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https://locus.ufv.br//handle/123456789/5365
Tipo: | Dissertação |
Título: | Use of the IRAP marker to study genetic variability in Pseudocercospora fijiensis populations |
Título(s) alternativo(s): | Use of the IRAP marker to study genetic variability in Pseudocercospora fijiensis populations |
Autor(es): | Queiroz, Casley Borges de |
Primeiro Orientador: | Queiroz, Marisa Vieira de |
Primeiro coorientador: | Araujo, Elza Fernandes de |
Segundo coorientador: | Mizubuti, Eduardo Seiti Gomide |
Primeiro avaliador: | Ribon, Andréa de Oliveira Barros |
Resumo: | Due to the lack of characterization study of genetic variability in populations of Pseudocercospora fijiensis recently introduced in Brazil, the objective of this study was to evaluate the suitability of IRAP marker for studying genetic variations between individuals, and to determine the genetic structure of the population of P. fijiensis based on fingerprinting generated by inter-retrotransposons amplified polymorphism (IRAP). A total of 22 loci were amplified and 77.3% showed a polymorphism. Cluster analysis revealed two major groups in Brazil. The observed genetic diversity (HE) was 0.22, and through molecular analysis of variance, it was determined that the greatest genetic variability occurs within populations. The Discriminant Analysis of Principal Components (DAPC) revealed no structuring related to the geographical origin of culture of the host. The IRAP-based marker system is a suitable tool for the study of genetic variability in P. fijiensis. |
Abstract: | Devido à ausência de estudo de caracterização da variabilidade genética das populações de Pseudocercospora fijiensis recentemente introduzidas no Brasil, o objetivo desse trabalho foi avaliar a adequabilidade do marcador IRAP para estudar variações genéticas entre indivíduos, bem como determinar a estrutura genética da população brasileira de P. fijiensis com base no fingerprinting gerado por amplificação de polimorfismo entre retrotransposons (IRAP). Um total de 22 locos foi amplificado, sendo 77.3 % polimórficos. A análise de agrupamento revelou dois principais grupos no Brasil. A diversidade gênica (HE) foi de 0.22 e pela análise de variância molecular verificou-se que a maior variabilidade genética está dentro das populações. A Análise Discriminante de Componente Principal (DAPC) revelou que não há nenhuma estruturação relacionada com as origens geográficas e cultiva hospedeiro. O sistema de marcador baseado em retrotransposon IRAP é ferramenta apropriada para estudar a variabilidade genética em P. fijiensis. |
Palavras-chave: | Black Sigatoka Inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) Population genetics Structure Sigatoka Negra Inter-retrotransposão polimorfismo amplificado (IRAP) Genética de populações Estrutura |
CNPq: | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADE::MICROBIOLOGIA AGRICOLA |
Idioma: | eng |
País: | BR |
Editor: | Universidade Federal de Viçosa |
Sigla da Instituição: | UFV |
Departamento: | Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse |
Citação: | QUEIROZ, Casley Borges de. Use of the IRAP marker to study genetic variability in Pseudocercospora fijiensis populations. 2013. 44 f. Dissertação (Mestrado em Associações micorrízicas; Bactérias láticas e probióticos; Biologia molecular de fungos de interesse) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2013. |
Tipo de Acesso: | Acesso Aberto |
URI: | http://locus.ufv.br/handle/123456789/5365 |
Data do documento: | 22-Mar-2013 |
Aparece nas coleções: | Microbiologia Agrícola |
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