta influência tendeu a ser de menor magnitude. Pela análise discriminante, constatou-se que apenas essas características não foram suficientes para distinguir todas as cultivares e que na semeadura de inverno (maio) obteve-se melhor discriminação. Com os valores de número de dias para os estádios reprodutivos, obteve-se o período de cada subestádio (floração, formação da vagem, formação da semente e maturação) para os quais se notou que as cultivares semelhantes quanto ao ciclo vegetativo e/ou total podem ser distinguidas nos seus subestádios; sendo os períodos de formação da vagem e de maturação apresentaram coeficientes de determinação genotípico mais elevados. Com base na altura, número de nós entre os estádios R1 e R8 e na proporção da altura da planta no início do florescimento em relação à altura final, constatou-se que as cultivares estudadas apresentaram tipos de crescimento determinado, semideterminado e indeterminado. Os resultados permitiram concluir que as características avaliadas na fase vegetativa podem ser úteis para distinguir cultivares de soja, como características adicionais, quando estabelecida uma época ideal. A distinção de cultivares de soja no período de formação da semente e maturação foi mais confiável do que no período de floração e formação da vagem. Dentre as cultivares avaliadas, considerando as quatro épocas de semeadura, Viçoja e UFV-1 apresentaram tipo de crescimento determinado; UFV-16, UFV-18, M-SOY 9001, DM-339, FT-Abyara, FTEstrela, tipo semideterminado; e IAC-Foscarin-31, Emgopa-316 e Primavera, tipo indeterminado.
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    Tamanho da amostra para seleção de famílias de cana-de-açúcar
    (Universidade Federal de Viçosa, 2007-03-16) Leite, Mauro Sergio de Oliveira; Barbosa, Marcio Henrique Pereira; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782585E6; Cruz, Cosme Damião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6; Peternelli, Luiz Alexandre; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723301Z7; http://lattes.cnpq.br/9230628667809204; Silva, Derly José Henriques da; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723282Z2; Martins Filho, Sebastião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723282T5
    Qualquer que seja a forma de avaliar um experimento de famílias em cana-de-açúcar, figura a questão do número de indivíduos necessários para representar a performance destas famílias. A avaliação do tamanho da amostra ideal para representar precisa e eficientemente a média, variância e outros parâmetros em famílias é necessária e tem sido pesquisada, contribuindo para a otimização dos recursos disponíveis nos programas de melhoramento. Existe certa divergência e falta de consistência nos resultados obtidos para o tamanho de amostra ótimo em cana-de-açúcar. Dado o exposto, objetivou-se neste estudo a determinação do número mínimo de plantas que deve ser amostrado em experimentos de famílias de cana-de-açúcar, para características relacionadas à produção, que possibilite, sem perda de eficácia, a estimação de alguns parâmetros utilizados como auxílio na seleção das famílias. Para tanto, foram utilizados dados de um experimento conduzido no Centro de Melhoramento da Cana-de-Açúcar (CECA) da Universidade Federal de Viçosa, sediado no município de Oratórios MG, montado no delineamento em blocos casualizados completos composto por 18 famílias de irmãos completos de cana-de-açúcar em seis repetições e com informação individual de 20 plantas por parcela. Foi realizado um estudo de reamostragem com reposição, com posterior estimação de alguns parâmetros genéticos e fenotípicos. Também foram utilizados os métodos da Máxima Curvatura Modificado e da Intensidade de Amostragem. As estimativas do tamanho da amostra variaram de acordo com o parâmetro a ser estimado, de acordo com a variável a ser avaliada e de acordo com o método utilizado. O método da reamostragem permite uma comparação mais eficiente dos efeitos do tamanho da amostra na estimação de parâmetros genéticos e fenotípicos, o que não acontece nos Métodos da Máxima Curvatura Modificado e da Intensidade de Amostragem. Uma amostra de 16 plantas por família seria suficiente para obter estimativas fidedignas de todos os parâmetros discutidos, para todas as variáveis consideradas. Porém, sendo possível desmembrar a amostragem por característica, uma amostra de 10 plantas por família possibilitaria a estimação bastante precisa dos parâmetros para a variável Brix.
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    Avaliação de diferentes níveis de significância na identificação e caracterização de marcadores moleculares no melhoramento genômico
    (Universidade Federal de Viçosa, 2007-03-06) Jangarelli, Marcelo; Torres, Robledo de Almeida; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783366H0; Euclydes, Ricardo Frederico; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788533U6; http://lattes.cnpq.br/3839549418171209; Salaro, Ana Lúcia; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4767878T2; Cecon, Paulo Roberto; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788114T5; Carneiro, Antônio Policarpo Souza; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4799449E8
    A era genômica veio para transformar a ciência como um todo. Objetivou-se com esse trabalho avaliar diferentes níveis de significância na identificação de marcadores moleculares relacionados com características quantitativas de baixa, média e alta herdabilidade (h2) de interesse no melhoramento genético. Uma comparação entre os níveis de significância de 1%, 5%, 10% e 20% foi realizada por meio de um sistema computacional de simulação genética (Genesys), utilizado para a simulação de três genomas, onde cada qual era constituído de uma única característica de baixa, média ou alta h2, respectivamente. A partir de cada um dos genomas, simulou-se uma população base de 1000 animais (500 machos e 500 fêmeas). Em seguida, foi obtida uma população inicial para cada uma das populações base, totalizando três populações iniciais com 1000 animais cada (10 machos, 10 fêmeas/macho e 10 filhos/fêmea/macho). Após a obtenção desta população, iniciou-se o processo de avaliação dos quatro níveis de significância considerados, utilizando a seleção assistida por marcadores (MAS), onde os marcadores eram identificados por uma análise de regressão linear admitindo-se um nível mínimo de significância para a análise. Um total de quatro processos de seleção a partir da população inicial, de acordo com a significância adotada, foi conduzido por 20 gerações consecutivas, repetindo-se cada qual por 10 vezes para minimizar os efeitos da oscilação genética. A análise da diferença dos quatro níveis de significância foi realizada individualmente para cada um dos três caracteres através do ganho fenotípico médio, buscando, além de verificar a existência de distinção nos ganhos, se esta diferença também se apresenta simultaneamente nas características de baixa, média e alta herdabilidade. Para complementar e melhor esclarecer os resultados fenotípicos obtidos, outros parâmetros genéticos foram considerados, tais como o coeficiente de endogamia, o número de marcadores usados na seleção, o número de marcadores fixados, a fixação de alelos favoráveis e desfavoráveis e o limite da seleção. Os resultados observados indicaram superioridade dos níveis de significância de maior magnitude (10% e 20%) em relação aos de menores valores (1% e 5%), quanto aos ganhos fenotípicos obtidos após a seleção assistida por marcadores moleculares além de benefícios nos parâmetros genéticos (menor coeficiente endogâmico; maior número de marcadores utilizados; menor fixação de marcadores; menor porcentagem de alelos desfavoráveis fixados; e menores limites de seleção) para todas as três características, embora de forma mais expressiva para o caráter de baixa herdabilidade e menos para o de alta h2. Assim, mesmo que os níveis menores (1% e 5%) apresentem uma maior precisão na detecção de marcadores - QTLs (quantitative trait loci), eles deixam a desejar no que diz respeito às melhorias genéticas, resultando em ganhos fenotípicos e genéticos inferiores, fazendo com que a escolha de uma determinada significância estatística seja aceitável de acordo com o objetivo e a interdisciplinaridade da pesquisa em questão. É notório a relevância de associações estatísticas na identificação de marcadores ligados a QTLs e, consequentemente, na otimização de programas de melhoramento genômico.
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    Identificação de QTL nos cromossomos 10, 11 e 12 associados ao estresse calórico em bovinos
    (Universidade Federal de Viçosa, 2007-03-19) Columbiano, Virginia de Souza; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; Machado, Marco Antonio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4797231Z4; Guimarães, Simone Eliza Facioni; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782526Y2; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4774148D7; Verneque, Rui da Silva; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4789462T1; Pires, Maria de Fátima ávila; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780305A6
    O estresse calórico, especialmente nas regiões tropicais, consiste em uma importante fonte de perda econômica na pecuária, tendo efeito adverso sobre a produção de leite, produção de carne, fisiologia de produção, reprodução, mortalidade de bezerros e saúde do úbere. Estes efeitos podem ser amenizados utilizando-se a variação genética existente entre as raças de Bos taurus e Bos indicus para as características associadas à resistência ao calor e os marcadores moleculares associados a esta resistência como um auxílio nos programas de melhoramento, visando a obtenção de animais termotolerantes e, consequentemente, mais produtivos. O desenvolvimento deste trabalho buscou mapear regiões genômicas nos cromossomos 10, 11 e 12 relacionadas à resistência ao estresse calórico em uma população F2 de bovinos (Holandês x Gir). As características avaliadas foram: diferença entre a temperatura retal antes e depois da exposição ao estresse calórico (DifTR), diferença entre a temperatura da pele antes e depois da exposição ao estresse calórico (DifTPele), diferença entre a freqüência de movimentos respiratórios antes e depois da exposição ao estresse calórico (DifMR), taxa de sudação após a exposição ao estresse calórico (TxSud), densidade do pêlo (DensidPêlo), comprimento do pêlo (CompPêlo), comprimento da capa (CompCapa) e espessura de capa (EspessCapa). Todas as medidas foram tomadas no verão e no inverno e os dados foram analisados desta forma. Um total de 17 loci microssatélites foram genotipados para 480 animais, sendo 31 parentais, 73 F1 e 376 F2. O resultado das análises de associação mostrou a existência de QTL (p<0,01) para a característica CompPêlo localizado na posição 72 cM do cromossomo 10, com os dados coletados no verão. No cromossomo 11 foi encontrado um QTL sugestivo (p<0,05) para TxSud localizado a 0 cM, com os dados coletados no inverno. No cromossomo 12 foi encontrado também um QTL sugestivo (p<0,05) para a característica CompPêlo localizado a 28 cM, porém, com os dados coletados no inverno. A estratégia da varredura genômica com marcadores microssatélites se mostrou adequada para a detecção de QTL para características de tolerância ao estresse calórico. Estas regiões mapeadas precisam ser refinadas com a adição de marcadores adicionais para um melhor entendimento do efeito de cada QTL e a identificação de genes candidatos responsáveis pela variação nestas características.
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    Qualidade das informações de parentesco na avaliação genética de bovinos de corte
    (Universidade Federal de Viçosa, 2014-07-25) Junqueira, Vinícius Silva; Cardoso, Fernando Flores; http://lattes.cnpq.br/5739317705056424; Silva, Fabyano Fonseca e; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4766260Z2; Lopes, Paulo Sávio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783377H1; http://lattes.cnpq.br/4686677580216927; Silva, Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da; http://lattes.cnpq.br/6353954532527478
    O objetivo desse estudo foi verificar o reflexo da qualidade das informações de parentesco sobre as estimativas de parâmetros genéticos e acurácias das predições de valor genética Dessa forma, foi avaliada a qualidade dessas informações ao realizar correções no pedigree baseadas em marcadores do tipo SNPs. Os componentes de variância foram estimados sob enforque Bayesiano por amostragem de Gibbs. A avaliação da correta definição de parentesco foi realizada utilizando-se informações de marcadores SNPs de 3.591 indivíduos em uma população constituída de 12.668 animais. Os conflitos mendelianos entre as marcas da progênie e dos pais foram utilizados como critério de avaliação de parentesco. Dessa forma, foram realizadas 460 mudanças no pedigree, dentre os quais 54% possuíam um touro ou vaca identificado. Foi observado que, em média, novos relacionamentos genéticos foram definidos com 75 marcas em conflito, enquanto que a rejeição do parentesco foi realizada com 2.700 marcas. O uso do programa Molecular Coancestry para inferência de parentesco a partir de informações de marcadores moleculares proporcionou a definição de 2.174 novos relacionamentos de meio-irmãos. Foi possível observar que as correções de parentesco proporcionaram aumento da acurácia média dos valores genéticos preditos. O aumento na qualidade das informações de pedigree proporcionou a estimação de herdabilidade de maior magnitude (0,22 i 0,0286), sugerindo a possibilidade de seleção direta para a resistência a carrapatos. Foi utilizada uma estratégia de validação cruzada pelo método K-médias e também de forma aleatória, no qual cinco grupos de treinamento foram formados. Os resultados da validação cruzada indicam que maior qualidade nos relacionamentos do pedigree proporcionam maior valor de acurácia. O peso padronizado aos 205 dias foi utilizado para avaliar a inclusão de informações de filhos de reprodutores múltiplos (RM) e de animais oriundos de biotécnicas da reprodução (TEF). Foram avaliadas três estratégias de inclusão dessas informações: grupos genéticos (GG), método hierárquico bayesiano (HIER) e matriz da média dos numeradores dos coeficientes de parentesco (ANRM). O critério de informação da deviance (DIC) foi utilizado como avaliador da qualidade de ajuste e sugeriu que a estratégia HIER proporcionou melhor ajuste ao considerar as informações de RM. Entretanto, o método ANRM apresentou melhor ajuste ao incluir informações dos animais TEF. A inclusão das informações de animais TEF foi realizada pelo uso da informação da receptora para estimação do efeito genético materno e de ambiente permanente materno. Não foi observada diferença estatística nas estimativas de componentes de variância e de parâmetros genéticos ao considerar informações de animais TEF, porém os valores genéticos preditos apresentaram maior magnitude. As correlações de Spearman entre os valores genéticos foram de elevadas magnitudes para os animais fundadores, animais com certeza no parentesco e para os fiIhos de RM. Entretanto, o uso das informações dos animais TEF modificou de forma significativa as predições dos valores genéticos. O uso de metodologias adequadas para incluir a informação de animais com incerteza de paternidade e animais oriundos de transferência de embriões e fertilização in vitro proporcionam a predição de valores genéticos mais acurados e auxiliam em maiores taxas de ganho genético.
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    Mapeamento de QTLs para qualidade da madeira em Eucalyptus grandis x E. urophylla e ancoragem de clones BAC no mapa genético
    (Universidade Federal de Viçosa, 2006-02-17) Novaes, Evandro; Grattapaglia, Dário; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781402Y1; Cruz, Cosme Damião; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4788274A6; Brommonschenkel, Sérgio Hermínio; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780948Y4; http://lattes.cnpq.br/0568272239145336; Coelho, Alexandre Siqueira Guedes; http://lattes.cnpq.br/0840926305216925; Colodette, Jorge Luiz; http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4721443U9
    Espécies do gênero Eucalyptus são amplamente utilizadas em plantios florestais homogêneos em nosso país. Para aumentar a competitividade da eucaliptocultura nacional são necessárias ações contínuas que visem melhorar as características de nossas florestas. Uma estratégia para buscar regiões genômicas que contenham genes ou seqüências regulatórias envolvidos no controle de caracteres de interesse é o mapeamento genético. Vários grupos de pesquisa identificaram regiões genômicas associadas a caracteres de interesse em Eucalyptus via mapeamento genético. Esses trabalhos, em sua maioria, utilizaram marcadores dominantes, que dificultam o compartilhamento interexperimental dos dados fazendo com que o uso das informações de ligação marcador/característica fique restrito ao pedigree utilizado. A utilização de microssatélites, marcadores codominantes, multialélicos, altamente polimórficos, e transferíveis, permite, por outro lado, a análise comparativa de QTLs entre pedigrees e espécies do gênero. No presente trabalho foram localizados QTLs com base no mapeamento de 235 microssatélites em uma família de 188 irmãos- completos, proveniente de um cruzamento entre Eucalyptus grandis x E. urophylla. A detecção do polimorfismo dos microssatélites foi realizada via fluorescência na plataforma ABI 3100. Os indivíduos desta família foram avaliados aos três anos para altura e diâmetro das árvores, densidade da madeira via penetração do Pilodyn e mais onze caracteres relacionados à qualidade da madeira, os quais foram avaliados indiretamente por Espectrofotometria de Infravermelho Próximo (NIRS). Os marcadores foram testados individualmente quanto à ligação a QTLs através de uma análise de variância no programa GQMOL. Marcadores significativamente ligados a QTLs foram identificados para todas as características com um nível de significância de 1% para cada marca individual. Também foi realizado mapeamento de QTLs através da metodologia de intervalo composto no programa QTLCartographer. Para isso, foram construídos mapas de ligação para cada parental utilizando a estratégia de pseudo-cruzamento teste no programa MapMaker. Através dessa estratégia, foram identificados QTLs para todas as quatorze características. Muitos dos QTLs, principalmente para caracteres correlacionados, foram identificados de forma co-localizada. Para fins comparativos, também foram realizadas análises de QTLs por intervalo em mapa integrado através do método de Fulker e Cardon, que utiliza uma regressão linear onde a variável dependente é o quadrado da diferença fenotípica entre pares de irmãos e a variável independente é a proporção de alelos idênticos por descendência (IBD) nos diferentes intervalos do mapa genético. Em geral, houve concordância entre os QTLs identificados por ambas metodologias de mapeamento por intervalo. Por fim, visando contribuir para a ancoragem do mapa genético com correspondentes físicos do genoma, para 38 microssatélites mapeados foram identificados um ou mais clones de cromossomos artificiais de bactérias (BAC). Esses clones serão utilizados para a construção de um mapa físico no âmbito do Projeto Genolyptus, etapa fundamental para um possível esforço de clonagem posicional de genes que controlam características quantitativas. A utilização de clones BAC pertencentes a grupos de ligação específicos, como sondas de FISH, permitirá ainda o estabelecimento da correta numeração de grupos de ligação com base na numeração citogenética de cromossomos, informação indisponível até o momento para o gênero Eucalyptus.