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https://locus.ufv.br//handle/123456789/24739
Tipo: | Artigo |
Título: | Abordagem bayesiana da sensitividade de modelos para o coeficiente de endogamia |
Autor(es): | Reis, Ricardo Luis dos Muniz, Joel Augusto Silva, Fabyano Fonseca e Sáfadi, Thelma Aquino, Luiz Henrique de |
Abstract: | Este trabalho tem como objetivo realizar uma análise bayesiana de modelos, por meio do fator de Bayes, para o desequilíbrio de Hardy-Weinberg. Pretende-se também testar a metodologia por meio da simulação de dados e aplicá- la a um conjunto de dados reais. Na definição dos modelos, utilizaram-se as prioris Dirichlet (modelo 1), Beta - função degrau Uniforme (modelo 2), Uniforme - função degrau Uniforme (modelo 3) e as prioris independentes Uniformes (modelo 4) relacionadas aos parâmetros coeficiente de endogamia e proporção alélica. Foi implementado um algoritmo no software livre R para realizar a amostragem pelo Metropolis-Hastings das distribuições condicionais a posteriori dos parâmetros dos modelos. A convergência das cadeias foram monitoradas por meio de procedimentos implementados no pacote BOA do software livre R. As comparações entre os modelos indicaram que o mais adequado, ou seja, o que melhor descreve o fenômeno em estudo, é o modelo 1, em comparação aos demais, tanto para os dados simulados, quanto para os dados reais. Em virtude dos resultados apresentados, pode-se atestar que a abordagem Bayesiana apresentou bons resultados, ou seja, por meio das distribuições a posteriori condicionais completas, foram verificadas a confiabilidade e a precisão da metodologia na comparação dos modelos. The aim of this research is to perform a Bayesian characterization of the Hardy-Weinberg disequilibrium through the Bayes factor. The methodology is tested by using both simulation study and actual data. It was used the following priors for the Bayesian models: Dirichlet (model 1), beta – step uniform function (model 2), uniform – step uniform function (model 3) and independent uniforms for the inbreeding coefficients and allele frequencies (model 4). Metropolis- Hasting algorithms were implemented using the software R to simulate multiple draws from the posterior distribution. Convergence of the Metropolis-Hasting algorithms was assessed by many methods available at R package BOA. Results showed that the model 1 presents the best performance for both simulation study and actual data. The results also showed that the Bayesian approach provides models that are useful for the analysis of the Hardy-Weinberg disequilibrium and inbreeding coefficient. |
Palavras-chave: | Fator de Bayes Desequilíbrio de Hardy- Weinberg Simulação de dados Bayes factor Hardy-Weinberg disequilibrium Simulation |
Editor: | Ciência Rural |
Tipo de Acesso: | Open Access |
URI: | http://dx.doi.org/10.1590/S0103-84782009000600018 http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/24739 |
Data do documento: | Set-2009 |
Aparece nas coleções: | Artigos |
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